陳友諒一死，朱元璋又平定了張士誠和方國珍，就掌握了東南半壁江山。他覺得小明王已經沒有利用價值了，便將他暗害，龍鳳政權就此徹底結束了。
●元帝遁元朝滅亡
元朝末代皇帝元順帝是個非常昏庸無德的家夥，他的軍隊和起義軍在外麵殺得不可開交，他卻在皇宮內尋歡作樂，每日也不上朝。皇太子愛猷識理達臘看不慣元順帝的這種做法，便聯合皇後與左丞相哈麻，要廢掉元順帝，自己登基理政。元順帝聽說哈麻要背叛自己，下令將哈麻充軍到廣東，暗中派人在路上把哈麻活活打死了。皇太子與皇後沒有成功，便又尋找機會準備下手。於是，宮廷裏就產生了內訌。
宮裏亂，宮外也不安定。在鎮壓農民起義軍的過程中，一些元將擁兵自重，像擴郭帖木兒（本名叫王保保，是察罕貼木兒的幹兒子）、孛羅帖木兒、李思齊、張良弼等都各占一方，根本不把元順帝放在眼裏。這些人為了多占地盤，經常發生摩擦。元順帝多次下詔，讓他們停止自相殘殺，可擴郭帖木兒和孛羅帖木兒不僅不聽元順帝的命令，反而鬥得更凶了。元順帝無可奈何，自己手中沒有多少軍隊，還得依靠這些將領們對付各地的起義軍，隻得睜一隻眼閉一隻眼，得過且過。
沒過多久，宮廷裏的鬥爭就和外麵的鬥爭聯係了起來。這一下可就熱鬧起來了，元順帝要依靠孛羅帖木兒和張良弼便事事支持他們，皇太子卻和擴郭帖木兒、李思齊結成一派，宮廷上下內外鬧個不停。後來，孛羅帖木兒被太子派殺掉了，擴郭帖木兒掌握了軍權。李思齊見年紀輕輕的擴郭帖木兒居然爬到自己的頭上，很不服氣，便聯合張良弼等將領，一起對付擴郭帖木兒，兩派在關中對峙，大大小小一共打了一百多仗，沒爭出個高低，可是都損失了不少人馬。
這時，朱元璋在應天一麵作北伐的準備工作，一麵觀察著北方的動靜。他看到元朝內部矛盾重重，已經沒有多大的實力了，知道消滅元朝的機會到了。公元1367年，朱元璋公布了北伐檄文，在檄文裏他指斥元順帝昏庸無道，元朝的氣數已完了，上天派他來帶領人民把蒙古貴族趕出中原，重建漢人的政權，拯救黎民。隨後，他委任徐達為征虜大將軍，常遇春任副將軍，統領25萬大軍，向元朝發動總攻。
徐達沒費多大勁就收複了山東、河南，元朝的軍隊不是逃跑就是投降，根本就無法阻擋北伐軍的進攻。公元1368年，朱元璋在應天登基即位，定國號“明”，建元“洪武”。明朝正式建立了。
此時，明軍已攻取了潼關，大都（今北京）已經很危急了。但是，擴郭帖木兒卻將軍隊駐紮在太原，不援救大都。李思齊與張良弼見明朝的軍隊如此厲害，便帶著殘兵敗將向西逃跑了。這年七月，各路明軍在山東德州會師，然後分水陸兩路沿著運河北伐，幾十萬大軍殺奔大都。一路連奏凱歌，先攻下了長蘆、青州，然後攻破直沽。直沽失守的消息傳到宮中，元順帝嚇得寢食不安。很快，通州又失守了。通州是大都的最後一道屏障，通州易主，大都就成了明軍的囊中之物。
元順帝詢問文武大臣們的意見，一個叫伯顏不花的太監哭著說：“大都是世祖留下的京城，陛下應該死守藝我們願意率領禁衛軍去城外抵抗明軍，請求陛下固守京城！”元順帝略想一下，歎了聲氣，說：“局勢發展到這種地步，怎麼能像宋朝的徽宗和欽宗讓人家俘虜呢！”一天夜裏，元順帝帶領後妃、太子和文武大臣一百多人，自建德門奔出了大都，逃向北方茫茫的草原。
幾日之後，明軍攻克了大都，元朝滅亡。朱元璋將大都改稱北平，明朝取代了元朝。元朝自成吉思汗建國，至元順帝北逃，共存在了162年，曆16帝。
●朱元璋登基封王
在江淮一帶站穩腳跟後，朱元璋打敗了西邊的陳友諒，又消滅了東邊的張士誠，隻剩下南邊幾股小勢力。徐達派湯和攻打方國珍，方國珍一看大軍壓境，隻好投降。湯和又揮師南下，奪取廣東。與此同時，胡廷瑞奪取了福建，廣西也被大將楊璟攻下。朱元璋終於統一了長江以南的半壁江山，心滿意足。李善長認為朱元璋已統一了半壁江山，可以稱帝了，便率領文武百官三次請求，朱元璋這才答應稱帝。
公元1368年，朱元璋在應天（今南京）稱帝，定國號為明，建元洪武，朱元璋是為明太祖。從此把應天改稱為南京，立結發妻子馬秀英（郭子興的養女）為皇後，又立長子朱標為皇太子。
公元1368年，徐達帶領幾十萬大軍直奔元朝京城。元順帝早已嚇得魂飛魄散，士兵們也早喪失了鬥誌，沒費多少兵力，徐達占領了京城大都（今北京）。至此，朱元璋統一了全國。
朱元璋很崇拜漢高祖劉邦，而劉邦又是自己的老鄉，所以他仿效劉邦治國的方法，把兒子封王，把功臣封公封侯。