但是，漸漸的，他在後花園散步的生活無法再調動起他的熱情。到了2001年，公司有了六七年的曆史，已經在大規模生產了。此時，更多的矛盾與問題開始逐漸體現出來。施正榮對這個時期的一些經曆說得比較含蓄，他說：“當時我給總經理提了個建議，因為我們所從事的是第二代薄膜技術，要把第二代技術產業化。在95、96年的時候，光伏市場在歐洲、在德國已經開始慢慢啟動。我說我們有那麼多錢，一年有一千萬美元，每天都燒錢，每個星期我們一個頭腦風暴會議……我就建議為什麼我們不能拿一部分錢出來，建立兩三條生產線……這樣，我們就不光是燒錢，我們還能賺錢。我想如果總經理當時聽了我的建議的話，可能太平洋太陽能公司現在是全世界太陽能很好的公司，肯定上市了。為什麼？它賺了錢，它有這麼強大的技術研發力量。我當時的衝動就是把實驗室的技術產業化，以獲取作為一個知識分子的滿足感。這也是為什麼我回國後根本沒有想到自己要當總經理。我給自己的定位是技術副總。在大江南北談項目的時候，我也是以副總的身份出現的，隻有到了無錫，那裏的人講，我們就要吸引像你這樣的科學家來當老板，你要到無錫來幹，就當一把手，我當時一聽，這我倒沒想過。”
很顯然，施正榮當時對公司的管理和運營路線已經產生了分歧，但他隻是個首席技術官而已，他沒有辦法來對公司的發展路線做決定。當他盡到了自己的努力而無法改變的時候，他的內心逐漸產生了其他的想法。此時的施正榮，誌向已經越來越大，不甘心停滯於首席技術官的職位，他要謀求更大的發展空間。但是他在澳大利亞始終隻是被上麵的人束縛著，他永遠也無法達到那種“海闊憑魚躍，天高任鳥飛”的境界。
施正榮自己說道：“這個時候我在澳洲有點閑了，需要挑戰。在外國這麼多年，在太陽能光伏領域我確實學到了不少東西，我當時就有一種衝動，如果我回來肯定能夠讓中國的太陽能光伏技術達到世界先進水平。”當時有個朋友支持他回國創業，他於是回到闊別了十多年的中國。這個時候的中國已經發生了翻天覆地的變化，這讓他興奮不已。他看到了國內巨大的市場前景，他又找回了激情。