於是高宗想仍杜爾伯特、和碩特之舊。以輝特補土爾扈特，以綽羅斯特代準噶爾。仍為衛拉特四部；各封降人為汗；令如喀爾喀之例，為外藩。而阿睦撒納想兼統四部，不肯奉詔。高宗詔班弟殺之。班弟為大兵已撤，不敢動手；隻催他入覲，想到半路上害他。阿睦撒納乘機逃去。伊犁複叛，班弟兵敗自殺。又擾攘了兩年。到一七五七年，兆惠和成袞劄布，才兩路出師。這時候，衛拉特諸部內訌，又痘疫大行，阿睦撤納不能抵禦，逃入俄境，病死。俄人把他的屍首送還。兆惠又留剿餘黨，到一七六○年才還。衛拉特的戶數，共有二十多萬。這一次，死於天痘的，十分之四；死於兵戈的，十分之三；逃入俄國和哈薩克的，也十分之二；存者不及十一，人稱為“衛拉特的一浩劫”。
於是在伊犁、烏魯木齊、塔爾巴哈台，各用滿兵駐防。並令漢兵屯種。而在伊犁設立一個將軍以節製之。
準部既滅之後，土爾扈特來歸。而烏梁海就是從前的兀良哈。亦盡入版圖。分其地為唐努烏梁海、阿爾泰烏梁海、阿爾泰淖爾烏梁海三部。分隸於定邊左副將軍，和科布多參讚大臣。
第六節 清朝平定回部
準部既亡，清朝的兵力，就及於天山南路。先是噶爾丹破黑山宗而立白山宗，策妄阿布坦，又排斥白山宗而代以黑山宗。白山宗瑪罕木特，想據葉爾羌自立。策妄阿布坦把他擒獲，囚在伊犁。瑪罕木特有兩個兒子：長名布羅尼特，次名霍集占，就是向來的史家，稱為大小和卓木的。清兵初入伊犁。阿睦撒納想得回部之援，把布羅尼特放回，而且借兵給他。布羅尼特就盡定天山南路。霍集占則留居伊犁，掌管北路的回教。清兵再定伊犁。霍集占也逃回去。清朝差人前往招撫，為其所執。一七五八年，兆惠移兵南征。以兵少，被圍於葉爾羌。富德前往救援，亦被圍於呼拉瑪。在葉爾羌東邊三十七裏。到底以援至得出。後來清兵聚集漸多，而大小和卓木，偏信在伊犁時的舊人；又用兵之際，稅斂甚重；諸城解體。一七六○年，兆惠打破喀什噶爾，大和卓木所居。富德打破葉爾羌。小和卓木所居。大小和卓木逃到巴達克山，為其城主所殺，函首以獻。於是天山南路亦平。設參讚大臣，駐喀什噶爾。大城設辦事大臣，小城設領隊大臣，以治軍。各城皆設伯克以治民。以回人為之。一七六三年，希哈爾以巴達克山殺大小和卓木，發兵滅之。烏什的回民，也想圖響應。為將軍明瑞所定。於是把參讚大臣移駐烏什。
蔥嶺本來是東西交通惟一的要路；從回教盛行以後，天山南路和蔥嶺以西的關係更深；所以從回疆平定之後，蔥嶺以西諸國，到清朝來朝貢的就很多。現在約舉其名如下：
巴達克山以下七部，清朝的書，都稱他為城郭回部。
克什米爾《唐書》的個失密，亦稱迦隰彌羅。
乾竺特即坎巨提，亦作喀楚特。
博羅爾就是鉑米爾，《唐書》作波謎羅。唐朝於其地置羈縻州名巴密。
敖罕亦作浩罕。所屬有敖罕、納木幹、瑪爾噶朗、安集延四大城，窩什、霍克占、科拉普、塔什幹四小城；故稱敖罕八城。安集延城的人，來中國經商的最多，故中國亦通稱其人為安集延。
布哈爾
阿富汗
哈薩克共分三部：左部鄂爾圖玉斯，俄人稱為大吉爾吉思。中部齊齊玉斯，俄人稱為中吉爾吉思。西部烏拉玉斯，俄人稱為小吉爾吉思。小吉爾吉思，就是黠戛斯的音轉。哈薩克和布魯特，都準每年一次，到烏魯木齊互市。哈薩克三年一貢，布魯特則每年進馬。哈薩克的部長，清朝曾各授以王公台吉的稱號。布魯特的頭目，也由將軍大臣奏放。
布魯特分東西兩部，俄人稱為喀喇吉爾吉思。
這許多部落到英俄勢力擴張之後，都為其所並。事見下篇。
和卓木是教主的後裔，雖然一時失敗，回部對他的信仰，是不會減弱的。清朝初定回疆的時候，以回眾強悍，頗加意撫恤。租稅則四十取一。辦事和領隊大臣，都慎選滿員中賢明的人。回民遭大亂之後，驟得休息，亦頗相安。朝廷就漸不在意。用起侍衛和在外駐防的滿員來。都“黷貨無厭”，而且要“廣漁回女”。於是大和卓木的孫兒子張格爾，於一八二○年，仁宗嘉慶二十五年。乘機導敖罕入寇，陷喀什噶爾、英吉沙爾、葉爾羌。詔楊遇春以陝甘兵進討。明年，恢複諸城。張格爾走出邊。遇春設計誘他入寇，把他擒住。朝廷遂詔敖罕執獻張格爾家屬。敖罕不聽。乃絕其貿易。於是敖罕又借兵給張格爾的哥哥摩訶末，叫他入寇。直到一八三一年，才算議明：中國仍許敖罕互市，敖罕則代中國監守和卓木一族，不許他來擾亂。
第七節 清朝征服廓爾喀
蒙藏準部和回疆，都已平定。卻還有一件，對於廓爾喀的兵事，也是因西藏而起的。
廓爾喀，就是唐朝的泥婆羅。棄宗弄讚曾娶其公主；中國使臣於玄策，又曾調其兵攻印度的叛臣阿羅那順，均已見前。第二篇下第二章第三節。泥婆羅和西藏，是極接近的。雖沒有什麼記載可憑，卻可以推想其曆代的交通，都不曾斷絕。當清朝時候，泥泊爾分為三部，推加德滿都為盟主。一七六七年，為其西鄰的廓爾喀所並，仍以加德滿都為首都。
一七八○年，班禪六世入都，祝高宗七旬萬壽。賞賜甚多。諸王公的布施，也有好幾十萬。班禪害了天痘，死在京城裏。明年，喪歸劄什倫布。他的哥哥仲巴，把所有財寶，通統占據了起來。借口他的兄弟舍瑪爾巴，是信紅教的，一個大錢也不曾分給他。舍瑪爾巴，因此大忿，逃入泥泊爾。又有班禪部下的丹津班珠爾，因受了刑罰，也逃入其地。勸他的酋長拉特木巴珠爾入寇。一七九○年，廓爾喀入西藏。侍衛巴忠等，不敢抵敵。私許以歲幣銀一萬五千兩講和。又繳不足額。明年，廓爾喀再入西藏，駐藏大臣保泰，把班禪移到前藏。廓爾喀在劄什倫布，大肆剽掠。分兵一半，載所掠而去。一半仍留屯界上。事為高宗所聞。詔福康安、海蘭察出兵。一七九二年，二月，把他留屯的兵趕掉。六月，分兵三路攻入其國。六戰皆捷。離加德滿都，隻有一天路程。福康安誌得意滿，揮羽扇出戰，自比諸葛武侯。為廓爾喀所襲擊，大受損失。乃因其請和，許之而還。自此廓爾喀定五年一貢，算做清朝的屬國。
自經此戰以後，政府曉得聽西藏自由和人家交通，不大便利。乃擴大駐藏大臣的權限。在儀製上，和達賴、班禪平等。把軍政財政的權柄，漸次收歸掌握。並且慮及達賴、班禪繼世之際，不免紛爭。就想出掣簽之法，頒發“金奔巴”譯言瓶兩個：一個放在西藏的大招寺裏，一個放在北京的雍和宮裏。達賴、班禪和各大胡土克圖，繼承之際，遇有紛爭，就把名字寫在簽上，放入瓶中，以抽簽之法定之。從此以後，清朝對於西藏的管束，就覺得更為嚴密了。