瑞士警方通過電話，向恐怖分子提出將派代表與他們麵談，協商如何解決目前的問題。恐怖分子同意了這一建議，但要求包琴斯基神甫隻能“一個人來”。並同意包琴斯基神甫兩次進入使館麵談，一次約一小時。
此外，談判還在電話中進行著。由於包琴斯基雄辯的口才，通過談判，恐怖分子同意將最後期限推遲48小時，也就是到9月10日上午10時為止。同時，他們還同意，由瑞士警察給人質按時送飯。然後，恐怖分子分批釋放了8名人質，其中婦女5名，雇員1名，學生1名。他們還提出，他們從武官那裏繳獲了一批機密文件，內容對瑞士和波蘭兩國關係甚為重要，願意主動交出。至於剩餘的5名波蘭外交官，恐怖分子堅持扣押不放。9月8日，恐怖分子改口提出另外的條件，即要求瑞士政府交出500萬瑞士法郎，並將他們安全送出國境，而不再重申開始提出的4項政治要求。談判代表包琴斯基神甫說：“這哪裏是什麼政治條件，他們分明就是一幫匪徒。”
曆史證明，談判不宜拖得過長，因為恐怖分子是反複無常的。9月8日夜間，危急處理小組決定於次日采取突然襲擊，隨即部署了第二天的反恐怖行動。
9月9日上午10時，使館區像往日一樣平靜。10點24分，一輛警車按照常規送去兩個鋁製飯盒。這兩個飯盒都像小型手提箱一般大小，其中一盒全是食物，另一盒在食物下麵暗藏著一枚結構精巧的催淚瓦斯彈，可以在遠距離遙控。兩名警察照例將兩個飯盒放在走廊的台階上，然後電話通知恐怖分子來取。兩名恐怖分子從室內走出，來取送來的飯盒。就當恐怖分子打開第二個飯盒時，守候的警察用遙控裝置將飯盒中的瓦斯彈引發。一聲巨響，閃光耀目，接著發出不帶毒氣的瓦斯煙霧。兩名恐怖分子立時被嗆得連連咳嗽，滿眼是淚。什麼也看不清楚，隻顧用手捂住雙眼和鼻子，踉蹌著向使館內後退。此刻，埋伏在附近網球場灌木林中的警察一躍而起，衝了上來，不費吹灰之力，將兩名恐怖分子製服，押上了警車。
與此同時，另有35名警察頭戴紅色鋼盔，身著防彈背心，麵戴防瓦斯麵具，手執各式武器，一擁而上，衝上二樓。在樓上看守5名波蘭人質的另兩名恐怖分子聽到樓下的響聲，都迅速端起機槍，其中一人想拉過一名人質做自己的擋箭牌。5名人質到底是訓練有素的外交官，和恐怖分子拉扯的外交官飛起一腳，正中對方的小腹，自己翻身躍起，踢開窗子，趁其不備跳到陽台上。另4名外交官也機智地離開現場，這樣，頃刻間衝進來的突襲隊員槍口正對著的，就隻是兩名恐怖分子，也就排除了誤傷和恐怖分子走投無路之下，拉他們同歸於盡的可能。兩名恐怖分子在瑞士反恐怖突擊隊員的包圍下，見到自己寡不敵眾，無可奈何地交了槍，束手就擒。
這次恐怖分子占領使館72小時的事件就此結束。經過搜尋，警方發現，恐怖分子根本沒有攜帶炸藥，所聲稱的炸藥，不過是為了訛詐。
這次營救活動，未發一槍，未傷一人，隻用了12分鍾，就製服了恐怖分子，救出了人質。瑞士當局認為這是一次全勝。
事後，司法和警察部長弗格勒向記者介紹了劫持者的身份如下：經過審訊和多方查證，並沒有“民族自由陣線家鄉軍”這個組織，作案首犯也不是什麼“韋索基上校”。此人本名叫克魯斯基，是一個有犯罪前科的在逃犯。克魯斯基等人希望能在瑞士敲詐一筆錢，然後設法居住在那裏。8月31日，他夥同另外3名波蘭人從奧地利潛人瑞士。在瑞士，他們先住在蘇黎世一家不起眼的小旅館裏，並策劃了種種行動方案。最後，他們決定以抗議波蘭軍事管製法為名，闖占波蘭使館並扣押人質，然後向有關當局提出條件。幾個人都認為，他們打的旗號是順理成章的，不禁自鳴得意。9月6日清晨，4人到達伯爾尼，在使館區遊蕩，看到使館內並沒有任何戒備。他們在自己的車內，把隨身攜帶的機槍零件組裝好。上午10時，4人手持機槍，闖占了波蘭使館。
瑞士當局認為，沒有任何證據能證明這批人的作案抱有什麼政治動機。鑒於瑞士同波蘭兩國之間沒有引渡協定，瑞士當局決定依據瑞士法律對4名恐怖分子加以懲處。
瑞士政府把這次占領波蘭使館並綁架人質一案的處理結果向波蘭政府做了通報。波蘭政府對瑞士反恐怖突擊隊在短時期內破獲作案分子、對他們在營救人質行動中表現出的機智與沉著果敢表示讚許，並在波蘭電視上播放了營救情況。至此，雅直澤爾斯基總統鬆了一口氣。