正當葉海亞準備拔刀自刎的時候，就聽遠處一聲炮響，阿克蘇城門大開，數萬人馬浩浩蕩蕩的衝了出來。
在最前頭的是北疆回兵，約有一萬人，其後就是劉銘傳率領的一萬騎兵，再往後就兩萬五千步兵，由蔡宜群、宋慶、韋誌俊、李秀成、司馬平帶領。
葉海亞見狀，心中大喜，高聲道：“清朝出兵討伐阿古柏了！阿古柏不能容我等，我等不如去投清朝！阿古柏氣數已盡，大家奮力殺敵啊！”
葉海亞此言一出，手下將領心中恍然，也知道葉海亞這是投靠了清朝了。但是己方此刻已經和阿古柏勢成水火，眾將想不投靠清朝也不可能了，隻能硬著頭皮殺敵。
阿古柏看到清朝出兵，也有些驚訝，他沒料到清朝竟然會為了一個隻有幾千人馬的反賊而出兵。雖然驚訝，但是清朝出兵也在阿古柏算計之中。
既然早晚都是打，而現在常勝軍全軍出城，放棄了地利，這對阿古柏來說反倒是好事一件。阿古柏命令拉希姆帶領兩萬人馬前去阻截李明峰，他自己則繼續摧動大軍，對葉海亞發起猛攻。
太陽升到中天，然後再逐漸偏西，幾支大軍在阿克蘇城外你來我往的廝殺。這一戰，是李明峰入疆以來戰鬥最慘烈的一次。葉海亞終於沒有抵擋住阿古柏的進攻，在下午三四點鍾的時候全軍覆沒，葉海亞被亂槍打死，屍首也被砍成肉泥。
拉希姆帶兩萬人馬去阻截李明峰，但是其兵力太少，擋了幾個時辰之後也支撐不住了。就在葉海亞陣亡的那一刻，拉希姆也被一枚炮彈擊中，被炸成碎屍。他麾下的兩萬人馬被李明峰這邊的北疆回兵和劉銘傳騎兵給衝殺的潰不成軍。
兵敗如山倒，阿古柏沒想到拉希姆的兩萬人馬這麼快就敗退了，所以他的主力部隊被潰兵一衝，反倒也失去了陣型。劉銘傳督率大軍，奮勇上前，殺到午夜，阿古柏終於堅守不住，大軍潰退。
這一戰，殺的阿克蘇城外方圓數十裏內血流成河，鮮血染紅了黃沙，阿克蘇城內的沙漠成了紅色，被月亮一照，顯得是那麼恐怖駭人。屍體堆積如山，殘肢斷臂遍地都是，無論是常勝軍還是回兵都損失慘重。
李明峰在後軍之中，看到前方如此慘烈，心頭也忍不住肉痛。不用具體清點，隻看地上的屍體就知道這一戰至少陣亡了上萬常勝軍士兵。但是這些損失是值得的，因為阿古柏一夥損失更大，大戰過後，阿古柏僅僅率領數千人馬向西南方向遁逃。
不用老李下令，劉銘傳自己就帶領五六千騎兵追了下去。喀什距離此地還有千裏距離，三五天之內阿古柏都休想得到援軍補充，如果順利的話，劉銘傳很可能會趁著這次機會將阿古柏殺死，結束新疆征程。
可是當李明峰正想命令步兵也乘勝追擊的時候，卻看到阿克蘇城內喊殺聲不絕，城頭上留守的常勝軍士兵紛紛跌樓城頭。城內火光衝天，槍聲不絕於耳，看來常勝軍士兵在城內遇到了麻煩。
伯錫爾見狀，驚道：“完了！城內的回子叛亂了！”
自從進了阿克蘇，伯錫爾就勸李明峰說南疆的維族生性彪悍，不服中央管轄，所以建議李明峰將城內的維族百姓全部驅逐，隻留士兵在城內居住。但是老李出於拉攏民心的考慮，否定了這個提議。
在李明峰看來，必須要保持民族平等，甚至要優待維族。正所謂以德服人，隻要老李對維族人寬厚，那阿古柏的分裂主義勢力就沒有了生存土壤。但是老李沒想到，竟然因為自己的仁慈而讓常勝軍陷入險地。