本年春，免宣威、昆明、齊齊哈爾、墨爾根旗屯災賦；免陝西榆林等處欠賦，西安等廳、縣秋糧十分之二。
5月：
9日，光緒於乾清宮見俄國公使雷薩爾。
13日，命沈家本、伍廷芳參訂現行法律。
15日，李經羲以陳奏失言，免雲南巡撫職，下部議處。
19日，命許玨充出使意大利國大臣，吳德章充出使奧地利國大臣，楊兆望充出使比利時國大臣。
21日，裁去清宮銀、緞匹、顏料三庫，裁撤管庫大臣職位。
25日，日寇於台灣屠殺抗日俘虜二百六十五人。日寇侵占台灣後，於1898年由兒玉原太郎任台灣總督。民政官為後藤新平，後藤上任後，改變強力鎮壓的政策，采用懷柔、誘騙、分化政策，對付台灣抗日義軍與抗日民眾。在此政策下，該年7月，有宜蘭林江旺率部三百人投降；8月，北部陳菊秋率千餘人投降。台灣北部抗日義軍瓦解。
本年（1902）年11月日寇轉向台中地區，對雲林、溫水溪、高雄、鳳山地區抗日軍進行圍攻，至12月，日寇殺害台灣同胞兩千餘人，傷者不可勝計，燒民房五千八百餘間。日寇誘騙投降戰俘二百六十五人，於“歸順場”屠殺淨盡。繼之，又誘殺“歸順之台灣民眾”四千餘人。對此，後藤也不諱言，他供認以“歸順方法屠殺俘虜之事實”，“把他們殺得幹幹淨淨”。
30日，日寇殖民當局對“歸順”之林少貓部駐地後壁林，進行血洗。先是林少貓部抗日義軍在大勢已去情勢下於1899年5月中旬，依據“歸順條款”，“歸順”日寇殖民當局，並有《十條件準許書》為憑。據此條件，林可率歸部遷居後壁林等地區，該地區，土地荒蕪，林率部來此後，即行開荒種植，興修水利，並設立遊樂場、商店等福利設施，以為久計，但日寇並無誠意，隻是一種誘騙和權宜之計，早存殺機。至本年本日，日寇即對後壁林肆行炮擊，占領後壁林後，即將此地二百三十一人屠殺淨盡，其中有婦女三十一人，兒童十五人。林少貓戰死。與此同時，日寇又於鳳山、屏東地區進行搜索屠殺，至6月4日，又將林之舊部四百人完全殺光，其中亦有嫌疑人在內。此後，台灣大規模之武裝抗日活動結束，但台灣同胞的其他抗日活動仍然繼續進行，並與大陸反清革命運動相呼應。
6月：
8日，清廷實授袁世凱直隸總督兼北洋大臣。
10日，光緒於頤和園樂壽堂見各國公使。
12日，廣西有眾反清，攻克皈朝，清廷派雲南清軍鎮壓。
22日，夏至，光緒祭地於方澤。
24日，光緒於乾清宮見美國公使康格等。
7月：
12日，命孫寶琦充出使法國大臣，胡惟德充出使俄國大臣，梁誠充出使美、日、秘大臣。
26日，光緒於乾清官見美國公使康格及博覽會會長巴禮德。
27日，命張之洞為督辦商務大臣。
本月，賑四川南充、簡陽等縣災。
本年夏，京師大學堂總教習吳汝綸赴日本考察教育四個月，寫成《東遊叢錄》一書。歸國後其學生為之編成《東遊日報譯編》一書，兩書對清末教育有重大影響。
8月：
4日，奎俊開缺，命岑春煊為四川總督。時四川資陽等處民變蜂起，燒毀教堂。奎俊不能控製，故以岑代之，岑上任後，川省平定。
15日，張百熙奏呈學堂章程頒發。
22日，袁世凱奏報朝廷，八國聯軍交還天津，袁照約接受。
29日，移雲南迤西道之衙署駐騰越兼監督關務。
本月，清廷命袁世凱督辦津、鎮鐵路，並與德國德華銀行、英國彙豐銀行訂立詳細借款合同。
因義和團拆毀自京師至津沽、張家口、保定、山海關之電線，盛宣懷奏請籌巨資購造水陸各重要電線，並予以保護。
9月：
4日，中英通商行船條約簽訂。
12日，袁世凱奏請裁除陋規增加公費，並令他省仿行。
17日，黃河決口利津、壽張等處。
21日，加貽穀理藩院尚書銜，命辦理各蒙旗開墾事宜。
23日，光緒於仁壽殿見德國公使葛爾士等。
24日，黃河決口於山東惠民。
10月：
5日，清政府命各省選擇學生，派往歐美各國學習專門學科。
7日，兩江總督兼南洋大臣劉坤一卒，追封一等男，贈太傅。命張之洞代理兩江總督，兼南洋大臣；盛宣懷與華俄銀行訂立正太鐵路借款合同，該路自正定至太原，歸俄國經營，而實為法國資本；以端方代理湖廣總督。免天津被兵新舊額賦。
21日，光緒見法國公使賈那斯等於仁壽殿，複見各國公使於仁壽殿。