當時嚴格限製出口貨物的種類和數量，凡馬牛、軍需、金、銀、銅、鐵、鉛、錫、銅錢、硫磺、書籍、糧食等都不準出口，而允許出口的絲綢、茶葉、大黃等也嚴格限製數量。
此外，清朝還規定，在廣州進行的中外貿易，必須通過官方指定的壟斷代理商行“十三行”進行，由它充當外國商人的全權代理人，包銷進口商品，代繳關稅，采購各類出口商品。
十三行行商既是外商在華行為舉止的保證人，也是中國官府與外國商人之間的中介人，外國商人的一切請求均由行商轉達，而中國官府對外國商人的一切政令要求也由行商傳達。十三行還在廣州城外開設“商館”，供外商作為來華貿易的辦事處和住所。
以上諸項海外貿易立法，束縛了民間海外貿易的開展，阻撓了中外正常貿易的進行，影響了社會經濟順利發展。
在行政立法方麵，在清朝行政管理體製中，皇帝仍握有至高無上的權力，一切軍政事務由其“乾綱獨斷”。
為了防止宦官專權和臣下結黨營私，清律嚴禁宦官參與政治，嚴禁大臣交結朋黨及內外官交結，犯者按“奸黨罪”處斬。在皇帝之下，仿明製設內閣，代擬批旨，呈進奏章。
內閣大學士名額不定，康熙時多用滿漢大學士4員，雍正時6員，乾隆時增協辦大學士一兩員。內閣大學士為正一品，位列百官之上，但實權遠不及明朝，僅僅具有上傳下達的職權。
在內閣之外，還設有議政王大臣會議、南書房等輔政機構。雍正即位後，因西北用兵而設立軍機處，取代傳統的議政王大臣會議，並侵奪了內閣的部分職權。軍機大臣位高權重，隻服從皇帝命令，是清朝君主專製極端化的標誌。
內閣與軍機處之下，沿襲明製設吏、戶、禮、兵、刑、工六部，分設滿漢尚書各一人，滿漢侍郎各二人，下置郎中、員外郎等屬官。六部長官對皇帝負責，隻能奏請皇帝頒發必要的詔令，無權向地方直接發布命令。
六部之外的院、寺、府、監均有較大裁並，九寺隻剩下審理刑獄的大理寺，管理祭祀的大常寺，管理馬政的太仆寺，以及管理典祀筵宴朝會的光祿寺和鴻臚寺；五監僅剩下掌國學政令的國子監；隻有培養封建統治人才的翰林院仍維持明朝時的地位。
地方政權機關分為省、道、府、縣4級。明朝臨時派遣的督撫已成為固定的省級長官，握有地方軍政大權，但必須秉承朝廷指示行事。布政使和按察使失去了明朝時行政上的獨立性，成為隸屬於督撫的分理地方民財和刑獄的兩個機關。
省下設道，作為省的派出機構，負責聯絡省與基層的關係，由道員主管政務。道下設府，由知府主管行政、經濟與司法等事務。與府平級的機構有廳和直隸州。府下設州和縣，州置知州，縣置知縣，由中央直接派遣。縣下設有征收賦稅錢糧的裏甲和防範盜賊的保甲。
在職官監察方麵，清朝基本沿襲明製，中央仍以都察院為監察機關，長官為左都禦史。為了集中皇權，將六科給事中並於都察院。
六科給事中與十五道監察禦史合稱“科道”，分別負責對京內外官吏的監察和糾彈，使監察機構實現一體化。當時有科道官密折言事製度，將軍機處以外的所有機關和官員都納入監察稽違的範圍之內。
1690年，康熙令左都禦史為議政大臣，參與朝政決策，充分發揮科道官作為皇帝耳目的作用。地方則由省按察使派出的“分巡道”和省布政使派出的“分守道”分別對府、州、縣官員進行監察，同時廢除了巡按禦史製度。
清朝的會審製度有所發展。除了從明朝的“九卿圓審”發展而來的九卿會審外，還製定了朝審、熱審和秋審製度。
審理的案件主要是刑部判決的案件，以及京城附近發生的斬絞監候案件。熱審的目的是加快笞杖刑案件的審理判決，疏通監獄，以防在暑熱天氣庾斃囚犯。秋審是清朝最重要的死刑複審製度，因為是在每年秋天舉行而得名。
秋審審理的對象是全國上報的斬監候、絞監候案件，案件經過秋審複審程序後，分四種情況處理：
第一，情實：罪情屬實、罪名恰當者，奏請執行死刑。
第二，緩決：案情雖屬實，但危害性不大者，可減為流3000裏，或減發煙瘴極邊充軍，或再押監候辦。
第三，可矜：指案情屬實，但有可矜或可疑之處，可免於死刑，一般減為徒、流刑罰。第四，留養承祀：指案情屬實、罪名恰當，但有親老丁單情形，合乎申請留養條件者，按留養案奏請皇帝裁決。