費用效果分析既可以應用於財務現金流量，也可以用於經濟費用效益流量。用於財務現金流量，主要是進行項目各個環節的方案比選和項目總體方案的初步篩選；用於經濟費用效益流量，除了可以進行上述方案比選、篩選之外，對於項目主體效益難以貨幣化的，則取代費用效益分析，並作經濟分析的最終結論。所以本章主要介紹經濟費用效益分析方法。
（四）經濟費用效益評估與項目財務評估的關係
經濟費用效益評估與項目財務評估相互聯係，它們之間既有共同之處，又有區別。
1.經濟費用效益評估與項目財務評估的共同點
（1）評價目的相同。兩者都是從費用和效益角度進行分析，都是尋求以最小的投入獲得最大的產出。
（2）評價基礎相同。兩者都是在完成產品需求預測、廠址選擇、工藝技術路線和工程技術方案論證、投資估算和資金籌措等基礎上進行的。
（3）基本分析方法和主要指標的計算方法類同。兩者都采用現金流量分析方法，通過基本報表計算淨現值、內部收益率等指標。
2.經濟費用效益評估與項目財務評估的區別
（1）評價的經濟係統的邊界不同。財務效益評估是從項目財務角度對項目進行分析，考察項目的盈利能力和貸款償還能力等內部經濟效果，其係統分析的邊界就是項目自身；經濟費用效益評估是從國民經濟的整體利益出發，分析項目對整個國民經濟乃至整個社會產生的效益，也就是分析國民經濟對這個項目付出的代價（成本），以及這個項目建成之後可能對國民經濟作出的貢獻（效益），其係統分析的邊界是整個國家。
（2）評估的目標不同。財務效益評估以企業的淨利潤為目標；經濟費用效益評估的目標是對社會福利和國家基本發展目標的貢獻及資源有效利用和合理分配。
（3）費用與效益的含義和範圍劃分不同。財務效益評估是根據企業直接發生的財務收支，計算項目的費用和效益；經濟費用效益評估是根據項目所消耗的有用資源和對提供的有用產品（包括服務）來考察項目的費用和效益。有些在財務效益評估中列為實際收支的如稅金、國內借款利息和補貼費，在經濟費用效益評估中不作為費用或效益。財務效益評估隻考察其直接費用和直接效益，經濟費用效益評估除考察直接費用和直接效益外，還要考察項目所引起的間接費用和間接效益。
（4）計算的價格和參數不同。財務效益評估采用國內現行市場價格，將行業基準收益率或國家長期貸款利率作為折現率，采用國家規定的官方彙率；經濟費用效益評估采用近似社會價值的經濟合理價格（影子價格）、社會折現率或國家基準收益率作為折現率，並且使用國家調整彙率（影子彙率）。
（5）評價結論的效力不同。由於財務評估以企業利益為出發點，而經濟費用效益評估則以國家利益為出發點，因而在評估中經濟費用效益的結論對項目的最終決策具有更大的作用。財務評估結論與經濟費用效益評估結論有以下幾種情況：
1）財務評估與經濟評估結論都表明項目可行，項目應予以通過。
2）財務評估與經濟評估結論都表明項目不可行，項目應予以否定。
3）財務評估表明可行，而經濟評估結論表明項目不可行，項目一般應予以否定。當然，也可以通過修改總體建設方案，使項目從國民經濟角度考察也可行。
4）財務評估結論表明項目不可行，經濟評估結論表明是個好項目，則項目一般應予以推薦。但是，一個財務上沒有生命力的項目是難以生存的。因此，必要時可重新考慮方案，進行“再設計”，使其具有財務生存能力。對於某些國計民生急需、經濟費用效益好而財務效益欠佳的項目，可建議采取某些優惠措施，如通過改變項目的稅率或利率以及實行政策性補貼等措施，使其也能具有財務生存能力。
（五）費用效益（效果）識別的基本原則
劃分項目的費用與效益（效果），是相對於項目的目標而言的。經濟費用效益（效果）評估是從整個國民經濟增長的目標出發，以項目對國民經濟的淨貢獻大小來考察項目。據此，凡是增加國民生產總值的，均計為項目的效益（效果），凡是減少國民生產總值的，均計為項目的費用。在考察項目的效益（效果）與費用時，應遵循效益（效果）和費用計算範圍相對應和可比性的原則。費用和效益（效果）可分為直接費用與直接效益（效果）及間接費用與間接效益（效果）。
（六）經濟費用效益評估的步驟
一般地，經濟費用效益評估是在財務評估的基礎上通過調整來完成的，主要包括以下幾個步驟：
1.效益和費用範圍的調整。包括剔除轉移支付，計算直接效益和直接費用及間接效益和間接費用。
2.效益和費用數值的調整。包括固定資產投資、流動資金、經營成本和銷售收入的調整。這些調整可通過影子價格的計算完成。
3.編製經濟費用效益評估的基本報表。包括編製經濟費用效益流量表，並據此計算全部投資經濟內部收益率和經濟淨現值指標。同時還需要編製投資費用估算調整表、經營費用估算調整表、銷售收入估算調整表、間接費用和間接效益等輔助報表。
有些較難進行財務評估的公益性項目，可以直接進行經濟費用效益（效果）評估。
二、直接效益與直接費用
（一）直接效益
項目的直接效益是由項目本身產生，由其產出物提供，並用影子價格計算的產出物的經濟價值。項目直接效益的確定分為兩種情況：