第一節 種族和宗教的變化
中國地方，除內地十八省和關東三省外，可以大別為兩個高原。參看第二篇下第三章第二節。便是：
（一）蒙古新疆高原。
（二）青海西藏高原。
其中蒙古高原，向來是遊牧民族占據的。新疆高原，即遊牧（行國）、耕稼（居國，即城郭之國），民族錯居，而大部分是城郭之國。其民族：則占據蒙古高原的，是匈奴、柔然、突厥、回紇。其實可稱匈奴、丁令兩種人。因為柔然所用的，都是丁令之眾；突厥、回紇，又都是丁令的分部。參看第二篇下第一章第一、二、三節。占據新疆高原的，是塞種和氐、羌。第二篇上第四章第二節。其占據青海西藏高原的：則係氐、羌和藏族；而印度阿利安人，侵入其南部的雅魯藏布江流域。第二篇下第二章第二、三節。這些話，前文都已說過了。卻是到近世，起了一個大變化。便是：
（1）從回紇為黠戛斯所破，遷入天山南路，而丁令種族，占據了新疆高原。
（2）從回紇敗亡之後：黠戛斯沒有能夠占據漠南北；契丹的實力，也隻及於漠南的一部分；蒙古高原，就多時沒有強大的民族。直到蒙古人興起，才盡為所據。蒙古是靺鞨韃靼的混種。然其種族，究當以靺鞨為主。所以近世，可算是肅慎種族極興盛的時代。
（3）從蒙古人興起之後，新疆高原，也為所征服。雖沒有能將本來的民族——回族——融化，這因回紇也是大族之故。而在近世，蒙古高原和新疆高原的曆史，也發生極密切的關係。
（4）青海西藏高原，向來和別處地方，關係較少的。卻是近世，喇嘛教大行；而又適值蒙古人勃興之際，於是在政治上，則蒙古征服西藏；在宗教上，則西藏征服蒙古，而蒙古高原和西藏高原的曆史，也就發生極密切的關係。
（5）當此時代，蒙古人又侵入青海，就使蒙藏兩高原，曆史上的關係，更加一層密切。
（6）在近世，喇嘛教大行於青海、西藏和蒙古高原，——其餘波並及於關東三省。——而新疆高原，則仍為天方教流行之地。
更簡而言之，則是：在種族上：（一）蒙古高原的回紇人，侵入新疆高原。（二）關東三省的靺鞨人，——蒙古——侵入蒙古、新疆、青海高原。在宗教上：則（一）起於阿剌伯半島的天方教，侵入新疆高原。（二）起於印度地方的佛教傳入西藏、青海和蒙古高原。這種變化，也算得重大而可驚了。除（1）（2）兩條，前文業經說明外；其（3）（4）（5）（6）四條，分別說明之如下。
第二節 黃教的盛行和天山南路的回教
蒙古人的信仰喇嘛教，已見第三篇下第四章第二節；但是到明朝，喇嘛教又另開了一個新派。喇嘛教的入西藏，事在七四七年。唐玄宗天寶六年。其初祖，名巴特瑪撤巴斡。見《蒙古源流考》。從此以後，喇嘛教的勢力，日盛一日，竟兼握西藏政教兩權（吐蕃讚普的統係，也不知絕於何時）。推原其故：則吐蕃本不是什麼統一的國家；當從印度侵入的勃窣野氏《唐書》吐蕃讚普的姓。強盛的時候，暫時能統一青海西藏高原。到後來衰弱了，各地方的酋長，自然要現出獨立的形勢。而當這時候，喇嘛教既已盛行：（1）諸喇嘛自然有篡部酋之位的；（2）諸部酋也一定有入教為喇嘛的；（3）諸喇嘛也自然有直接轄眾的機會；不知不覺之間，政教兩權，就自然混合了。從蒙古征服西藏以來，極其崇信僧侶。喇嘛的勢力，自然更加增長。西藏政教的所以合一，就是政權所以從部酋而移入於喇嘛之手，史無可考；以上是我據臆見推想的話。
喇嘛教是佛教中的“密宗”。這密宗，是要講究“顯神通”的；和西藏人民信仰的性質相合，所以易於盛行。但是到後來，就弄得隻剩了迷信，別無所謂教義。甚至以“吞刀吐火”，誑誘流俗，發生出許多弊病來。於是黃教乘之而起。黃教的始祖宗喀巴，以一四一七年，明成祖永樂十五年。生於西寧衛。入雪山修苦行。別創一教。以舊教衣尚紅色，就黃其衣冠以示別。所以人稱他為“黃教”，而稱舊派為“紅教”。紅教不禁娶妻，所以法王能生子襲衣缽。黃教卻不然。於是宗喀巴遺言：他的兩大弟子達賴、班禪，世世以“呼畢勒罕”，譯言轉生。濟度眾生。宗喀巴以一四七九年明憲宗成化十五年。示寂。達賴一世敦根珠巴，本來是吐蕃王室之裔，世為藏王；舍位出家，傳宗喀巴衣缽；所以兼有了西藏政教之權。二世根敦錯，始置“弟巴”等官，以理政務；而自己專理教務，三世鎖南堅錯，始得蒙古諸部尊信。一五七九年，明神宗萬曆七年。俺答和他的孫兒子黃台吉入藏，迎接鎖南堅錯到青海漠南去布教。鎖南堅錯勸俺答勿得好殺。俺答也勸他交通中原。於是從甘州貽書張居正，請入貢。居正以聞，許之。是為中國和黃教交通之始。四世雲丹堅錯便是俺答的曾孫。教義直推行到漠北。漠北因離西藏較遠，就自奉宗喀巴第三大弟子哲布尊丹巴的後身，居於庫倫。這便是現在外蒙的所謂活佛了。五世羅卜堅錯，其教並行於滿洲。袁崇煥和滿人相拒的時候，就有喇嘛往來其間。崇煥也利用他，做傳達國書等事情。一六五一年，崇禎十年。太宗始因衛拉特的使者，貽書達賴、班禪。達賴、班禪，也覆書報使。一六五二年，清世祖順治九年。清世祖就把達賴迎接到京城，封為西天大善自在佛。於是清朝人利用喇嘛教以撫綏蒙藏的機緘又開。從宗喀巴降生以後，到此，凡二百三十六年，喇嘛教的勢力，可謂極磅礴鬱積之勢。而其和蒙藏兩高原民族的關係，也可謂複雜極了。
蒙古的侵入青海，起於一五○九年。明武宗正德四年。其酋長名亦不剌、阿爾禿廝。後阿爾禿廝為明朝所攻，遁去。而亦不剌和他的黨羽卜兒孩，仍相繼據有其地，役屬番人。一五五九年，明世宗嘉靖二十八年。俺答和他的兩個兒子賓兔、丙兔，襲取其地。留賓兔、丙兔守之，自此青海地方，為套部所有。漠南和西藏的交通，大為方便。這也是喇嘛教盛行於蒙古的原因。
天山南路，在元時，均屬察合台後王，明初既定甘肅，於其西設安定，漢婼羌國地。阿端、曲先、酒泉縣西南。罕東在安西縣境。諸衛，均隸西寧。又設赤斤、在嘉峪關西三百四十裏。沙州唐朝時沙州。二衛，隸肅州。再向西，就是哈密衛。新疆的哈密縣。後來土魯番強，新疆的吐魯番縣。哈密為其所並。並據罕東、赤斤。而曲先、安定二衛，則為亦不剌、阿爾禿斯所破。自是甘肅無複屏蔽，邊患頗深。當這時候，分王天山南路各城的，還都是察合台的後裔。到後來，回教徒和卓木的後裔得勢，而形勢又一變。和卓木是回教教主摩訶末的後裔。當帖木兒強盛時，見下篇第二章第一節。也極其相信回教。於是回教教徒，多聚集撒馬兒罕和卓木以教主之後，尤是尊重。和卓木有兩個兒子：長名加利宴，次名伊撒克。加利宴之後為白山宗。伊撒克之後為黑山宗。遷居到喀什噶爾，也極得人民信奉。其後遂漸代察合爾後王，握有南路政教之權。這是近世天山南路回教興盛的一因。然而當這時候，蒙藏的交通既開，天山南路，介居其間，自不得不發生關係。而天山北路，又來了一個野心勃勃的衛拉特，其波瀾就愈擴而愈大了。
第三節 衛拉特的盛強和清朝征服蒙古
從元順帝退出中原以後，漠南北的曆史，簡直是蒙古和瓦剌——衛拉特——鬥爭的曆史，已見前第一章。達延汗之興，蒙古人總算恢複其勢力。而衛拉特亦仍不失其為大部。從明朝末葉以後，蒙古人尊信了喇嘛教；擴悍好殺的性質，漸次變化；其勢頗流於弱；而衛拉特轉強。當清初，衛拉特四部分布的形勢如下：