凱瑟琳為亨利八世生育了幾次，但隻養大一個女兒瑪麗（後來的英王瑪麗一世），其餘都早夭。情勢對她非常不利，因為亨利認為女王並不能治理好一個國家，而且聖經說弟娶兄嫂者無後代。1525年，亨利認定凱瑟琳不能為他生下繼承人，且和女侍官安妮·博林發生婚外情。於是他指使親信托馬斯·沃爾西向教皇申請離婚，並派遣大臣威廉·奈特前去羅馬教廷遊說，理由是凱瑟琳與亞瑟的短暫婚姻裏有圓房事實。這給教皇克勉七世出了大難題，因為他不想得罪勢力強大的西班牙，況且此一婚姻是前任教皇親自批準的。
教廷遲遲不批準離婚，沃爾西也無能為力，安妮·博林卻已經懷孕。亨利著急起來，遂采取多項行動。1529年，他撤職並拘禁沃爾西。但繼任者托馬斯·摩爾爵士為人正直且忠於羅馬，仍不願配合。亨利繼續提拔其他逢迎的人，如托馬斯·克蘭麥和托馬斯·克倫威爾。這兩人都支持安妮·博林，也同情當時歐洲大陸興起的新教改革風潮。克蘭麥建議尋求大陸的神學院支持。
通過賄賂和施惠，此策略終於獲得成功。1530年，英國國會提交了有利亨利的報告。他投桃報李任命克蘭麥為皇家法院特使，進而在坎特伯雷大主教威廉·沃蘭死後讓其繼任。克倫威爾是亨利的親信謀臣，其建議更加大膽，要他廢除教皇在英國的崇高地位並取代之。另方麵，即使亨利威脅不繳交教廷的什一稅，教皇仍不改初衷。他於是下定決心決裂。
1533年1月，亨利秘密與安妮·博林結婚，英國國會隨即立法脫離羅馬教廷，大主教克蘭麥接著宣布亨利與凱瑟琳的婚姻無效，與安妮·博林的婚姻合法。6月1日，安妮·博林加冕為英格蘭王後。三個月後，她生下女兒伊麗莎白（後來的英王伊麗莎白一世）。同年7月，教皇廢除亨利教籍。
1534年春，克倫威爾力促國會通過一係列法案："上訴限製條例"禁止英國教會法庭上訴到教皇、禁止教會不經英王允許發布規章；"教職任命法案"規定教會必須根據英王指定的候選人推選主教；"至尊法案"宣布英王是英國教會唯一最高權威；"王位繼承法"宣布凱瑟琳的女兒瑪麗乃是私生子，安妮·博林的女兒伊麗莎白則為順位繼承人；"叛國罪法案"規定不承認英王的最高權威即是叛國罪，可判處死刑；並且取消給教皇的獻金。
英國教會從此轉變為聖公宗。它是基督新教的一個獨立教派，也是改革最不徹底的，因為其目的隻放在合法化亨利與安妮的婚姻。聖公宗和舊教天主教沒有理論原則的任何分歧，隻是不承認教皇權威，再簡化部分的禮儀。很關鍵的《王位繼承法》否認"外國的王室和君主"對英國王位有繼承權，英國成人都必須宣誓承認該法案條款，拒絕者將處以終身監禁；任何人出版或印刷文字宣稱亨利與安妮·博林的婚姻非法，必然處以叛國罪，可以處死刑。亨利進而快速鎮壓對其宗教政策不滿的人。部分不妥協的修士被拷問並處死，一些拒絕立誓的主要異議者被判處叛國罪，於1535年在泰伯恩刑場斬首。包括羅徹斯特主教約翰·費施爾、前任大法官托馬斯·摩爾爵士等。
亨利新創一個職位"宗教特使"給克倫威爾，授權他訪問修道院。這表麵為了確保法令實施，實際則在評估修道院財產。1536年，國會通過法案，授權亨利剝奪小型修道院的財產。這項壓迫引發反抗，尤其同年10月在英格蘭北部的求恩巡禮事件。亨利宣布要寬恕叛亂者，並感謝他們提出值得注意的問題。他邀請其首領羅伯特·阿斯克（RobertAske）參加皇家宴會，當場請對方寫下事件情況以便改進問題。阿斯克相信亨利言行一致，乃解散叛亂團體。亨利卻認定其叛亂為叛國，無需遵守承諾。叛亂於是再生，但聲勢已弱，終被鎮壓，其首領包括阿斯克在內都被拘捕且以叛國罪處死。當初他書寫的資料成為其認罪書。1539年4月，亨利再依據國會新法案先後解散較大的修道院。
亨利為了迎娶新王後，激進地改革宗教，但很快兩人的關係就冷卻下來。主因是安妮·博林生下伊麗莎白公主之後的兩次懷孕都宣告失敗，一次流產，一次死產，直接打擊了亨利尋求男性繼承人的希望。可能是克倫威爾鼓動，亨利下令拘禁安妮·博林，罪名幾乎都是叛國罪，但極可能都是編造。包括：以巫術誘使國王結婚、與5個男人通奸、與兄弟喬治·博林亂倫、傷害國王、陰謀殺害國王和試圖毒害亨利八世的私生子亨利·菲茨羅伊等。
審判法庭由安妮·博林的舅舅托馬斯·霍華德主持。1536年5月，法庭宣判安妮·博林及其兄弟死刑，由國王決定是火刑或斬首。兩人很快被斬首。安妮·博林在最後彌撒時，對牧師和其他見證人堅稱自己無罪。4名通奸男子判處車裂，後來減刑為斬首。
安妮·博林被斬首的第二天，亨利與她的侍女珍·西摩訂婚，10天後正式結婚，並以新通過的第二部王位繼承法宣布新王後的子女將是順位繼承人；之前的子女瑪麗和伊麗莎白乃私生子，剝奪其繼承權；國王且擁有以遺囑重新指定繼承人的權利。
隔年的1537年，珍生下兒子愛德華（後來的愛德華六世），卻在同年10月24日因產褥熱逝世於格林威治。亨利哀悼了比較長的時間，因為珍生下他渴望已久的唯一男性繼承人，被他視為唯一"真正"的妻子。
亨利與珍結婚同時，國會通過《威爾士法案》將威爾士並入英格蘭，並指定英語為其官方語言，給威爾士眾多使用威爾士語的人帶來不便。1537年，亨利命令坎特伯裏大主教交出奧特福德宮。1540年，亨利拆除天主教聖徒的一些聖地。1542年，英格蘭剩餘的修道院都解散了，其財產收歸皇室。
都鐸王朝：在溫莎的時光中走向終結修道院和隱修院在英國上議院的席位取消，隻有教會的大主教和主教能保留席位。上議院神職議員（Lords Spiritual）的席次首度少於世俗議員（LordsTemporal）。克倫威爾則因此功勞受封新創的頭銜埃塞克斯伯爵。
亨利急於再婚，以確保男性繼承人無虞。克倫威爾推薦克裏維斯的安妮，她是德國克裏維斯公爵的姐姐。公爵信奉新教，是亨利對抗羅馬教廷的重要盟友。他派遣畫家小荷爾拜因去給安妮畫像。畫得很美，朝臣也爭相讚美，於是亨利同意結婚。但安妮抵達英國後，他對其外貌大為失望，她臉上的痘疤完全沒畫出。據說他私下批她為"Flanders Mare"（法蘭德斯的夢魘）。然而，兩人還是於1540年1月6日結婚了。
亨利事後急於結束這樁婚姻，不僅由於個人審美喜好，也基於政治考慮。因為此時公爵與神聖羅馬帝國皇帝不睦，亨利不想夾纏其中。安妮王後很識時務的配合，順勢聲稱兩人並未圓房，他僅每晚到她臥房吻一下額頭而已。這樁婚姻於是被宣布無效，理由是安妮已和另一歐洲貴族訂婚。她被授予"國王的姐妹"榮銜，亨利還贈予她博林家族舊宅希佛堡（HeverCastle）。克倫威爾則因此失寵被剝奪財產，1540年7月28日斬首。其擔任的宗教特使一職此後沒有繼任者。
克倫威爾被斬首當天，亨利迎娶安妮·博林的表妹凱瑟琳·霍華德。他對新王後很滿意，但她婚後卻和朝臣托馬斯·卡爾佩珀發生婚外情，還任命從前情人弗蘭西斯·迪勒姆為秘書。大臣托馬斯·克蘭麥一向不喜天主教的霍華德家族，遂向亨利密報王後通奸。他起初不相信，但克蘭麥調查獲得有力證據。凱瑟琳也承認婚前與迪勒姆有婚約，這讓她與亨利的婚姻無效。她又聲稱受到迪勒姆強迫才與之通奸。迪勒姆則揭發她和卡爾佩珀的奸情。這項婚姻於是被宣布無效。但既然婚姻無效，則通奸罪名理應不成立。但這一點被忽略了。1542年2月13日，凱瑟琳很快就被處死了，當時隻有22歲。
1543年，亨利第六次也是最後一次結婚，妻子是富有的寡婦凱瑟琳·帕爾。她的宗教觀點激進，亨利卻是保守派。兩人經常爭論，幾次險些讓她喪命，但她總能及時讓步。受到王後影響，亨利和兩個女兒瑪麗、伊麗莎白和解。1544年，國會通過第三部《王位繼承法》重新賦予她們次於愛德華王子的王位繼承權，但仍被視為私生子。亨利則獲授權以遺囑重新設立繼承人。
亨利晚年嚴重超重，腰圍達54英寸，也可能有痛風。他超重始於1536年。亨利在一次馬上長矛比武發生意外，大腿受傷，從此無法運動。其去世或許跟該傷口的潰爛有關。他去世100年後，有傳言說他患有梅毒。近世更有說法，其三個子女愛德華六世、瑪麗一世、伊麗莎白一世均有梅毒症狀。亨利身體狀況漸差之後，也越發殘暴。
史學家何林塞聲稱，從1513年的第三任沙福克公爵埃德蒙·德拉·波爾到1547年的薩裏伯爵亨利·霍華德，他總共處決72，000名政治犯。
1547年1月28日於懷特霍爾宮，亨利在他父親亨利七世90冥誕那天去世，埋葬在溫莎堡的聖喬治教堂，與第三任妻子珍·西摩合葬。約100年後，查理一世也被葬於此。亨利八世死後十來年間，其三個合法子女都坐上英國王位，但都沒有子嗣。
亨利唯一的合法兒子愛德華根據第三部《王位繼承法》，繼承其王位成為愛德華六世，是英國曆史第一位新教君主。他當時僅9歲，無法施政，16位執行者依據亨利遺囑代議政事直到他滿18歲。珍·西摩的兄長愛德華·西摩被遺囑指定為護國公（LordProtector）。愛德華之後的順位繼承人是阿拉貢的凱瑟琳之女瑪麗及其後代；若瑪麗無後，她死後由安妮·博林之女伊麗莎白及其後代繼位；若伊麗莎白無後，她死後由亨利八世的妹妹瑪麗·都鐸的後代繼位。因為亨利姐姐瑪格利特·都鐸（蘇格蘭王室）的後代已被剝奪對英國王位的繼承權。
事實卻是，亨利的三個子女和瑪麗·都鐸的兒子都沒有後代。伊麗莎白一世去世後，王位傳給她表侄女的兒子、蘇格蘭王室的繼承人詹姆士一世。都鐸王朝從此終結。
亨利對後世的最大影響在於英國宗教改革。1533年，他脫離羅馬教廷產生的影響遠超過都鐸王朝本身的份量。盡管亨利最初動機是解決王朝和自身的繼承人問題，也盡管他從未放棄天主教信仰的本質，他的改革是所有英國君主最激進且最具決定性。
一方麵，英國轉變為獨特且生氣勃勃的新教國家，修道院被解散和土地財產充公，更使英國經濟政治的權力重心從教會移到貴族，社會效應非常深遠。另方麵，亨利授權愛德華·西摩為首的新教人士為其年幼兒子愛德華六世攝政，或許這出於信任西摩，但確保了新教改革的持續。
亨利的政策和結果卻時常不一致。他鼓勵研究人文主義，但也處死幾位傑出的英國人文學家；他一心要確保王室延續，但隻留下一個年輕的兒子和兩個宗教信仰對立的女兒；他擴大君主的權力，但中產階級也加強參與政治；他成功加入歐洲大陸的政治外交，但國庫因此空耗，使繼位的英國君主相當麻煩。
亨利和阿佛列大帝、查理二世一般被視為英國皇家海軍的創始人。在他統治下，海軍參與一些重要戰役，興建成果也增多，包括海軍艦船、造船所、海軍建製改革等。但他主要作為僅在一些軍艦，並未留下真正意義上的"海軍"，沒有建立正規的海軍組織、軍銜、軍需等體製。後來的伊麗莎白一世仍然需要召募私人艦船去對抗西班牙無敵艦隊。英國海軍要到十七世紀英荷爭奪海上霸權時才算成型。
亨利脫離羅馬教廷引起法國和西班牙大規模入侵。他因此加強海岸防衛堡壘，甚且親自監管數個月。多佛堡至今尚有相關的紀念館。亨利同時也新建一係列棱堡、炮台等，分布在東英格蘭到康沃爾的南部海岸線上，大多使用拆除修道院所得的材料。
亨利唯一留存的衣物是一頂冠冕。1536年，他將這頂冠冕連帶一把佩劍賞賜給沃特福德市長。目前冠冕保存於該市珍寶博物館