在宗教戒律上，洪秀全把摩西十誡改為“十款天條”，即一、崇拜皇上帝；二、不拜邪神；三、不妄題皇上帝之名；四、七日禮拜頌讚皇上帝；五、孝順父母；六、不殺人害人；七、不奸淫；八、不偷竊劫搶；九、不講謊話；十、不起貪心。每條之下都附有四句七言韻語，如第一條下是：“皇天上帝是真神，朝夕禮拜自超升，天條十款當遵守，切莫鬼迷昧性真。”這與基督教裏所唱的讚美詩差不多，便於教徒記誦。金田起義後，天條便成為太平軍初期的軍律。後來又發展為更為完備的《五條紀律詔》、《行營規矩》、《定營規條十要》、《行軍總要》等。例如《定營規條十要》第一條是“要恪遵天命”，第二條是“要熟識天條、讚美、朝晚禮拜、感謝規矩及所頒詔諭”，處處充滿著宗教的意識。太平軍不僅在戰爭的艱苦條件下嚴格奉行宗教禮儀，而且非常重視“天情道理”的宣講，使士兵“隻知有天父兄，不怕有妖魔”，作戰時奮不顧身，絕不怕死，又嚴守紀律，團結一致，所以成為一支英勇善戰的軍隊。
拜上帝會崇拜“天下凡間大共之父”的“皇上帝”，說“大而無外謂之皇，超乎萬權謂之上，主宰天地人萬物謂之帝”。皇上帝是無所不能、至高無上的獨一真神；耶穌基督是上帝的聖子和救贖世人的主，同時反對敬拜上帝以外的邪神和各種神靈的偶像(甚至包括天主教的聖母像)。但在基督教教義中，耶穌是上帝的獨生子和救贖世人的主，而拜上帝會卻宣稱洪秀全是上帝的次子。在早期，楊秀清、蕭朝貴曾多次聲稱天父(上帝)、天兄(耶穌)分別附體傳旨，借以穩定局麵。洪秀全事後肯定了這些傳旨內容，並列為教義。楊、蕭等人也曾稱為天父之子和婿。晚期，洪秀全除提出天母、天嫂外，還稱天兄無子，將子洪天貴福過繼給耶穌為嗣子。這樣，基督教關於聖父(上帝)、聖子(耶穌)和聖靈(聖神)的三位一體教義，在拜上帝會中變成了“爺哥朕幼”的“上帝家庭”。
對待《聖經》，拜上帝會由於對現世的重視，遠遠超過對來世的重視，因而與基督教大不相同。洪秀全雖然十分尊重《聖經》，稱為“天書”、“遺詔”，但常按自己的想法批解。當他認為某些經文不適合太平天國時，就另引經句加以批駁，有時幹脆宣布“爺知新約有錯記”。拜上帝會認為，太平天國天王的詔書，也是《聖經》的組成部分，與《新約》、《舊約》同等。太平天國明令宣布：“當今真道書者三，無他，《舊遺詔聖書》(《舊約》)、《新遺詔聖書》(《新約》)、《真天命詔書》(洪秀全所下詔書)也。”後期，又在《欽定士階條例》中，將《新遺詔聖書》改為《前遺詔聖書》，又稱《前約》；將《真天命詔書》改為《天命真主詔旨書》，又稱《真約》。這樣，由《新約》和《舊約》兩部分組成的基督教《聖經》，便被擴充為由《舊約》、《前約》和《真約》三部分組成的拜上帝會《聖經》。
注釋：
拜上帝會成立初期並不知道有聖餐儀式，後期雖有類似儀式，但仍很簡單，多在每月第四個禮拜日分飲少許葡萄酒。每個禮拜日(由於曆算錯誤，實際上是公曆的星期六)禮拜時唱詩、讀經、講道。講道寫成書麵文章，講畢當場焚化。最後焚香並鳴放鞭炮。
拜上帝會雖然在許多方麵與傳統基督教大異其趣，但畢竟脫胎於基督教，與早期傳教士的傳教活動有直接的聯係。因此，太平天國革命爆發後，西方傳教士有人認為是解決在華傳教問題的絕好機會，“如革命成功，吾人可預料之利益，乃是大開海禁以便傳教通商。”盡管當時英美當局不許傳教士公開同太平軍接觸，但有些人仍對拜上帝會和太平天國在報刊上和言談中寄予同情。上海老北門浸會禮拜堂的美國傳教士晏瑪太，甚至還接待化裝途經上海的馮雲山子侄二人，自稱可協助他們乘美國軍艦潛往天京(二人臨行前又被留下，終遭清軍殺害)。洪仁玕是拜上帝會最早的信徒。金田起義後，他未能及時與大隊會合，後被清朝通緝，四處逃亡。1852年4月由洪亞新帶往香港，為牧師韓山文收留，學習基督教教理。1853年底，韓山文為他施洗，其後在港教書為生。1854年春，他乘輪船往上海，擬入天京效力。行前韓山文贈以書籍多種。由於清軍阻路，他不得不滯留上海，在倫敦布道會的墨海書院工作，與傳教士麥都思、艾約瑟、慕維廉等來往密切。1854年冬，他返回香港，被倫敦布道會聘為宣教士，為理雅穀牧師的助手。1858年，倫敦布道會出錢資助洪仁玕再赴天京，行前受到上海的英國傳教士聯名祝賀。洪仁玕任幹王後，傳教士深受鼓舞，認為他會“試圖以正統派的基督教義來指示、勸告洪秀全，改正洪秀全錯誤的宗教觀點”。因此，1860年8月後，相繼有10餘名外國傳教士去蘇州、天京訪問。
這時，英美當局不再禁止他們的傳教士進入太平天國控製的地區，改而通過他們去了解太平天國的宗教和通商政策。外國傳教士自己也說“在叛亂的事件上從來不給太平軍一絲一毫的臂助，或講一句鼓勵的話。傳教士在他們那裏無非是要搜集某些情報，教導他們更完備地了解真道，或勉勵他們放棄錯誤的見解，以及不合基督教道理的習俗”。對於教義上的分歧，洪秀全並沒有遷就外國傳教士。1861年3月訪問天京的英國傳教士艾約瑟，寫了一篇《上帝有形為喻無形乃實論》進呈，洪秀全則以自己在“異夢”中升天親見上帝一事作答。事後，艾約瑟說，“當英美傳教士對他提供意見要求修正他所頒布過的主張時，他總是簡單地說，放下先前教會的慣例約束。不論在任何事上對他怎樣說明，他總是和顏悅色地、可是堅決地加以反駁。”並說，太平天國官員已“看出他們自己與英美基督教徒的觀點大相懸殊”。