為了把穆彰阿拉下首席軍機大臣的職位，載銓豁出去了，先自斷一臂，請皇帝將所有管理過銀庫的大臣都革職。因為自己也在戶部任過職，載銓請先革去自己爵位。道光一看這載銓是赤膊上陣，要和穆彰阿單挑，也不好袒護，下令將穆彰阿革職。可革職了沒幾天，道光又反悔了，找了個理由，將穆彰阿改為“革職留任”。載銓一看，皇帝你這不是坑爹麼？可是事已至此，無法挽回，隻好接受事實。
卻說這個賠錢，牽連的官員有三百餘人，人死了由兒子孫子減半賠。有的官兒相對清廉，沒撈到錢，碰巧也管過戶部，或查過銀庫，現在要賠巨額銀子，隻好到處磕頭借高利貸。有的官員為了借點銀子，和門生撕破臉皮，隻差兵戎相見了。曹振鏞執掌軍機處十四年，是道光最信任的臣子，雖然已死，兒子也被勒令減半賠出兩萬四千七百兩銀子。曹振鏞兒子交了一萬二千兩後病死，再由孫子繼續賠出剩下的銀子。
因為載銓的特別關心，穆彰阿要賠的銀子最多。不過他的門生都是達官貴人，哪裏會讓老師掏錢，一會兒功夫就把十一萬兩銀子給湊足了。穆彰阿不傻，一下子交出這麼多錢，不是自曝貪腐麼。遂按銀不動，手裏有十幾萬兩了還繼續哭窮，然後更多的銀子就來了。一直拖到道光二十四年，看到其他官兒們賠的差不多了，穆彰阿才哭哭啼啼地搬了銀子出來。
自道光讓大家一起賠銀子之後，朝野內外，罵聲一片。潘世恩、載銓的本意是把穆彰阿給拉下馬，沒想到牽連到這麼多親朋好友，出門時恨不得背個烏龜殼好縮在裏麵。原本管理戶部三庫，是個名利雙收的肥差，現在大吏們一提到這個差事，無不心驚肉跳，避之唯恐不及。軍機大臣祁寯藻受命管理戶部三庫事務，後來在年譜中，他還小心翼翼地添上一筆“時值庫虧案後”。
戶部銀庫案發之後，道光“愧恨忿急”，卻又無可奈何。道光二十三年，是道光朝財政最為吃緊的一年，此年國庫存銀不過三十五萬兩。但此年吃緊，並不是意味此後道光的日子就好過了，他還得麵對更為緊張的開銷。
當年軍機處擬定了幾項方法，以增加收入，節省開支。捐納收入是清廷的一個收入來源，此時開始鼓勵。以往捐納隻收現銀，為了籌集河工開支，此年開始準許捐納時交納實物，折算成銀錢。軍費開銷居高不下，而各地都忙著練兵，好騙道光的銀子。軍機處鼓勵各地編練鄉勇，既不花朝廷的銀子，又得了許多兵。原先各附庸國，如暹羅、越南、琉球等，原本是二年一貢，持續了百有餘年，每次都要賞給大量銀子。現在開始，改為四年遣使朝貢一次。地方官員們則被警告，如果不趕緊解上所欠錢糧，將要被暫行革職。
靠著道光的節省，軍機處的四處搜刮，大清勉強維持著，但國庫吃緊並未有根本改善。道光二十八年三月，負責管理戶部的軍機大臣潘世恩不得不向道光緊急上奏：“現在銀庫僅存銀十二萬三千九百餘兩，比較曆年，甚形支絀。”
麵對著國庫萎縮，財政拮據，道光左支右絀，一籌莫展，想不出可以從根本上扭轉的方法。他唯一的選擇就是節約，自己節約，國庫節約，舉國節約，靠著節約，熬過這局促的日子，待以時日，再走出這蕭條的穀底。站在擱淺的清國巨輪之上，極目四望，道光何其無奈，何其悲哀，而他的軍機大臣們，隻能奮力行舟，好多維持些日子。
道光二十九年的軍機處
有人是五行缺水，但道光的五行裏一定是水太滿了。他登基以來，各省水患不斷，河工開銷日昂。道光二十九年（1849）春，江蘇、安徽、浙江、湖北等省，都遭遇到前所未有的大水災。因為水患，蘇州饑民雲集，開始在城內搶劫糧食。常州府災民數千人，湧入城內求賑濟不得，轉而搶劫財物。浙江地方上也開始出現搶劫現象。
在當時的社會條件之下，受到交通工具的限製，地方官員隱瞞等係列因素影響，信息反饋極為緩慢。五月蘇州發生搶劫，七月軍機處得到消息。然而，軍機處的反應不是治災，而是治官。早在民變初起時，蘇州、常州城內商賈就已捐款救災，但款項卻未被用來賑濟災民，最終導致民變。軍機處隨即令江蘇巡撫嚴密調查，官員是否中飽私囊。
此年大雨連綿，水災不斷。四月京師下大雨，道光在召見軍機大臣時，特意囑咐道：“地麵濕滑，潘世恩可以不要來慎德堂，你們出行時亦當在意在意。”