其中屬於成吉思汗統率的中軍（怯薛軍）和左、右兩翼軍“為十萬一千人”。其餘則分給了成吉思汗的子侄、諸弟及母親。
到窩闊台汗時期，原來編製比較混亂的漢軍也逐步按千戶製統一起來，編組成萬戶和千戶。其萬戶人數多者達五六萬，少者也有二三萬。蒙古國後期，按照千戶編組的漢軍總數已在30萬人左右，大大超過了蒙古軍。
其次，通過千戶編組，確立了自上而下的軍事領導指揮係統。千戶作為基本軍事單位，“自十而百，百而千，千而萬，各有其長。”
蒙古大汗親征，宗王、萬戶長，千戶長等聽從大汗的直接指揮。若分軍行動，則由大汗指定一名蒙古宗王或萬戶長、千戶長作為軍隊的最高指揮官。受命指揮軍隊作戰的人，有權節製其他參戰軍官。對被蒙古征服和招降的漢軍武裝，成吉思汗授命由左翼蒙古軍萬戶長統管，實際上聽命於東道蒙古宗王（成吉思汗諸弟）。
窩闊台汗即位後，漢軍萬戶長、千戶長、百戶長和十夫長，由漢軍將領充任。漢軍萬戶之上，還設立統軍都元帥。都元帥作為地區最高軍事指揮官，其任免由蒙古大汗決定。平時都元帥要經常向大汗報告前線軍情和軍隊分布情況。蒙古大軍出征，都元帥要率軍參戰並接受大汗指定的蒙古宗王、萬戶長、千戶長等前線指揮官的調遣。
第三，通過千戶編組，強化了軍事紀律。千戶製把蒙古士兵納入嚴密的軍事組織之內，受到各級那顏的嚴格管束。同時，成吉思汗還製定了一係列被稱為“劄撒”的軍事法規，以製約士兵行動，維護軍隊秩序。其具體規定主要有：“任何人不得離開其所屬之千戶、百戶或十戶另投別一單位，亦不得避匿他處。如違此令，擅離者於隊前處以極刑，接受其人者，亦嚴厲懲處之”。每個萬戶、千戶、百戶都應隨時作好準備，一旦命令下達，必須立刻出征。在作戰時，如果一甲中有人逃跑，同甲的其他人將判死刑；如果一甲中有人奮勇前進，其他人不跟進，也要處死；如果一甲中有人被俘、其他人不去救援，這些人亦將被處死。作戰時不聽從命令者，“雖貴必誅”。這些規定對加強蒙古軍隊的集中統一，提高戰鬥力起到了有力的保證作用。
千戶製既是軍事單位，又是基層社會組織，是成吉思汗在軍政製度方麵的重大改革，對於鞏固蒙古的統治具有重大意義。
怯薛製
1204年，成思吉汗設立了怯薛，封了六個“扯兒必”之官統領，有八十宿衛、七十散班。1206年，成吉思汗成為蒙古國最高君主後，原來的怯薛建製已不能適應其崇高的地位，為了確保大汗的權力，在原基礎上擴建了一支更強大的常備軍，由大汗直接控製。成吉思汗把怯薛擴充為1萬名，包括1000名宿衛、1000名箭筒士、8000名散班。選萬戶長、千戶長、百戶長、十戶長等那顏及白身人子弟中有技能和身體健壯者充任。各級那顏都有義務派子弟一人來充當護衛，在大汗麵前效力，不許躲避或以他人代替。
充當護衛的人往往都帶著自己的兄弟和那可兒來服役，因此規定：
千戶子弟可帶弟一人，那可兒十人；百戶之子可帶弟一人，那可兒五人；十戶那顏子及白身人之子，可帶弟一人，那可兒三人；所需馬匹、器仗等物由自己攜帶，或由所屬千戶供給，充當護衛是各級那顏和白身人對大汗承擔的一種特殊兵役。
怯薛的主要職責是保衛大汗的金帳和分管汗廷的各種事務，又是大汗直接控製的常備軍。護衛製度規定：怯薛分為四隊，每隊內有宿衛士值夜班，有箭筒士和散班值日班，四隊輪番入值，每番三晝夜，因此總稱四怯薛。怯薛就是番值保衛的意思。“怯薛歹”，意為護衛士，複數為“怯薛丹”。群臣奏事都要經怯薛通報方可入金帳，並有值班的怯薛歹陪同。