江西省議會知餘在鄂，乃開會選餘為江西都督，電請總理任命。總理即頒“任李烈鈞為江西都督”之令，電複贛省議會。贛人聞訊鼓舞，遂由議會領銜電促回贛，並示歡迎。電由黎都督轉交。黎派楚豫艦送餘赴贛，行抵九江、南昌，各界聞餘至皆來歡迎，促速進省。馬都督聞餘抵潯，亦來電歡迎，並由撫署遷至舊藩署（曾憶藩署門首有婁妃用發所書“屏翰”二字尚巍然存在，惜當代書家鮮有知者）。餘旋即啟程赴南昌（過韓世忠夫人望夫亭時，曾登亭眺望。亭上懸有“五夜寒更曾上高樓聽鼓角，一樽濁酒重來此地看湖山”之聯）。抵樵舍時，忽見內河水師各艇猥集，土炮喧天。聞係劉麒、何文斌、方先亮諸人主使，餘乃命艦長發排炮示威，各艇乃即鳥散。餘乃疾駛南昌。抵牛行下泊，各界老宿均爭登舟，餘命副官以明日在省議會見。整裝已竣，命楚豫艦長乘馬先行，餘率小部殿後。過市時以楚豫艦長衣海軍大禮服，莊嚴威武，眾皆錯認為餘，實則餘尚在後也。既入城，以豫章學堂為行轅。
部署既定，乃接見省議會議長劉景烈及各要人，商決一切。越二日，形勢較緊，陰謀奪取都督者頗有人在，餘布置益嚴。第三、四晚洗馬池複有火警，火焰衝天，形勢頗惡。各軍因素有準備，故出動迅速。
餘亦集合內衛隊，策馬逕至火區指揮一切。有武寧劉炳南者，客南昌多年，聞餘親臨救火特來訪，以局勢初定，宵小宜防為言，餘笑謝之。
越日，省議會促餘就職。餘準時前往，並致感謝之忱。於是南昌全城煥然呈新氣象。時馬都督仍居藩署，餘以曾任馬之總參謀長，省議會亦敘其功，特署名送贐儀十萬元，並飭人民歡送，滿街結彩，全城鳴炮。馬聞餘準備歡送，乃離南昌，餘派大號火輪一艘送至九江焉。
就職後，召集各界領袖屢開會議，討論治贛辦法並進行左列各事：
一、羅致人才。各司廳處組織及人選多取決於黨部會議。餘雖有自決之權，然從未獨斷也。其時省政組織統於軍政，羅致人才，分任各司廳處長如下：
內政司——鍾震川財政司——魏斯靈司法司——王侃交通司——胡澤、曾貞教育司——宋育德次長——賀治寰軍政司——俞應麓審計處——高巨瑗參謀處——何文斌警察總監——吳照軒高等審判廳——漆璜高等檢察廳——潘學海兩淮鹽運使——黃緝熙（以廩貢生畢業於武備學堂，博覽群書，精通六藝，淵博德才，人頗敬之）
總務廳長——王良箴高等顧問官——陳戎生、陳德生（人稱二陳）時同盟會支部部長賀國昌，學問道德夙為社會欽佩，得其協助一切進行更為順利。省議會會長劉景烈，亦由日本留學歸國者，雖非同盟會會員，而一切主張與都督府同人相近。餘為政不分省界，故外省人士聞江西政局似有可為，次第到贛。複設禮賢館禮之。如是內外人才薈萃，遂無棘手不能舉辦之事。
二、選派留學。清季國內風氣漸開，以公費國費私費留學海外者日眾。即日本一國已有二萬人以上。都督府以造就人才，儲為國用，至為要著，乃標示招考並寬籌經費。因得赴歐美及日本留學者百餘人，後起之秀未有名落孫山者，亦一時盛事也。
三、肅清匪患。贛省自光複之初，匪風甚熾。故欲治贛，必先清匪。時匪首皆已潛逃，人民控案山積，乃派員赴各要地察探。偵知匪首龍正文、陳細鬼在鄂，乃派副官長張千（於）潯往謁黎都督。並偵知陳等所在，張乞黎下令軍警會拿，匪首乃獲，解回南昌戮之，人民歡聲雷動。其時要匪彭木香尚稽顯戮，餘乃通令省內各機關嚴密緝拿。旋在河口捕獲解省，訊明得實斬之，複授意總務廳長王良箴給資安其家。害民最酷者惟此數人，其潛勢力亦最厚，餘以“殲厥渠魁，協從罔治”之法處之，餘匪斂跡，贛境父安。此到贛所辦第一大事也。
四、整理財政。江西為貧瘠之區，辛亥光複，庫帑動用一空。餘就任後即籌設銀行，而基金無著，幸有周馥九、危子遠等深明大義，登高一呼，不數日間而集資達數百萬，居然可與湖南各省比肩矣。當時辦選舉及辦黨，處處需款，餘亦棘手，卒設法籌足，撥歸黨部取用。後黎都督據反對黨控告，派大員程守箴到贛清查，即其事也。
五、修築河堤。南昌、新建二縣在贛頗稱富庶，田畝亦廣，惟每年必苦水患。餘召集兩縣縉紳會議，撥款四十萬元修築圩堤，並派夙負重望者一二人主持之。堤工數月告成。嗣後兩縣人民乃不為水災所苦矣。武寧各縣自太平天國以來，即有浮糧病民，餘亦下令取消之，與興水利案同時並舉。