光啟二年正月，僖宗駐蹕於寶雞，武皇自河中遣使上章，請車駕還京，且言大軍止誅凶黨。時田令孜請僖宗南幸興元，武皇遂班師。朱玫於鳳翔立嗣襄王煴為帝，以偽詔賜武皇，武皇燔之，械其使，馳檄諸方鎮，遣使奉表於行在。九月，武皇遣昭義節度使李克修討孟方立於邢州，大敗方立之眾於焦崗，斬首數千級。以大將安金俊為邢州刺史，以撫其降人。十月，進攻邢州，邢人出戰，又敗之。盂方立求援於鎮州，鎮人出兵三萬以援方立，克修班師。
光啟三年六月，河中節度使王重榮為部將常行儒所殺，武皇表重榮兄重盈為帥。七月，武皇以安金俊為澤州刺史。時張全義自河陽據澤州，及李罕之收複河陽，召全義令守洛陽，全義乃棄澤州而去，故以金俊守之。
文德元年二月，僖宗自興元還京。三月，僖宗崩，昭宗即位，以武皇為開府儀同三司、檢校太師、兼侍中、隴西郡王，食邑七千戶，食實封二百戶。河南尹張全義潛兵夜襲李罕之於河陽，城陷，舉族為全義所擄；罕之逾垣獲免，遂來歸於武皇。遣李存孝、薛阿檀、史儼兒、安金俊、安休休將七千騎送罕之至河陽。汴將丁會、牛存節、葛從周將兵赴援，李存孝率精騎逆戰於溫縣。汴人既扼太行之路，存孝殿軍而退。騎將安休休以戰不利，奔於蔡。武皇以罕之為澤州刺史，遙領河陽節度使。十月，邢州孟方立遣大將奚忠信將兵三萬寇遼州，武皇大破之，斬首萬級，生擒奚忠信。
龍紀元年五月，遣李罕之、李存孝攻邢州。六月，下磁州。邢將馬溉率兵數萬來拒戰，罕之敗之於琉璃陂，生擒馬溉，徇於城下。孟方立恚恨，飲鴆而死。三軍立其侄遷為留後，使求援於汴。汴將王虔裕率精甲數百入於邢州，罕之等班師。
大順元年，遣李存孝攻邢州，孟遷以邢、洺、磁三州降，執汴將王虔裕三百人以獻。武皇徙孟遷於太原，以安金俊為邢洺團練使。三月，昭義軍節度使李克修卒，以李克恭為潞州節度使。是月，武皇攻雲州，拔其東城。赫連鐸求援於燕，燕帥李匡威將兵三萬以赴之，戰於城下，燕軍大敗。時徐州時溥為汴軍所攻，遣使來求援，武皇命石君和由兗、鄆以赴之。
五月，潞州軍亂，殺節度使李克恭，州人推牙將安居受為留後，南結汴將。時潞之小將馮霸擁叛徒三千騎駐於沁水，居受使人召之，馮霸不至。居受懼，出奔至長子，為村胥所殺，傳首於霸；霸遂入潞州，自為留後。武皇遣大將康君立、李存孝等攻之，汴將朱崇節、葛從周率兵入潞州以固之。是時，幽州李匡威、雲州赫連鐸與汴帥協謀，連上表請加兵於太原，宰相張浚、孔緯讚成其事。六月，天子削奪武皇官爵，以張浚為招討使，以京兆尹孫揆為副，華州韓建為行營都虞候，以汴帥為河東南麵招討使，幽州李匡威為河東北麵招討使，雲州赫連鐸為副。汴將朱友裕將兵屯晉、絳，時汴軍已據潞州，又遣大將李讜等率軍數萬，急攻澤州，武皇遣李存孝自潞州將三千騎以援之。汴將鄧季筠以一軍犯陣，存孝追擊，擒其都將十數人，獲馬千餘匹。是夜，李讜收軍而退，大軍掩擊至馬牢關，斬首萬餘級，追襲至懷州而還。存孝複引軍攻潞州。
八月，存孝擒新授昭義節度使孫揆。初，朝廷授揆節鉞，以本軍取刀黃嶺路赴任，存孝偵知之，引騎三百伏於長子縣崖穀間。揆建牙持節，褒衣大蓋，擁眾而行，存孝突出穀口，遂擒揆及中使韓歸範，並將校五百人。存孝械揆等，以組練係之，環於潞州，遂獻於武皇。武皇謂揆曰：“公搢紳之士，安言徐步可至達官，何用如是！”揆無以對，令係於晉陽獄。武皇將用為副使，使人誘之，揆言不遜，遂殺之。
九月，汴將葛從周棄潞州而遁，武皇以康君立為潞州節度使，以李存孝為汾州刺史。十月，張浚之師入晉州，遊軍至汾、隰。武皇遣薛鐵山、李承嗣將騎三千出陰地關，營於洪洞，遣李存孝將兵五千，營於趙城。華州韓建以壯士三百人冒犯存孝之營，存孝追擊，直壓晉州西門，張浚之師出戰，為存孝所敗，自是閉壁不出。存孝引軍攻絳州。十二月，晉州刺史張行恭棄城而奔，韓建、張浚由含山路遁去。
大順二年春正月，武皇上章申理，其略曰：“臣今身無官爵，名是罪人，不敢歸陛下籓方，且欲於河中寄寓，進退行止，伏候聖裁。”天子尋就加守中書令。《歐陽史》：二月，複拜克用河東節度使、隴西郡王，加檢校太師、兼中書令。是月，魏博為汴將葛從周所寇，節度使羅宏信遣使來求援，武皇出師以赴之。
三月，邢州節度使安知建叛，奔青州。天子以知建為神武統軍，自棣州溯河歸朝。鄆州朱瑄邀斬於河上，傳首晉陽。以李存孝為邢州節度使。四月，武皇大舉兵討赫連鐸於雲州，遣騎將薛阿檀率前軍以進攻，武皇設伏兵於禦河之上，大破之，因塹守其城。七月，武皇進軍柳會，赫連鐸力屈食盡，奔於吐渾部，遂歸幽州，雲州平。武皇表石善友為大同軍防禦使。邢州節度使李存孝以鎮州王熔托附汴人，謀亂河朔，北連燕寇，請乘雲、代之捷，平定燕、趙，武皇然之。八月，大搜於晉陽，遂南巡澤、潞，略地懷、孟，河陽趙克裕望風送款，請修鄰好。九月，蒐於邢州。十月，李存孝董前軍攻臨城，鎮人五萬營於臨城西北龍尾崗。武皇令李存審、李存賢以步軍攻之，鎮人大敗，殺獲萬計，拔臨城，進攻元氏。幽州李匡威以步騎五萬營於鄗邑，以援鎮州，武皇分兵大掠，旋軍邢州。