清査“四人幫”的幫派體係，還連帶清査“文化大革命”中的打砸搶問題，有些單位出現了偏差。1978年8月中共中央發出《關於慎重處理“文化大革命”中打砸搶問題的通知》，明確清査和處理打砸搶的對象。
到1978年，全國性的清査工作基本結束。華國鋒在第五屆全國人民代表大會第一次會議上的政府工作報告中總結說：
一年多來揭批“四人幫”的群眾運動，發展是迅猛而又健康的。“四人幫”及其餘黨的資產階級幫派體係，已經土崩瓦解。絕大多數地區和部門，同“四人幫”篡黨奪權陰謀活動有牽連的人和事已經基本查清，階級陣線已經基本清楚。就全國範圍來說，清查工作基本上勝利結束。
清査“四人幫”的幫派體係，基本上査清了與“四人幫”篡黨奪權有牽連的人和事，摧毀了他們的政治勢力。到1978年8月，在全國二十九個省、市、自治區的主要負責人中，査出同“四人幫”有牽連而被撤職的有九人，約占這些地區主要負責人總數的三分之一左右。
揭批査“四人幫”的運動取得了很大的成績。早在1977年上半年前後，全國各地的武鬥動亂被製止了，出現了安定團結的政治局麵。
廣大幹部群眾衝破了林彪、“四人幫”設置的禁區，基本上分清了被他們搞亂了的思想是非、理論是非、路線是非和政策是非，思想獲得了解放，理論水平和思想覺悟得到了提高。
實事求是、群眾路線和批評與自我批評的優良傳統作風開始得到恢複。
擺脫了混亂局麵，黨、政、軍的工作和各項事業恢複正常，國民經濟倒退停滯局麵已經扭轉，工農業生產大幅度提高，財政收入增加，為工作重點的轉移準備了條件。
至此，運動的目的基本實現。在這樣的情況下，黨和政府應及時地引導幹部群眾的行動方向。1978年9月，鄧小平在東北視察工作時提出，應在適當的時候結束全國性的揭批“四人幫”的群眾運動，把黨和國家的工作重點轉到四個現代化建設上來。
1978年10月3日下午，鄧小平找胡喬木、鄧力群等談話，請他們幫助修改他代表中央在工會九大的致詞稿。其中談道：
現在到了這麼個時候，“四人幫”當然要批，但不能老是說什麼都是“四人幫”搞的。現在有些事將要考核我們自己的幹部，批了“四人幫”還搞不好，總得整一下自己吧，總得問一問領導人、領導班子是不是可以吧。外國人有個議論說，你們什麼都歸罪於“四人幫”。歸罪於“四人幫”還是可以的，但是不能以後一直都歸罪於“四人幫”的幹擾破壞。我想從這個講話開始，講一下這個道理。這次我在沈陽軍區講揭批“四人幫”的問題，我說揭批“四人幫”運動總有個底，總不能還鼻搞三年五年吧！我說你們要區別一下，哪些單位可以結束，有百分之十就算百分之十，這個百分之十結束了，就轉正常工作，否則你搞到什麼時候。我們要把揭批“四人幫”的鬥爭進行到底，那麼就要問“底”在哪裏？現在可以暫時不說。
鄧小平10月在工會九大的致詞中就有這麼一段話：
很明顯，林彪、“四人幫”在工人隊伍中所散布的流毒和造成的惡果，還要下很大的破夫去肅清，整頓隊伍的工作還要在每個企業中完全落實。我們一定要把揭批“四人幫”的鬥爭進行到底，但是同樣很明顯，這個鬥爭在全國廣大範圍內已經取得決定性的勝利，我們已經能夠在這一勝利的基礎上開始新的戰鬥任務。
鄧小平的這一番話，可以看做是工作重點轉移的先聲。鄧小平關於及時實現工作重點轉移的意見，得到中央政治局的一致同意。華國鋒在11月10日中央工作會議第一次全體會上宣布中央政治局決定。他說：在討論會議的三個議題之前，先討論一個問題，就是“要在新時期總路線和總任務的指引下，從明年一月起，把全黨工作的著重點轉移到社會主義現代化上來”。還說：“現在的問題是揭批‘四人幫’運動已經達到什麼火候了？恰當地估量運動的發展狀況，是我們提出轉移全黨工作著重點的重要依據。”
1978年12月，中共十一屆三中全會及時地果斷地結束了全國性的揭批“四人幫”的群眾運動。