1525年春，萊茵河、多瑙河和萊希河之間的農民也奮起抗爭。
3月，士瓦本地區六支起義軍的領袖在梅明根城舉行集會，一致通過《十二條款》。他們要求廢除農奴的人身依附關係，廢除漁獵特權和死亡稅，限製過分的徭役、賦稅和地租，歸還強占公眾及個人的林地、牧場，消除司法及行政工作中的任意妄為現象，廢除什一稅和不合理的捐費以及要求選舉本地區牧師的權利。《十二條款》曆來被看成是“溫和的”、“有妥協性的”農民戰爭綱領，但貴族們沒有理睬。
3月末，法蘭克尼亞農民起義爆發，起義隊伍相繼奉《十二條款》為自己的綱領，並在這一綱領下聯合戰鬥，於是釀成了德意誌曆史上規模最大的、鬥爭最激烈的一場農民戰爭。起義軍攻占城堡和修道院，懲辦封建主，處死罪大惡極的黑芬斯坦因，一些有同情心的貴族和騎士也加入起義軍。與此同時，薩克森地區的農民在閔采爾的領導下，也發動了起義，他們推翻了城市貴族政權，建立了“永久議會”，閔采爾向人民宣傳鬥爭的遠大目標：消滅領主，財產公有，人人平等。號召人民“向前，向前，到了像打狗一樣地窮追猛打惡棍的時候了……不要讓你們的刀劍冷卻、變鈍”。一些封建主在勢頭凶猛的起義軍麵前手足無措，薩克森伯爵腓特烈悲歎：如果普通百姓的掌權是上帝的意誌，他將不會對此進行抵製。
功虧一簣的抗爭
起義之初，形勢對農民十分有利。南方的諸侯和封建主正忙於同法蘭西的戰爭，且“士瓦本聯盟”內部鉤心鬥角。相反，起義軍得道多助，一些市民、手工業者、教會下層神職人員也為他們提供幫助。一些城市在起義軍幫助下，奪得了城市自治權，不少城市為起義軍提供物資，來確保該城市不受侵犯。“士瓦本聯盟”的常備雇傭軍，較之當時的起義軍在力量上處於劣勢。
1525年3月，“士瓦本聯盟”允諾把農民的要求提交仲裁法庭裁決，起義軍同意停戰。實際上，這是“士瓦本聯盟”的緩兵之計，在與農民軍談判的同時，暗地裏集結和加強軍事力量。起義軍嚴守停戰約定，製定出《十二條款》準備提交法庭。十天後，“士瓦本聯盟”集結大軍，偷襲起義軍，士瓦本的起義軍同仇敵愾，敵軍在起義軍的反攻下節節敗退。這時，聯盟再次使出誘騙伎倆，起義軍聽信謊言，與“士瓦本聯盟”簽訂了合約，放走了遭困的敵軍。
聯盟把軍隊調往法蘭克尼亞鎮壓起義，不久反戈一擊，回頭來鎮壓士瓦本的起義軍。
在鎮壓士瓦本起義軍後，聯盟軍隊開始對付閔采爾領導的薩克森起義軍。1525年5月，閔采爾在弗蘭肯豪森戰役中兵敗被俘，五千餘人被殺。此時，起義軍原來的那些盟友也紛紛倒戈，騎士都掉過頭來屠殺農民，城市貴族和市民也開始與“士瓦本聯盟”談判城市的轉讓問題。在起義後期，農民戰爭在薩爾茨堡地區繼續進行。起義由蓋斯邁爾領導，1526年5月至6月，薩爾茨堡的農民軍多次打敗前來圍剿的巴伐利亞軍隊、奧地利軍、士瓦本聯軍和薩爾茨堡大主教的雇傭軍。最後，由於被優勢敵軍包圍，起義軍被迫於7月退到威尼斯，農民戰爭不得不接受失敗的結局。
1525年春，萊茵河、多瑙河和萊希河之間的農民也奮起抗爭。
3月，士瓦本地區六支起義軍的領袖在梅明根城舉行集會，一致通過《十二條款》。他們要求廢除農奴的人身依附關係，廢除漁獵特權和死亡稅，限製過分的徭役、賦稅和地租，歸還強占公眾及個人的林地、牧場，消除司法及行政工作中的任意妄為現象，廢除什一稅和不合理的捐費以及要求選舉本地區牧師的權利。《十二條款》曆來被看成是“溫和的”、“有妥協性的”農民戰爭綱領，但貴族們沒有理睬。