如有涉及數路的大戰事，則由朝廷將涉及的各路統一合編成“**軍”，由朝廷派出高級將領為帥進行指揮。比較特殊的是邊境上的邊防軍，他們直接被改編成了十支邊防路軍，暫時未做大規模調整。這也是怕被大金、西夏等占了便宜。
中央軍團還是以“禁軍”相稱，但卻分成了兩級。普通禁軍有八支名稱為兩個字的禁軍，每支禁軍有八千到一萬左右，都是從下麵挑選上來組成的，戰鬥力強於地方駐軍。他們的各級將領是從下麵選調上來的，都必須有在地方駐軍從軍的經驗。
最精銳的是皇室親領的近衛禁軍，一共有三支，名稱為“龍威”、“龍勝”、“龍成”。由皇帝或者指派皇室成員帶領，每支人數大概在三萬人左右，由現在的近衛軍改編而來；原以武林人為主的至勇軍也並入“龍威”軍。近衛禁軍的將領則是來自地方軍隊和下麵的普通禁軍，必須有軍旅經驗。
各級軍隊有軍、師、隊三層固定的編製，統兵官有將、指揮使、校尉三個級別，士兵分為軍兵和備軍兩級，每級又分若幹等，下級將領必須服從上級將領的指揮。每支軍隊中都有專門的後勤隊，主官為副將，負責非戰鬥類的後勤任務，隨軍醫官隊也包括在其中。
從地方駐軍以上，每一級最高的指揮機構都配備有謀士團，由精通兵略的文士組成。他們起到為將領提供作戰參考和分薄部分軍權的作用，這也是得益於天子趙昚和皇後虞水靈在太子行在設立謀士團的經驗。
如果領兵的將領不接受謀士團的建議，打贏了，謀士團不能分割軍功；如果打輸了，將領要承擔一定的責任。相反亦然，這樣既可以控製將領的胡亂作為，也可以防止謀士團的文士過於牽製將領的指揮。如果將領真的有了謀反之心，那謀士團可以起到牽製和分化的製橫作用。
設立懂得軍事的謀士團約束將領過於隨意的行為，比起軍權完全掌握在一名將領手中，或是設置不懂軍事的監軍來控製將領的行為，應該要好的多。
為了不影響軍隊的戰鬥力，以上的軍隊的軍製整頓從上往下進行，先動近衛軍，再動大宋的核心地區，邊境最後動，一層層的推廣開來。這樣，大宋現有的軍隊就從原來的一百九十多萬縮減成了七十萬左右，大大減輕了財政的壓力。
至於淘汰下來的大部分廂兵，皇太子在諸臣的建議下，並沒有把他們直接趕回地方，而是按照他們原來的歸屬，編成專門負責後勤的附屬大隊。凡完成了廂兵編製的地方，由廂兵負責原先百姓必須服的傜役，百姓可以用銀錢支付酬勞，價格由當地公論。
這樣，廂兵們可以有了收入，百姓們也用不著非得丟下自己的生計去服傜役。
至於原來那些二溜子、進廂兵就是為了混日子的，一律清除。
當然，軍製改革後，軍人不用再在臉上刺字，原先發配到軍中的罪犯不再從軍，而是改由當地廂軍監管，一同參加傜役服刑改造。
如此大規模的改變軍製，也得益於臨安武校多年培養的將領，現在大都在地方上任中級、低級軍官，高級將領中也都基本經過臨安武校的培訓。除非國家從此偏安一方，再無恢複之誌，否則軍製的改革勢在必行，這也是大家都清楚的事。
為了保證地方軍隊的變革不發生太大的變故，皇太子趙惇接受了部分臣子的建議，由臨安軍校的那些功勳老將出麵，每人負責一片。他們對朝廷的忠誠不用質疑，而且下麵的各級將領大多是他們的部下和學生，能夠保證大部分將領的忠心和服從。所以，軍製改革在軍隊中的阻力並不是很大。