除宗教改革外，埃赫那吞還對文藝特別關注。他對頌歌和雕刻藝術情有獨鍾，他指令宮廷雕刻師雕出他生活的“寫真”，捕捉他的一舉一動。埃赫那吞攜王後和子女乘著華貴的馬車赴神廟早祭的一瞬間被捕捉下來，製成了浮雕。埃赫那吞最喜愛的是一尊王後涅菲爾的彩繪頭像。王後的頭微向上仰，高聳的金邊青藍花帶王冠稍稍傾斜，而用玻璃製作的一雙炯炯有神的眼睛卻恰到好處地平視著，顯出王後無與倫比的高貴。埃赫那吞熱愛雕刻和壁畫，竟到了癡迷的地步。他把一切政事交給麻伊，軍事交給赫倫希克。
與埃赫那吞熱衷於藝術有些不合諧的是，埃及帝國的危機卻在不斷加深。由於埃赫那吞疏於治政，國家統治日益鬆弛了。這時，底比斯的僧侶暗地裏又集結起來，舉行了向阿蒙神的獻祭運動。百姓受租稅和勞役的雙重負擔，多有不滿。亞洲和努比亞地區被征服的居民頻頻騷動，巴勒斯坦人在北方新興的強國赫梯的支持下掀起了暴動，耶路撒冷忠於埃及的王公的告急信紛紛送到新都。
新王國危機四伏，埃赫那吞仍然脫離現實，繼續生活在自己的理想境界之中。他依然每日上午帶著王後和子女去神廟禱告獻祭，下午便在宮廷享受天倫之樂。一些正直的大臣們認為國王不能這樣繼續下去，國家需要埃赫那吞親自管理，才能和平安定。便聯名上書泰伊太後，請求他為帝國的利益勸說埃赫那吞改弦易轍，與阿蒙神僧侶和解，恢複國內的穩定。泰伊最了解自己的兒子，他認準的路是誰也改變不了的。她來到首都埃赫塔吞後，並不急於訴說此行的目的。
就在這時發生了一件事，埃赫那吞在和母親去阿吞廟祭祀的路上，遭遇了刺殺，所幸都沒有受傷。泰伊借此事勸阻兒子，歸還阿蒙僧侶的寺院財產，但好話說盡，埃赫那吞依然認為自己是正確的。為這件事，王後涅菲爾離開他搬到別處去了。泰伊知道再住下去也無濟於事了，於是叮囑兒子好自為之，太後帶著無限傷感，惆悵地離開了新都。
一意孤行的埃赫那吞依然那麼堅定。他派人通知駐守孟斐斯的軍隊統帥赫倫希布，將全國各地任何可能發生的騷亂扼殺於萌芽狀態之中，繼續嚴禁對任何非阿吞教的崇拜。公元前1362年，這位意誌剛強、性格固執的法老去世。他在臨死之前，想見見涅菲爾皇後的願望都沒有實現。
埃赫那吞死後，他的女婿圖坦卡蒙即位，由舊臣麻伊攝政。在阿蒙祭司的舊貴族壓力下，終止了阿蒙霍特普四世宗教改革。後來阿蒙神的僧侶重新掌握朝政，小王朝很快滅亡了。
埃赫那吞的改革雖然失敗了，但它沉重打擊了阿蒙祭司和世襲貴族勢力，給後世留下了寶貴的經驗和深刻的教訓。