乙肝病毒最常用的血清學標誌是：乙肝表麵抗原（HBsAg）、乙肝表麵抗體（抗-HBs）、乙肝e抗原（HBeAg）、乙肝e抗體（抗-HBe）、乙肝核心抗體（抗-HBc）。即“兩對半”，或稱乙肝病毒5項。
（1）乙肝表麵抗原：是乙肝病毒的外殼蛋白，本身不具有傳染性，但它的出現常伴隨乙肝病毒的存在，因此它是已感染乙肝病毒的標誌。它可存在於患者的血液、唾液、乳汁、汗液、淚水、鼻咽分泌物、精液及陰道分泌物中。在感染乙肝病毒後2～6月，當丙氨酸氨基轉移酶升高前2～8周時，可在血清中測到陽性結果。急性乙型肝炎患者大部分可在病程早期轉陰；慢性乙型肝炎患者該指標可持續陽性。
（2）乙肝表麵抗體：是對乙肝病毒免疫和保護性抗體。常在乙型肝炎恢複後期出現陽性。此時乙肝表麵抗原已轉陰數月。血清中乙肝表麵抗體滴度越高，保護力越強，持續時間也越長（3～5年以上）。再次感染乙肝病毒後，乙肝表麵抗體可在2周內滴度明顯升高。但也有乙肝表麵抗體陽性而又發生乙型肝炎者，這種情況可能為不同亞型感染。90％接受乙肝疫苗注射者的乙肝表麵抗體可轉陽。極少數情況下表麵抗原和抗體均為陽性，常見於不同亞型的乙肝病毒感染；免疫功能低下的患者，血液中的乙肝表麵抗體常不能處理表麵抗原；或是感染了S基因發生了變異的乙肝病毒。
（3）乙肝e抗原：在乙肝病毒感染後表麵抗原陽性同時或其後數日可測得乙肝e抗原。乙肝表麵抗原在血內高峰期亦是乙肝e抗原的高峰期。在肝炎症狀出現後10周內逐漸下降，在乙肝表麵抗原轉陰前可先轉陰。假如乙肝e抗原持續陽性，則可發展為慢性持續性感染。乙肝e抗原陽性說明乙肝病毒在體內複製活躍，傳染性強。在慢性乙型肝炎患者中，乙肝e抗原指標轉陰而乙肝e抗體轉陽過程中臨床上可出現明顯的肝功能惡化。極個別情況下可見乙肝表麵抗原陰性而乙肝e抗原為陽性。
（4）乙肝e抗體：在乙肝e抗原轉陰後數月出現乙肝e抗體陽性。乙肝e抗體陽性預示患者的傳染性已顯著或相對降低。病毒複製程度已降低或明顯緩解。近年發現個別乙肝e抗體陽性，但乙肝病毒核糖核酸（HBVDNA）亦為陽性者的病情遷延不愈，這是感染了變異的乙肝病毒所致，臨床上不可忽視。
（5）乙肝核心抗體：通常在乙肝表麵抗原出現後3～5周，肝炎症狀出現前即可在血清中檢出。高滴度的乙肝核心抗體陽性常標誌乙肝病毒正在複製，有傳染性。可持續存在數年至數十年。低滴度的乙肝核心抗體表示乙肝病毒既往感染。
十一、檢測乙肝表麵抗原的常用方法
乙肝表麵抗原檢測的方法在不斷發展，特異性和敏感性（檢出率）也有明顯提高。例如對流免疫電泳（CIEP）法和補體結合試驗（CF）法比瓊脂免疫擴散（1D）法要敏感20～100倍，可檢測到每毫升中含有1微克以上的表麵抗原顆粒。而反向被動試驗（RPHA）又比對流免疫電泳和補體結合試驗敏感10～100倍，可檢出每毫升血清中所含的0．1微克以下的表麵抗原。還有固相放射免疫法（RIA）和酶聯免疫法（ELISA），則可檢出每毫升血清中所含的2‰～5‰微克的表麵抗原。因此假如同一患者在甲、乙兩地檢查結果不同時，首先要了解檢測方法是否一致。除了方法不同，敏感性不一樣，不同地區的檢驗還可能有誤差。假如不了解檢測方法而單純看檢驗結果，或根據表麵抗原的滴度增減或轉陰、轉陽而情緒波動，不相信醫生或武斷停止用治療藥物都是沒有必要，甚至是錯誤的。
一般在專科或傳染病醫院檢測乙肝表麵抗原的方法都比較敏感，有些肝病研究中心的檢測手段反複更新，方法比較先進，對乙肝表麵抗原陽性者不容易漏檢。
為正確判別肝功能是否正常，乙肝表麵抗原是否真正轉陰，近期改用的藥物是否真正有效，最好選擇一些設備條件較好的醫院進行檢查；對檢出的結果一定要問清采用什麼檢驗方法，以便前後結果可以相互對照，作為診治疾病的參考。
十二、單項乙型肝炎核心抗體陽性的意義
單項乙型肝炎核心抗體（抗-HBc，簡稱乙肝核心抗體）陽性者，在一般人群的檢出率為0．1％～20．0％。檢出率的差別與不同國家、地區的乙型肝炎感染率高低及檢測方法不同有關。
單項抗-HBc（在二對半中查出）陽性，在乙型肝炎低發地區，一些過分敏感的檢驗中曾被解釋為假陽性外，在乙型肝炎高發區，發現的單項抗-HBc陽性者仍認為是乙肝病毒感染的指標。單項抗-HBc陽性與乙肝病毒感染相關，至少有如下3種可能性。
（1）急性乙型肝炎病毒感染的“窗口期”，乙型肝炎表麵抗原（HBsAg）已被人體免疫清除，或在血中消失，而乙型肝炎表麵抗體（抗-HBS）尚未產生之時。二對半檢查僅可見抗-HBc陽性。
（2）慢性乙型肝炎感染或乙肝病毒無症狀攜帶狀態，HBsAg水平很低，用一般的血清學方法不能檢測出HBsAg。