海草有時候也被稱為“生態係統環境建設者”，因為它們在某種程度上營造出特有的棲息地：長葉能使水流減速而增進沉澱，並且海草的根與地下莖可安定海床。它們對物種組合真正的重要性大概就是提供躲藏處了（透過它們在水體中三度空間的結構），而且初級生產高度仰賴它們。因此，海草供給沿岸帶一些“生態係統貨物”與“生態係統服務”，例如漁場、防浪湧、產生氧氣以及保護海岸來抵抗侵蝕作用。
海草的主要特征
生活在熱帶和溫帶海域沿岸淺水中的單子葉植物。常在沿岸潮下帶淺水中形成海草場，具有重要的生態作用，其生物生產力在熱帶海洋中是最高的。
海草在演化中也被認為是再次下海的。為適應生活環境，它們在形態構造上也有一些相應的特征：①有發育良好的根狀莖（水平方向的莖），使各個個體在附著基上交織生長以鞏固植體，進而形成海草場。②葉片柔軟，呈帶狀或切麵構造為圓柱狀，以便在海水流動時保持直立；葉片內部有規則排列的氣腔，以便於漂浮和進行氣體交換。③花著生於葉叢的基部，雄蕊（花藥）和雌蕊（花柱和柱頭）高出花瓣以上；花粉一般為念珠形且粘結成鏈狀，以借海水的流動受粉。
海草是適應在海洋環境中生存和繁殖的單子葉植物，由於所處環境常存在潮汐、風暴等的幹擾，海草形成了一係列適應特征，克隆性是其中突出的一個。所有的海草都具有水平根狀莖，許多海草也具有垂直根狀莖。在一些海草中，也觀察到無性生殖（無融合生殖）。與克隆生長有關的參數（如節間長度、間隔子長度、分枝角度以及延伸速率和分枝率等）對於海草的克隆生長有著決定性影響，但繁育係統對克隆斑塊大小也有較大影響。強烈的克隆性影響著海草的遺傳變異。總體來看，海草種群內遺傳多樣性比陸生植物低，也低於另一類海洋高等植物——紅樹植物，利用DNA標記觀察到的多樣性高於等位酶標記。
海草的繁殖方式
海草是南中國海重要的生態係統之一，在全球50多種海草中，南中國海就分布了20多種。海草在海洋生態係統中的作用非常重要：通過降低懸浮物和吸收營養物質達到淨化水質的目的，同海草是海洋動物的食物時也改善了水的透明度；為許多種類的動物提供了重要的棲息地、育苗場所和庇護場所，尤其為一些具有商業價值的動物提供了育苗場所；為許多生物提供了重要的食物來源（以碎屑形式）；海草稠密的根係成簇地紮在鬆軟的海底上，起著固定底質的作用；具有抗波浪與潮流的能力，是保護海岸的天然屏障；海草在全球C、N、P循環中扮演著非常重要的角色。
但長期以來，海草在海洋中的重要作用得不到足夠的重視，海草床麵積已在全球範圍內下降，其消失的原因是多方麵的，一方麵是由於“自然病害”、巨大風暴和氣候變化造成的；但更多是由人類的活動引起的，例如，填海造地，城市化的擴展，使沿岸許多自然海岸受損，生態係統被破壞；同時海水受到汙染，沉積物和營養物增加，海水高渾濁度以及富營養化，也是海草消失的主要原因。
海草根係發達，有利於抵禦
風浪對近岸底質的侵蝕
強烈的克隆性影響著海草的遺傳變異。總體來看，海草種群內遺傳多樣性比陸生植物低，也低於另一類海洋高等植物——紅樹植物，利用DNA標記觀察到的多樣性高於等位酶標記。在一些海草植物種群中觀察到較高的克隆多樣性，但也有一些種群由單一基因型或少量基因型組成，其原因主要是由於奠基者效應和克隆生長。通常克隆植物中的基因流有限，但是海草的克隆片段可能遠距離擴散，從而提高種群間的基因流。