徐世昌等人正要動問袁世凱指的是哪部《約法》，一旁的袁克定急於繼位，趕緊代答“金匱石屋”，袁世凱微微點點頭，算是肯定。
因為不知道是否還有話說，便由貝希葉醫生再注射了一針強心針，慢慢地袁世凱就又蘇醒了過來，費了很大勁才說出四個字：“他害了我！”然後就再也沒醒過來。這個“他”眾說紛紜，其中呼聲最高的是兩個人，有人說是楊度，有人說是袁克定。
6月6日上午10點左右，一代梟雄袁世凱黯然離世，享年57歲，終於沒能突破家族的“58歲魔咒”。
袁世凱死後，徐世昌、段祺瑞、王士珍、張鎮芳四人立即打開金匱石屋，那裏果然有一份名單，上麵依次寫著黎元洪、段祺瑞、徐世昌三人的名字，這肯定令袁克定備感失望。
不過後來有個說法，說名單上本來是“黎元洪、袁克定、徐世昌”三人，直到臨死前幾天，袁世凱深知局勢已無可挽回，才叫人換上了段祺瑞的名字。
黎元洪的名字排在第一，而且根據《臨時約法》同樣該他繼任，這樣他就成了中華民國第二任總統。
黎總統上任後幹的第一件事，就是以國家元首的規格，為袁世凱治喪。為了這次國葬，中央政府特撥款50萬元。此外，所有國家機關一律下半旗，文武官員和駐京部隊一律佩戴黑紗，停止宴樂27天，民間則停止娛樂7天。
黎元洪還下令設立了“恭辦喪禮處”，由黎元洪、徐世昌、段祺瑞三人領銜，而以曹汝霖、王揖唐、周自齊三人負責具體工作。
靈堂設在中南海懷仁堂，從6月6日到27日，共停靈21天。京城的文武官員每日按班次前來致祭行禮，駐京部隊也分批前來，舉槍致哀。至於遍布各地的北洋將領，即使跟袁世凱政見不合者，此時也盡釋前嫌，紛紛親自或派代表前來悼念，其中最感人的是段芝貴，哭得比孟薑女還要悲痛，真跟死了親爹似的。
6月28日，袁世凱的靈柩從北京運往彰德，整個過程完全是皇家規格，前來送行的親朋故舊、文武官員計有2000多人，圍觀的群眾更是不計其數，據說比當年慈禧的葬禮還要熱鬧。
美中不足的是，二公子袁克文與大哥就安葬的墓地一事有過爭執，因袁克定堅持不聽他的，老二竟發了名士脾氣，沒來參加送殯儀式。反而是徐世昌、嚴修、段芝貴等人，一直把故人送到了洹上。
袁世凱下葬於洹上村以北一裏的墓地，墓園由德國工程師設計，占地200餘畝。袁克定本想仿效曆代皇帝，將此命名為“袁陵”，徐世昌勸說：“項城生前稱帝未成，未曾身居大寶，且已取消洪憲年號，如果采取袁陵之名，實為不妥。林與陵諧音，《說文解字》上所載陵與林二字又可以互相借用，避陵之名，仍陵之實，這多好啊！”徐世昌輩分在那兒，又是袁世凱生前最敬重的大哥，袁克定不敢堅持，於是墓園就定名為“袁林”。
徐世昌也真不愧是大哥。原來自古聖人之墓才稱“林”，如孔墓稱“孔林”，武聖關羽之墓稱“關林”，規格絕不在帝王之下。袁世凱得“袁林”之名，很可以含笑九泉了。
葬禮過後，“恭辦喪禮處”竟發現因為開銷太大，政府所撥50萬元專款將要花光，剩下的已不夠建造墓園。後來是由徐世昌、段祺瑞、王士珍等八人聯名發起公啟，向社會各界募捐，募到25萬元，才算把喪事辦完。
世所公認，袁世凱這人“貪權不貪財、不以公謀私”，死後留下的所有財產，包括田產股票現金，不過值200餘萬元，以他的地位與權勢，就當時來說，算得上一個清官。生前袁世凱曾請徐世昌代為分配，結果徐世昌將其分為了30份，兒子每人一份，沒有孩子的姨太太每人一份，未出嫁的女兒兩人一份，每份約8萬餘元。
黎元洪上台之後，少不了要應各界要求通緝帝製禍首，楊度、梁士詒等人隻好四處逃亡。亡命天涯之前，楊度還有閑情逸致為袁世凱做了一副挽聯，如此說道：
共和誤民國？民國誤共和？百世而後，再平是獄；
君憲負明公？明公負君憲？九泉之下，三複斯言。