也許，我的決定受到了我8年白宮生涯的影響。在這8年裏，我在賓夕法尼亞大街另一頭的白宮，親眼目睹了我的丈夫是如何應對國家麵臨的挑戰的。首先，我希望本屆總統或者將來的每一位總統都能盡最大的努力，使我們的國家在聯合國或戰爭中處於領導地位。第二點，我們的國家團結一致地支持總統向恐怖分子和大規模殺傷性武器發動戰爭，對此，我希望薩達姆·侯賽因不要誤解。第三點，對於我們軍隊裏的男女將士們，我希望他們能夠知道，如果他們被號召參加伊拉克行動，我們整個國家都將成為他們堅實的後盾。
當希拉裏和其他支持軍事行動的民主黨人清楚地看到伊拉克局勢正成為一場災難時，她的語氣和措辭發生了變化——盡管晚於她的許多民主黨同僚。希拉裏說：“如果當時我便知道現在發生的一切，那就不會有這項表決，我也就永遠不會投票授權總統。”
希拉裏聲稱，她沒有想到，美國會在她表決之後馬上便發動了戰爭。她一直認為，總統應當竭力促使聯合國武器調查人員重返伊拉克，確定薩達姆製造大規模殺傷性武器的能力。2006年，希拉裏說：“是的，我已經說過，他‘濫用’了授予他的職權。在當時表決時，我曾很清楚地提到過，這不是一項關於先發製人發動戰爭的表決；我認為，這項表決旨在通過外交努力獲得勝利，因為總統和國會之間應當同心協力要求聯合國安理會恢複對伊拉克的武器調查。現在回想起來，我們能明顯看得出，總統和副總統及其幕僚們很可能並不希望武器調查人員恢複他們在伊拉克的工作。”
當時，據前克林頓政府的國家安全官員們說，在伊拉克問題上，希拉裏聽取了她丈夫以及他的國家安全顧問桑迪·伯格的建議。他們兩人都認為，希拉裏應當支持總統進行表決。不久之後，理查德·霍爾布魯克也加入到了她的國家安全顧問團，繼續協助希拉裏在戰爭問題上發表聲明和表明立場。
一名前克林頓政府的官員說：“她的想法體現了她在白宮8年政治生活的經驗。她曾經是總統的左膀右臂，她知道情報工作的嚴肅性。她熟悉並且非常同意總統的一句話：‘有些事情我們雖然知道，但不能說……這是一個對世界安全造成極大威脅的政府。’當時，由於懷疑這個國家藏有大規模殺傷性武器，她的丈夫對其實施了轟炸。”
盡管幾乎所有的其他參議員都明白，這一表決根本沒有授權布什不經過聯合國便發動對伊拉克的戰爭，但希拉裏堅持認為，她對這件事有不同的字麵上的理解，布什總統將會考慮到這一點。希拉裏說：“10月7日，布什總統在辛辛那提的講話中提到了這一點。10月8日，他們打電話把我叫到白宮，又一次向我說明了情況。當我回到辦公室時，康多莉紮·賴斯（國家安全顧問）打電話問我是否有什麼問題。我說：‘是的，有一個問題，如果總統得到了授權，他還會要求聯合國派遣調查人員到伊拉克看看薩達姆究竟在做些什麼嗎？’賴斯說，‘是的，這就是授權的目的。’其實，在私下和公開場合，她們也對此爭論過。”
按照布什政府官員和希拉裏下屬們的說法，希拉裏和賴斯曾對這一表決的意思進行過討論。但最終的結果是，布什的政府官員們聲稱賴斯沒有做出此類保證，而希拉裏的幕僚們卻堅持說賴斯的確保證過。
克林頓的一名前助理說了句公道話：“她們兩人都不夠坦率。”
通過努力，在其參議員任期的第三年裏，希拉裏成功當選軍事委員會委員。這對一名第一任期內的參議員來講已經是非常罕見了。她當選後做的第一件事情，便是禮節性拜訪了國防部長唐納德·拉姆斯菲爾德。
從希拉裏與其顧問的談話中可以明顯看出，希拉裏擔任軍事委員會委員一職意在為其競選總統積累威信。她有意要了解國防事業，以增添自己的剛猛之氣，並使自己成為一個使人感覺高深莫測的政策、武器及戰略專家。這不僅將在總統大選中打消選民們對其作為一名女性擔任三軍統帥的疑慮，而且她一旦當選總統，也將使她受益匪淺。她接受了克林頓的教訓，決意在這方麵予以加強（她得到了包括其丈夫在內的許多人的建議）。她從一開始便設想能夠依靠民主黨自由派，而挑戰性的工作在於如何去爭取共和黨溫和派中搖擺不定的選民。
希拉裏競選總統引人注目的地方在於，由一個女人掌權，前總統丈夫幕後運籌的新的克氏政府將會如何統治這個國家。毫無疑問，克氏統治將繼續延續合夥公司式的管理方式。至於她的婚姻，人們仍像從前那樣一無所知，也許隻有他們自己最清楚。他們的朋友也會像從前一樣無法弄清楚，他們夫婦中間某一個人的觀點會不會是來自於另外一個人的。
在準備2006年的參議員改選時，希拉裏召集了一個團隊為其總統選舉做準備工作，並成立了一家大型籌款機構和軍事基金，製定了一套策略以迅速改變目前人們對民主黨候選人激烈反對的現狀。這套策略預計，伊拉克戰場將會是一場持久戰。