老李萬萬沒有料到，城內的維民竟然趁著自己出城作戰，而發動叛亂，攻擊守城部隊。幸虧常勝軍武器優良，城內維民手中別說火器了，就連刀槍都有限，所以短期內城內暴民還無法奪取城門。
李明峰見狀，氣的一跺腳，大罵道：“媽的，回城！”
除了劉銘傳繼續追擊之外，殘餘的兩萬多常勝軍立刻回城。此刻城內火光衝天，阿克蘇的七八萬居民正在城內追殺老李留在城內防守的三千士兵，常勝軍這兩萬人馬返回阿克蘇之後，老李也不再講什麼寬容了，直接下令鎮壓反叛。
李明峰下令道：“無論男女老幼，凡是反叛的，一律殺掉！”
“是！”韋誌俊和李秀成應道。
這兩人都是反賊出身，向來嗜殺，現在李明峰下達這種命令，正和他們心意。
這場廝殺，倒更像是屠殺，阿克蘇百姓連正經的武器都沒有，如何能對抗擁有火器的常勝軍？從午夜殺到第二天淩晨，城內的反叛基本全被鎮壓了下去。
因為常勝軍受創過重而處於暴怒狀態的老李此刻也下了狠心，將城內還活著的五萬維民進行了清洗，年紀超過四十歲的，無論男女一律殺掉，不足十歲的男性孩童也一律殺掉。身有疾病的，受傷的，也一律殺掉。
最終隻剩下精壯男女兩萬多人，都被李明峰用鐵鏈子捆上，關押到了一起。還有兩三千維族不足十歲的小女孩，也被李明峰給囚禁了起來。
老李派兩千士兵負責看守，下達了死命令，一旦察覺有試圖逃跑和反抗的，直接擊斃。這樣一來，整個阿克蘇頓時死氣沉沉，被囚禁的暴民反倒更加的恭順了起來。李明峰心中也是感慨，看來以德服人還是不如以力服人！
此時老李還沒有想到，這次的屠殺不但沒有給他帶來詬病，反倒會帶來讚美之聲。
第二天晚上，劉銘傳率領騎兵回城。李明峰通過劉銘傳的彙報得知，阿古柏已經逃入距離阿克蘇兩百裏之外的小城巴楚。
本來老李要是率領步兵從後麵追上的話，還能配合劉銘傳一同攻城。巴楚這小城根本沒有什麼城防，都是用土夯實的城牆，都經不起火炮攻擊。但是因為阿克蘇叛亂，打亂了老李的計劃，步兵沒能盡快支援，而騎兵又無法攻城，劉銘傳隻能放棄進攻巴楚。
阿古柏逃竄的倉促，他營寨之內遺棄了很多火炮和物資，現在都成了常勝軍的戰利品。不過，李明峰這次卻沒有覺得高興。因為經過戰後清點，常勝軍經過這一次戰役，傷亡士兵超過一萬兩千人，當先鋒的一萬北疆回兵更是全軍覆沒。
此刻常勝軍竟然隻剩下不到兩萬人馬了，再加上損失更加慘重的李秀成和司馬平的忠義軍，李明峰麾下的人馬經過清點，隻有兩萬八千人。刨除迪化城內還遺留的兩千士兵，老李從遼東帶出來的人馬足足損失了一半！
李明峰一邊讓伯錫爾繼續給北疆回王寫信，討要更多的士兵支持作戰，一邊處理此戰的後事，為即將到來的南征巴楚做準備。
玉努斯江本來被囚禁在阿古柏的軍營之中，阿古柏逃的倉促，竟然沒來得及殺掉玉努斯江，現在抱定必死之心的玉努斯江反倒落到了李明峰手中，僥幸逃得性命。
此刻玉努斯江就站在李明峰的麵前，不過，老李此刻臉上的表情可不怎麼友善。
“玉努斯江，你要歸降朝廷，我本應該重用你。可是現在你手中沒有一兵一卒，也沒有立下大功，你說我該如何對待你呢？”李明峰似笑非笑的道。