光緒於仁壽殿見日本國公使內田康哉、意大利國公使嘎厘納等；山東煙台水災，朝廷賑濟。
9月：
7日，清廷設立商部，以貝子載振為尚書，伍廷芳、陳璧為左、右侍郎，並裁路礦總局，歸並於商部。
22日，免靈州瀕河地糧。
10月：
6日，湖廣總督張之洞訂《出洋學生約束章程》、《獎勵章程》等。與日本商約訂立。
10日，章士釗節譯《三十三年落花夢》一書，改名《大革命家孫逸仙》出版，宣傳孫中山。孫中山於檀香山駁斥康、梁保皇派，寫《敬告同鄉論革命與保皇之分野》，指出革命派誌在推翻清政府，保皇派誌在保護清政府，此為兩者根本分野。
11日，清廷以敬信為體仁閣大學士，裕德協辦大學士。
16日，光緒於仁壽殿見法國公使呂班、德國公使穆默。
本月：經數次勘察，外務部奏請山西正太鐵路改用窄軌。該奏章雲：正太一路，山徑崎嶇，難容寬軌，宜改用一密達之窄軌，以免稽時枉費。朝廷準奏。
1r月：
4日，命榮慶在軍機大臣上行走；王文韶免去會辦外務部大臣，調那桐為外務部尚書兼會辦大臣。
5日，命那桐與奕勖、瞿鴻璣整理戶部財政；榮慶充政務處大臣。
6日，命孫家鼐、張百熙並充政務處大臣。
本月，商部奏請力行保商政策。奏曰……泰西（西方）諸邦，以商戰立國，其優待本國商民無不予以應得之利益，保護煦育（撫育），以利其生存。對於貿易盛衰之原因，與貨物出入盈虛消長之根源，亦無不隨時體察。偶有不便於商民以致妨其生業者，必為設法以輔翼之，維持之。其大要務在劑不平而則使之平。此其商務所以蒸蒸日上也。中國自互市以來，未嚐不欲仿行其法，徒以洋商應享利益，載在約章，偶有不平之事，領事官即為申理。而華商，勢弱力微，其氣既不足以相聚，且平日與官場隔絕，其情又不足以相孚。於是不肖官吏，遂至專用壓力，牽製抑勒，種種不平之弊，商民有身受其艱苦而不敢言者。敬為我皇太後、皇上詳晰陳之：
查洋商販運土貨，隻在海關完納子口半稅，領有三聯報單，沿途呈驗，無論遠近，概不重征。而華商運貨出口，則逢關納稅，遇卡抽厘，其所納之款，已較洋商所完子口稅為多。乃官吏卡員，於照章應納稅厘外，恒多分外之需索，如此畸重畸輕，土貨出口，安能望有起色。此其不平者一也。
運貨之宜，務在迅速。往往有一日之差，旦夕之殊，而貨價之漲落，以倍蓰（數倍）者。邇來內港行輪運貨業經暢行無阻，各處關卡委員，遇掛洋旗之商船，照章速驗放行，遇無洋旗之商船，即不免留難需索，甚至今日不驗，候至明日，明日不驗，候至後日，至於民船劃艇，更複任意欺淩。華商隱受虧損而無之如何。此其不平者也。
商人經營貿遷，良非易易，偶有倒欠涉訟情事，自應速為理直。乃近來外省地方官，於洋商詞訟，尚不致故延時日，而於華商涉訟，往往積壓稽遲，甚或居而奇禍，苛索侵漁，無所不至。此其不平者三也。
凡此數端，華商每以相形而見絀。由是洋商中之桀黠者，遂即行其招徠壟斷之詐，浸而久之，華商亦且冒洋籍，掛洋旗，所沾之利息，洋商安坐而均分之，是使華人之資，半股削於洋商之手，而地方官吏，且目之日奸商。夫以華冒洋，誠可謂之奸商矣，曾一思為淵驅魚，有養民之責者，不能不分任其咎也。
對此，光緒帝發諭旨曰：各直省將軍、督、撫通令所屬文武各官及局卡委員一律認真恤商持平，力除留難，嚴革各項積弊，以順商情而維財政。倘有不肖官吏，仍行需索刁難，隨時嚴查參辦，不得縱容。
19日，西太後與光緒於乾清宮見荷蘭國公使希特斯。同日，下旨：商部奏稱商務初興奠基，以提倡土貨為要義，而商之本在工，工之本在農，非先振興農務，則始基不立，工商無以為資。振興農務之法，不外清地畝，辦土宜（土特產），以及興水利、廣畜牧，設立農務學堂與試驗場……。所陳不為無見。命各省大吏，速令各府、廳、州、縣，認真確查，極力講求，一律切實興辦，以廣種植而裕利源。
12月：
4日，置設練兵處，以奕勖總理之，袁世凱、鐵良副之。
12日，命岑春煊總統廣西諸軍。
13日，賞楊晟四品卿銜，充出使奧地利國大臣。
14日，袁世凱彈劾張翼：擅自出售開平煤礦給外國人。朝廷罷張翼職，責令收回。
12月：
21日，準張百熙奏請，選派師範學生赴東、西洋留學。
本年，陳天華所著《猛回頭》、《警世鍾》出版。該二書，大聲疾呼推翻滿清政府，並謂“鋼刀九十九，殺盡仇人方罷手”，“殺那洋鬼子，殺投降洋鬼子的二毛子，滿人若是幫助洋人殺我們，便先把滿人殺盡……殺、殺、殺！殺我們累世的國仇，殺我們新來的大敵。殺媚外的漢奸！殺、殺、殺”。陳天華（1875～1905），湖南省新化人。1903年留學日本，入東京弘文學院師範科。曾寫血書抗議俄國侵占我東三省，並回國策劃武裝起義。
《鐵雲藏龜》出版。此由劉鶚整理而成，從五千餘片甲骨中選出一千又八十五片，刊印成書。劉鶚（1857～1909），號鐵雲，江蘇省丹徒人。通算術、樂律、治河之道。曾任知府，治理黃河。著《老殘遊記》，抨擊清廷吏治腐敗等。同時是最早的甲骨文研究者之一。1908年被遣戍新疆。次年病死。