阿古柏與考爾巴斯簽訂了《喀什噶爾條約》，給予沙俄通商及旅行特權，並在南疆七城設立商務代表和商館，沙俄公開承認了“哲德沙爾汗國”。
英國豈能容忍沙俄捷足先登，次年派出由弗賽斯率領的使團，“它具有一支小型軍隊的規模，營地裏有三百人員和四百頭牲口”。弗賽斯把帶來的槍支、小炮和英國女王的親筆信等交給了阿古柏。包羅傑記載說，阿古柏幾次重複著“讚美真主”，接著又說：“你們的女王是一位偉大的君主，因為她總是以源源不絕的好處給予得到這種友誼的人。女王像太陽一樣，在她溫和的陽光裏，我們這樣的可憐人才能夠很好地滋長繁榮。我特別希望獲得英國人的友誼。從這裏到倫敦任何人都可以自由來往。”
1874年阿古柏和英國簽訂了《英國與喀什噶爾條約》，英國承認“哲德沙爾汗國”為獨立國，英國得以在“哲德沙爾汗國”設立“大使”、“領事”。接著，阿古柏又得到英國步槍六萬支和修理廠的設備。
包羅傑評論說：“看來英國的巨大保護傘已經覆蓋了他的整個國家。英國在喜馬拉雅山外的政策中，第一次把它的保護伸延到它的自然邊界以北的一個當地國家。”
阿古柏又派使者朝見奧斯曼帝國蘇丹，表示願意奉奧斯曼帝國為宗主國。奧斯曼蘇丹立即封阿古柏為“艾米爾”，並給予“哲德沙爾汗國”大量軍火援助。
阿古柏有恃無恐，打著伊斯蘭聖戰的旗號，瘋狂地推行消滅“異教徒”的反動政策，四萬多名不信奉伊斯蘭教的漢族、滿族人民，慘死於阿古柏的屠刀之下。由此，把自己妝扮一個宗教的維護者。
即使信奉伊斯蘭教的柯爾克孜族人民，也被阿古柏推入水深火熱之中。柯爾克孜族民歌唱道：
黑色的貓頭鷹在頭頂上狂叫，
罪惡的戰火在草原上燃燒，
柯爾克孜人的家鄉流著鮮血，
大地母親，為她的兒子在痛哭號啕。
灰色的惡狼在白骨堆上嗥叫，
阿古柏的馬隊像黑風在咆哮，
柯爾克孜的太陽是誰搶去了，
大地母親，為她的兒子在痛哭號啕……
阿古柏在實行中世紀的那種野蠻宗教仇視和殘暴民族壓迫的時候，他還下令掠奪各族人民的土地，分賞給他的爪牙。凡是較完善的水利設施和肥沃的土地，以至冬季草場和夏季草場，全部被沒收，然後再賣給原先的權利人。
阿古柏政權橫征暴斂，賦稅和徭役名目繁多，農民四分之三以上的勞動成果被侵略者強取豪奪。阿古柏一夥在新疆各族人民的屍骨上築起他們荒淫的“天堂”，他們尋歡作樂的宮殿、行宮遍布各地，被掠奪的六百多名各族少女充作後宮，供他們淫樂。
奴隸製在阿古柏時代重演，淪為奴隸的農民在喀什、葉爾羌的市場上被廉價出賣，阿古柏本人就役使著三千名以上的奴隸。
清軍局促於塔城、奇台、巴裏坤、哈密地區，自保不暇，隻能坐視阿古柏和沙俄侵略者的鐵蹄在新疆橫行。
毛拉木沙在他所著的《伊米德史》中說：“南疆的維吾爾人在街頭巷尾成群結夥地在一起議論著漢人要來了的消息，不管這些消息是真還是假，人們總是按照自己的心願編織出許多故事，以悅人心，更悅己心。”喀什遠郊有個農民在犁地撒種子時，有人問他：“喂！朋友！請問你在種什麼？”撒種子的農民回答他說：“還有什麼？種的是漢族人。”他們懷念漢人，企盼從侵略者的奴役中解脫出來。
這是新疆各族人民迫切的願望和心聲。
清朝政府終於把使用武力征討阿古柏的入侵，提到了＋議事日程上。
受命於危難之時的曆史功臣，是清朝著名將領左宗棠。
當時，是否要籌組大軍西征新疆，對新疆是力保還是放棄，在清朝宮廷曾發生過一場激烈的論爭。
直隸總督李鴻章借口海防籌餉困難，提出放棄新疆，把準備西征的費用移作東南海防之用。他認為，不收複新疆，“於肢體元氣無傷，海疆不防，則腹心之大患愈棘”。他主張中國隻能“力保和局”，不能因進軍新疆而開罪英、俄兩大強國。