生物的生存繁衍都離不開特定的棲息地，這就是生境。生境的破壞，導致生物種群的毀滅。世界各地的沿海窪地和淺灘，是水鳥和1/3經濟魚、貝類的生境，有了這種生境，它們才得以覓食、繁殖和避免敵害。美國由於沿海窪地的破壞，每年漁業損失達8.600萬美元。斯裏蘭卡大采珊瑚礁燒石灰，使整個地區的漁業破產。世界各地海龜築巢的海灘、灰鯨和白鯨的繁殖場所的破壞，直接給這些水生動物帶來滅絕的威脅。我國福建廈門同安沿海特產文昌魚，不僅營養價值高，而且是地球上僅剩的為數極少的脊索動物，因此有很高的科學研究價值。但自1949年以來產量每況愈下，到70年代幾乎到絕跡的境地!文昌魚的遭遇和世界上許多瀕臨滅絕的水生動物非常相像，也是因為無家可歸而遭到的厄運。在50年代以後，文昌魚的家鄉築起了圍海造田的大堤。為搞基建需要沙子，就到海灘去掏沙，使文昌魚失去藏身之地。加上暴雨台風災害，使潮水流向、流速改變，淤泥大量沉積，海水含鹽度下降，文昌魚生存所需的理化條件也喪失了。人類對魚類海岸棲息地的各種形式的破壞，包括圍墾，港灣工程、疏浚，淤積、汙染，致使不少魚類瀕臨滅絕。
據《中國青年報》1998年12月6日報道，最近，在曾被譽為“南海綠色長城”的廣東省電白縣博賀林帶，記者見到了令人震驚的一幕：這條全長約25km、想象中應該鬱鬱蔥蔥的全國第一條沿海防護林帶，實際上已經不複存在。以龍頭山為界，往西的林帶被撕開了一個個大口子，支離破碎，取而代之的是海邊上百口蝦塘。在龍頭山以東，緊臨著大海、被林業部門稱為基幹林地的地帶，除了冒出稀稀拉拉的雜草外，沒有任何植被，隻有白茫茫一片沙地。為看護蝦塘而興建的一幢幢小樓卻建在了基幹林地上。“蝦塘長陣”一邊與海灘相接，另一邊就連著村民的樓房。
1978年8月，我國渤海灣曾發生過持續20天、麵積達360km2的赤潮。對形成渤海灣赤潮的原因進行分析後確定，這跟北京、天津排放汙水中的氮和磷有直接關係。由於當時正值汛期，汙水排放集中，造成海水中氮和磷濃度超過正常標準，使渤海灣海水富營養化，因而發生了這次赤潮。據國家海洋局北海分局的最新巡航監視報告，1999年7月2日至6日渤海西部河北滄州歧口附近海域發生1.500km2的大麵積赤潮之後，僅僅隔了不足10天的時間，渤海再次發生特大麵積赤潮，約為6.300km2，1999年6月17日在嵊泗島正東偏東50°方向的455海裏附近海域又發現了大麵積赤潮現象，赤潮呈塊狀，橘紅色，麵積約幾十平方公裏；國家海洋局南海分局現場初步調查，1999年7月14日汕頭市繞平拓林灣發生10km2有毒赤潮，15日赤潮麵積已迅猛擴展至400km2，並且有進一步暴發擴展趨勢。1999年7月13日在鮁魚圈、營口至葫蘆島市之間海域內發現特大麵積赤潮，約為6.300km2。據2000年6月6日《經濟參考報》報道，國家海洋局東海分局近日再次拉響警報：在浙江中部近岸海域象山巷、三門灣一帶又一次出現了大麵積赤潮，並向大陸海岸線不斷逼近!據《揚子晚報》2000年6月25日報道，啟東有關部門從空中探測赤潮已出現在長江口，離南通市僅一箭之遙。