在此之前，朱元璋對李文忠的進言，十分樂於聽取，看成是股肱心腹的肺腑之言。可是現在，不論李文忠的話是否有道理，朱元璋都要認真咀嚼，看看其中是否隱藏著不可告人的陰謀陷阱。
有一天，李文忠對朱元璋誠懇地勸道：“陛下，人才難得，人命關天呀，還是多給人留一條生路為是啊！”朱元璋把臉一沉，告訴他說知道了。
過了一些日子，朱元璋決定裁減宦官，李文忠趁機勸諫道：“陛下鑒前代之失，不準宦官幹政，又裁減宦官員缺，真是天縱之聖。但據臣看來，宮中冗員依然過多，應該再裁減一些。”朱元璋一聽勃然大怒，把李文忠當麵斥責了一番。
李文忠一片忠心進言，卻遭到狠狠的叱責，後悔得狠捶自己的腦袋。戰戰兢兢地回到家中，李文忠始終猜不透，舅父突然對自己如此冷淡和厭煩，到底意味著什麼？
幾天後，一群武士闖進府來，將李文忠手下的幕僚全部都捉走了，後來，沒有經過審問便都給殺掉了。李文忠驚詫莫名，不知屬下犯了什麼罪過。這時，他突然想起了十幾年前在嚴州策劃叛逃的事情，莫非是那件事情東窗事發啦？可是，牽線的人早已經被滅了口呀，秘密應該不會被泄露出去呀？李文忠百思不得其解。
心裏的疑問解不開，李文忠越想越感到大事不妙。因此，他夜長難眠，飲食銳減，很快就懨懨病倒了。到了洪武十七年歲首，李文忠的病情越發嚴重，骨瘦如柴，臥床不起。
朱元璋派太子朱標前去探病，朱標噓寒問暖，關懷備至。接著，朱元璋又派遣淮安侯華中，督理禦醫診斷治療。無奈，李文忠的病，是因驚懼憂慮而得，乃是心病，就算是華佗再世，恐怕也難以妙手回春，藥到病除。
正月二十七日，朱元璋駕臨探視。李文忠見舅皇駕臨，枯黃的瘦臉上掠過一絲希望的光彩。他強打起精神，要家人扶起來見駕，朱元璋急忙上前製止。他坐到床前，仔細地詢問外甥的病情。
李文忠喘息著，斷斷續續地答道：“舅舅，孩兒……恐怕，難以……為舅舅，盡忠，盡孝了。”
“不要這麼說，你會好起來的。”朱元璋蹙著眉頭進行安慰。
李文忠深受感動，凹陷的眼角滲出了兩行熱淚，喘息著答道：“孩兒在嚴州任職十多年，很得……舅舅的信任。可是孩兒，卻有一件……一件愧對舅舅的事。這件事情，長久地壓在孩兒的心中，一直不敢……”說到這裏，李文忠嘴角抽搐，哽咽難言。
朱元璋安慰道：“孩兒，那都是過去的事了，舅舅什麼都知道，如果不肯寬容你，把什麼事都記在心上，你也成就不了後來的功業。舅舅今天給你帶來了禦醫調製的保春回陽丹，你服了後，很快就會複原的。”
“孩兒，不知怎麼……感謝舅舅的……再造之恩。等孩兒……病好了……一定百倍、千倍地……報答……報答你老人家。”
“不要勞神多說話，你就安心靜養吧。”朱元璋說道。看到外甥的虔誠與痛苦，朱元璋神色憂戚地站了起來，急匆匆地離開了。
當壓在心底的一塊石頭落了地時，李文忠倍感輕鬆。家裏人更是無比興奮，皇上駕臨，聖恩隆渥，而且帶來了靈藥，一家人趕忙給李文忠服下皇上親自送來的“保春回陽丹”。
但是，誰都不曾想到的是，在皇帝探視後的第三天夜半，叱吒風雲二十載、戰功赫赫的大將軍，竟然撒手人寰！這年，李文忠才44歲。噩耗傳來，舉朝震驚。剛剛聽說皇上親自探視後，大將軍病情好轉，怎麼會猝然而死呢？
正在朝野迷惑不解之際，給李文忠看病的郎中及其親屬100餘口，也被抓起來處死了。公布的罪名是：借看病之機暗下毒鴆，毒死了曹國公。欲蓋彌彰的朱元璋所做的一切，也露出了自己的狐狸尾巴。不然，他為什麼要殺郎中的全家滅口？這個留給曆史的“謎團”，在明眼人看來，根本不是謎。