孫中山令造幣之權操自中央，指清朝之分隸各省為秕政，不能效法；袁世凱布告改行中華民國正朔，此後公文一律改用陽曆，並附列陰曆年月日；孫中山留任滬軍都督陳其美，並答滬軍二師長請委陳為滬軍都督電，謂：“惟蘇都督一職，須由地方議會公舉，不能由中央委派。若經正式選舉本總統無不同意也”。
18日，孫中山布告全國統一，並派蔡元培為歡迎袁世凱南來專使，宋教仁、魏宸組、鈕永建、劉冠雄等八人為歡迎員，赴北京迎袁南下就職，唐紹儀同行。同時電告袁世凱。
19日，陸軍部通電各省，撤銷軍政分府，並縮減軍隊。
20日，參議院續選黎元洪為第二任臨時副總統。
21日，孫中山致函海外僑胞及廣東各團體，說明推薦袁世凱為臨時大總統之理由：“仆（推倒）滿清而建民國，今目的已達。以此完全民國歸諸全體四百兆人之手，我輩之義務告盡，而權利則享自由人權而已，其他非所問也。至於服務之行政團若總統類者，皆我自由國民所舉用之公仆，當其才者則選焉。袁君之性情，不苟於然諾，當其未以廢君為可也，則持之（堅持之）；及其既以共和為當也，則堅（堅定之）之……彼布告天下萬世有雲：不使君主政體再發生於民國，大哉言矣……至於彼之委曲求全，予亡清以優待，亦隱消同氣之戰爭……總統非酬庸之具，袁君即為任勞之人，宜觀其從容敷施，以行民國之意，使民國之根基，由臨時盡力維持而完固焉”。
同日，孫中山電勸其胞兄德彰公勿任粵督，謂為政治之事，非所熟習，為大局計，勸其兄長宜專任一事，如安置民軍，辦理實業之類，不必當此大任，並電令廣東都督由陳炯明代理。
22日，袁世凱以新舉臨時大總統名義，頒發布告，令各地方軍政長官保護外人生命財產。
23日，孫中山谘參議院，請議決設立稽勳局。
孫中山核準中華民國紅十字會立案。
孫中山任命汪兆銘（汪精衛）為廣東都督。
中華民國外交部，為爪哇島泗水埠華僑慶祝中華民國成立而被荷蘭警察幹擾殺害事件，向荷蘭政府進行嚴重交涉。此為中華民國成立後第一次外交保僑事件。經交涉後，被囚華僑全被釋放，並議訂善後條約六條：（一）槍殺華僑之荷蘭人，由荷蘭政府懲辦。（二）已死之華僑，由荷蘭政府優禮埋葬，並優給家屬撫恤費。（三）被傷之華僑，由荷蘭政府醫治，並給調養費。（四）華僑財產損失，照數賠償。（五）旅居荷蘭華僑，荷蘭政府須與荷人一律看待。（六）條約簽訂後，均須逐條實行。
同日，梁啟超電賀袁世凱當選臨時大總統。自本年春間，梁氏已直接間接與袁氏信劄往來，討論各種問題。
24日，孫中山明令革除“大人”“老爺”等稱號，今後官廳職員，以官職相稱，民間則以先生或君相稱。
滬寧鐵路開始行駛夜車。當時火車均在白天行駛，入夜則停，自南京臨時政府成立後，寧滬之間，冠蓋雲集，由孫中山與滬督陳其美提議，經於右任著手辦理，於本日開始火車夜間行駛。是為中國夜車之始。
25日，武昌文華學校成立中國第一隊童子軍。
26日，孫中山電請袁世凱從速派軍援陝，合擊陝西巡撫升允之清軍。清帝辭位後，升允繼續反對共和製，並興師攻破醴泉，進攻鹹陽，孫中山特電袁氏派兵入陝，鎮壓升允頑軍。
27日，蔡元培等抵達北京，向袁世凱麵遞孫中山書信，請其赴南京就職，袁表示須妥籌北方善後。
28日，孫中山谘參議院，請議決文官考試與外交官及領事官考試法令。
29日，北京發生兵變。當夜，北京亂軍火燒東安門外及前門一帶街市，搶掠達旦，專使蔡元培等所居之室，亂兵亦持槍而入，蔡等越牆而走。後至3月2日，保定兵變。
3月3日，天津兵變。駐北京外交使團，連日向袁世凱提出抗議，並擬自天津調兵入京。袁以此為借口拒絕南下。
3月：
2日，孫中山命令內務、司法兩部轉飭所屬：不準刑訊；並通令全國禁絕鴉片；令內務部禁止買賣人口。
中華民國聯合會與豫備立憲公會合並改組為“統一黨”。改組大會宣布政綱，到會者二百人，章太炎等先後作各有關報告，並選出理事五名：章太炎、程雪樓（程德全）、張謇、熊希齡、宋鈍初（宋教仁）；每省選舉評議員二名，當場有十省選出。中華民國聯合會、係本年1月3日成立，係由章太炎領導之光複會，與同盟會分離而成。
3日，中國同盟會於南京舉行全體會員大會，選舉孫中山為中國同盟會總理，黃興、黎元洪為協理；並通電宣告以鞏固中華民國、實行民生主義為宗旨，同時公布總章與政綱，總章共七章三十四條。
4日，蔡元培自北京致電孫中山，報告北京兵變詳情，並報告他們在北京召開數次會議，決定取消袁氏南行之議雲：“一方麵袁君頗不能南行，而一方麵則統一政府不可不即日成立……培等會議數次，全體一致謂不能不犧牲我等來此之目的，以全垂危之大局。爰於初一、初二兩日，迭發公電私電多次，提議改變臨時政府地點，冀得尊處同意，以便改變交涉方針。乃兩日間未得一複，而保定、天津相繼擾亂，大局之危直如累卵，爰於今日午後會議，準備與袁君為最後之交涉”。蔡等向袁提議兩條：（一）取消袁南行要求。（二）確定臨時政府地點為北京。具體方法為：袁在北京就職；由內閣總理在南京組織統一政府，與南京前臨時政府辦理交接手續，外務總、次長到北京任事。
5日，孫中山通令全國剪辮。此前光複各省人民多已自動剪辮，至此乃全國一律遵令剪掉男性大辮子。
6日，孫中山谘請參議院允許袁世凱在北京就職。袁氏同日電告孫中山，擬由黎元洪代赴南京就職。參議院同日議決袁於北京就職。孫中山即日電複北京同意袁在北京就職，並電告各省。
7日，孫中山致電黎元洪，誡勿迫害孫武。電雲：“孫武奔走光複之事累年，此次武昌首義，厥功甚著，縱使行事用人，或有偏頗，而解職以去，用避賢路，副總統可謂持之平允矣。至謂孫武有何罪狀，則當由副總統正式宣布。豈容蜚語四出，極其所之，致使望門投止，狀類逋逃（逃犯），文以為甚非所以待有功者之道。敬請副總統為各界告誡，勿傷同氣，無害功能，天下甚幸！”
8日，袁世凱誓詞電達南京參議院，決定在北京就第二任臨時大總統職。
9日，孫中山為尊重言論自由，命令內務部取消所訂暫行報律。命令雲：“案言論自由，各國憲法所重，善從惡改，古人以為常師，自非專製淫威……摧抑者”。
10日，袁世凱於北京正式就任第二任臨時大總統之職，但宣布仍暫用前清法律，隻有與民國體製抵觸者廢除之；袁宣布：凡民國元年以前所欠地丁正雜錢糧、漕糧，一律免除，以蘇民困。同日，袁單方麵頒布大赦令。至本月23日，孫中山谘請參議院予以追任。
11日，孫中山公布《中華民國臨時約法》，共七章五十六條，其第二條規定：“中華民國之主權，屬於國民全體”。孫中山對此約法持有不同意見（不同意責任內閣製），其中主權屬於全體國民，是孫中山之意見。此約法采用責任內閣製，以製袁世凱之權。同日，孫中山通令嚴禁女子纏足。
甘肅省秦州光複，黨人黃鉞為臨時都督。
北京外務部通告各駐外代表，令其照會各國政府：中華民國統一政府已經成立，所有清政府與各國所締結之條約，由中華民國政府實行之。各項交涉事件，均由駐各國外交代表接辦。
成都、重慶兩軍政府合並為四川都督府。尹昌衡為都督，張培爵任副都督，省參議院院長為羅綸（他省多無此機構）。
12日，南京參議院製定《臨時政府各部暫行官製通則》二十六條，規定設外交、內務、財政、陸軍、海軍、司法、教育、農林、工商、交通十個部。各部均設總長，下設承政廳及各司，司以下設科，分掌事務。
13日，袁世凱任命唐紹儀為國務總理。
15日，孫中山以袁所設立內閣多出工商等部，谘請參院討論，參院即以袁設內閣不合《通則》規定，電複袁世凱改正之。
袁世凱下令改總督、巡撫為都督。
16日，國務總理唐紹儀與比國華比銀行簽訂借英金一百萬鎊合同。
17日，孫中山令內務部解放“蛋戶”、“惰民”，使其一律享受平等待遇；孫中山批準胡漢民所請，同意設立國史院，谘請參議院審議，兩日後參院經審議，予以通過。
18日，袁世凱通令各省迅速派參議員參加參議院會議，健全參議院；並通令各省，先定簡易選舉辦法，組成省議會。
以實踐民生主義、開發國家資源為宗旨之拓殖協會正式成立，會長為黃興。
唐繼堯通電驅逐貴州代理都督趙得全，開武力驅逐都督之先例。
19日，孫中山令外交部，禁絕販賣豬仔（華工），保護華僑；直隸諮議局公舉王芝祥為直隸都督；袁世凱令各省維持現狀，勿再各自為政，另舉都督。
山東公舉之都督胡瑛，因袁世凱命原各省巡撫改稱都督，而辭職。
女子參政同盟會唐群英等向參議院要求婦女參加政權，並徑入議事廳，經婉勸始退出；午後，複至參議院旁聽，參議員宣稱，該院對於此要求，原要等待國會成立後解決，今見該盟婦女程度不齊，全體反對女子參政。次日，唐群英等複入會場，衛兵阻止之，唐等不服，遂將會場門窗玻璃打壞。
21日，唐又往會場，不得入，乃至孫中山處陳訴，要求總統出席提議，經孫中山斡旋，並令具呈至參議院，參院始允由女子同盟會具呈，再行討論。
22日，袁世凱命朱啟鈐督辦津浦鐵路事宜，馮元鼎接充津浦路幫辦事宜。
孫中山通令各省都督，勸辦賑捐，急濟饑民。令雲：“民國新造，首重保民。顧以用兵之故，致貽失所之憂。本總統每一念及我同胞流離顛沛之慘象，未嚐不為之疾首痛心，寢食俱廢也。”
袁世凱通知各國公使，中國借用外債，須以總統簽字蓋章為憑，以個人名義借款者，概不承認。
台灣竹山農民，因日本總督府批準竹林給予日本三菱會社，起義抗日。首領劉乾，率眾襲擊日本頂林派出所，殺日警飯田助一、川島子川及巡捕陳霖仔，後即散去，日警大事搜捕。甘肅、新疆當局宣言擁護共和。
24日，孫中山谘參議院議決舊有民刑法律草案、民刑訴訟法，除帝室、內亂罪外，繼續有效。
27日，參議院通過《參議院法》，谘請孫中山公布之。袁世凱命張鎮芳代理河南都督。
28日，袁氏任命周自齊為山東都督，胡惟德為稅務處督辦。已廢之清隆裕太後“傳諭”解散宗社黨（皇族頑固派組織）。
29日，參議院通過袁世凱所提出之內閣人選：外交總長陸征祥、內務趙秉鈞、陸軍段祺瑞、海軍劉冠雄，財政熊希齡、司法王寵惠、教育蔡元培、農林宋教仁、工商陳其美。惟交通總長未予通過。
30日，袁氏任命唐紹儀兼任交通總長。
30日，袁氏任命黃興為參謀總長，黃辭不就。唐紹儀加入同盟會。
31日，孫中山出席同盟會餞別會，發表關於社會革命之重要演說，謂：今日滿清退位，中華民國成立，民族、民權兩主義已達到，惟有民生主義尚未著手。今後吾人所當致力的，即在此事。社會革命（社會主義）為全球所提倡，中國多數人尚未曾見到，即今日許多人，以為改造中國不過想將中國弄成一個極強大的國，與歐美諸國並駕齊驅罷了，其實不然。今日最富強的莫過於英、美，最文明的莫過於法國。英是君主立憲，法、美是民主共和，政體極美的了，但是，國中貧富階級相隔太遠，仍不免有許多社會黨要想革命。蓋未經社會革命一層，人民不能全數安樂，享幸福的隻有少數資本家，受痛苦的尚有多數工人，自然不能相安無事……即本會中人亦有說……中國社會革命隻好留以有待。這句話又不然。英、美諸國因文明已進步，工商已發達，故社會革命難；中國文明未進步，工商未發達，故社會革命易。英、美諸國資本家已生，障礙物已多，排而去之故難；中國資本家未出，障礙物未生，因而行之故易。然行之之法如何？今試設一問，社會革命尚須用武力乎？兄弟敢斷然答曰：
英、美諸國社會革命，或須用武力，而中國社會革命，則不必用武力……但因此時害猶未見，便將社會革命擱置是不可的……吾人當此民族、民權革命成功之時，若不思將患預防，後來資本家出現，其壓製手段，恐怕比專製君主還要厲害些，那時殺人流血去爭，豈不重（蒙受）其禍麼。其具體防止資本專製之法為地價稅法，即對地價抽稅。如地價益昂，則抽稅益增，可以此阻止地主抬高地價，興風作浪。其次是國有操縱國家命脈之大企業和資本，不使資本家操縱國民經濟。
本月，叛亂藏軍在英國慫恿下，向江孜中國駐軍發動攻擊。當地駐軍被迫解除武裝，自印度歸國。叛軍繼於12月圍拉薩，鍾穎被迫繳械離開拉薩，輾轉至印度。
4月：
1日，孫中山明令公布《參議院法》。此是中國第一部國會組織與議事法規，共十八章一百五條。同日，孫中山向臨時參議院宣布解職。
同日，黃興改任南京留守，統轄南方各軍；袁氏任命徐紹楨為參謀總長，徐辭，複改任倉場總督。
2日，孫中山在南京辦交卸手續，谘告參院，正式解大總統職，並將此通告全國人民。參議院議決臨時政府遷到北京。
3日，孫中山於上海講解民生主義，反對私人資本壟斷，主張土地國有，謂：“吾人之所以持民生主義者，非反對資本，反對資本家耳，反對少數人占經濟之勢力，壟斷社會之富源耳……苟土地及大經營皆歸國有，則其所得，乃可為人民之公有……非如少數人壟斷，徒增私人之經濟，而貧民之苦日甚也”。
袁氏命阿穆爾靈圭專辦蒙旗事務。
5日，參議院議決本院遷至北京。
6日，參議院將全體參議員名單谘送袁世凱；議長為林森，副議長王正廷，審議長李肇甫；黃興就任南京留守；袁氏任湯薌銘為海軍次長，黃鍾瑛為海軍總司令。
7日，袁任命曹銳為直隸布政使。
8日，任命施肇基為交通總長，範源濂為教育次長。
9日，孫中山應黎元洪之邀抵達武昌。袁世凱聘章太炎、伍廷芳為總統府顧問。
10日，袁任王人文為川滇宣慰使，張元奇、榮勳為內務次長，專管蒙、回、藏事宜。
11日，袁世凱派範源濂等攜袁之筆信到武昌，歡迎孫中山北上。統一共和黨於南京成立，選出蔡鍔等為總務幹事。該黨政綱十二條，於參議院中占二十餘席位，為第三大黨地位。
13日，袁頒布《勸諭漢滿蒙回藏各族聯姻令》；任命副總統黎元洪兼參謀總長；程德全為江蘇都督。
中國飛行家厲汝燕，在上海江灣試飛飛艇，飛離地麵三十餘丈，觀者稱讚不已。
14日，孫中山自武昌返抵上海，住宋嘉澍家中。
美國國會通過承認中華民國議案。
15日，袁任王延廷為工商部次長。
統一黨、民社黨、國民公會、國民協進會、國民黨（由中華帝國憲政會改組，不是同盟會改組之國民黨）、共和建設討論會，在上海商討合並問題，以後合並為共和黨。
16日，袁任命陳宦為參謀次長；袁派員赴美，對美國參議院於3月16日通過之“電賀中國人民案”表示感謝。
17日，孫中山於上海實業聯合會發表講話，提出收回領事裁判權，恢複中國主權；中國有主權，則可向任何國家借款，外國人投資亦不禁止。繼謂：“仆（孫中山自指）之宗旨，實行民生主義，而以社會主義為依歸。”
19日，袁世凱準揚州徐寶山取消軍政分府。
21日，國務院成立；袁任命梁士詒為總統府秘書長，馮國璋為總統府軍事處處長，尹昌衡為征藏總司令，鎮壓達賴對川邊之侵擾。
23日，袁通令各省，限期辦竣參議員選舉事，並催各省選出之參議員來京。
24日，袁命顏惠慶為外交次長。
25日，孫中山抵廣州，陳炯明於夜間辭都督職，赴香港而去。袁世凱任命章宗祥為法製局局長，袁鴻佑為新疆都督，楊增新為新疆省布政使，宋敬熙為新疆省提法使。
26日，孫中山於廣州講《軍人之本分》謂：“若軍人忘其本分，不為四萬萬同胞謀幸福，而為個人謀權利，恐非軍人最初所抱之革命宗旨”。袁世凱任命施肇基暫代財政總長，唐繼堯代理貴州都督，柏文尉代理安徽都督。
27日，袁免原河南都督齊耀琳職，以其子袁克定為河南都督。荷屬婆羅州華僑因與巫人衝突被荷蘭警察槍殺。柏文蔚代理安徽省都督。
28日，廣東省議會選舉胡漢民為都督。袁命原貴州都督楊藎誠開去此缺。
29日，參議院遷移北京，舉行開院典禮，袁世凱到會並發表宣言，表示堅決擁護共和製。
同日，中國同盟會本部遷移北京，南京設支部。
30日，袁世凱策劃組織“軍界統一會”，因各方反對，決議取消。
5月：
1日，參議院改選正副議長，吳景濂當選為正議長，副議長為湯化龍。袁世凱令裁撤江北軍政府。
原先與比利時國簽訂一百萬鎊借款合同，因英、美、法、德四國反對而取消；唐紹儀與四國銀行團首次磋商借款事宜。
3日，京師大學堂改稱北京大學校，大學堂總監督改稱大學校校長。袁世凱任命嚴複代理北京大學校校長。
4日，孫中山在廣州講平均地權。其主要內容是：平均地權是實行民生主義第一級；平均地權之法為：（一）照地價納稅；（二）土地國有。但征用時，仍按價收用之，並不無償征用，惟使用土地者，無權拒征。又說：“地權既均，資本家必舍土地投機業，而從事工商，則社會前途必將有無窮之希望。”否則，將受大地主、大資本家無窮之專製。
5日，孫中山在廣州講解決民生問題，可以從稅契入手，實行稅契製度；同日講地方自治問題，謂國家之治，原於地方，地方自治之製發達，則一省之政治可因而進步，推之於國家亦複如此。
7日，袁世凱任命魏宸組為國務院秘書長。
財政總長熊希齡代表中國政府與四國銀行團談判借款事宜。四國先允支付六百萬兩。新疆都督袁鴻佑因強令剪辮事為眾所殺。
9日，袁世凱命鍾穎為西藏辦事長官。
熊希齡拒絕六國銀行團借款監督之請求。統一黨、國民協進會、民社黨、國民黨（非同盟會改組之國民黨）等，合並為共和黨，以黎元洪為理事長。
10日，參院議決以五色旗為國旗。
12日，袁世凱下令禁止私立團體，幹涉行政。
13日，任命陝甘經略使胡瑛為新、青二省屯墾使，廣福為伊犁鎮邊使，楊纘緒為伊犁鎮總兵。
17日，財政部與四國銀行團訂立墊款合同，先付墊三百萬兩。
18日，改大理院正卿為大理院院長，以許世英任之；任命楊增新為新疆都督；共和黨參議員討論會成立，湯化龍為會長。