韓暢死後，季姚便染病不起了。她的一生太過可憐，以前跟著韓暢的時候就沒有過正式的名分，如今韓暢死了。幸好她還有一個女兒。可是因為之前小智與韓暢勾心鬥角之時，季雨婷倒戈向小智，導致了母女二人有些生疏。如此一來，季姚便不願意再在京都呆下去，與季雨婷一晚促膝長談後，便去了峨眉山出了家，入了佛門，安度晚年。沒有知道季雨婷和季姚那晚談了什麼，隻知道第二天一早，季姚出門時，季雨婷沒有相送。而母女二人都是眼眶堪紅，想必是苦了一整夜。
這對苦命的母女，就此分道揚鑣了。季雨婷就一直跟在小智身邊了。兩人的關係也正式確立了下來，見過了小智的父母後，也準備和通哥真真同時成婚了。季雨婷依然在航空公司工作，隻不過在小智的幫助下，不再擔任空姐的職務，而是轉為地勤，做了一份相對清閑的差事。
小智雖然現在身兼數職，地位已是不低，但都是秘密的身份，平時的日常生活，還需要一個幌子的。所以他依然在中國公安大學的一個研究所裏就讀法醫研究生。在他看來，法醫這個工作常年接觸屍體解剖，對他更加了解人體結構非常有好處。同時，小智沒有放下對《黃帝內經》和《神農百草醫》的研究，一有空閑，遍向鐮刀請教。而小智的內力修煉也沒有落下，隻是沒有了戰事，小智的真氣進步，也比以前慢了許多。香山依然是他修煉的最佳場所，時不時還會和國安局的兩位副局長切磋技藝，總算是讓小智的實力有著緩慢的進步。看著身邊的朋友都走上了正軌，小智心中充滿了安慰，已經對未來的期待。
京都的夏日已經漸漸遠去，氣溫也逐步降低。秋天的到來，給了飽受了一個夏日炙烤的京都，帶來了一絲清涼。政府的換屆選舉如期進行，主席和總理都如常退休，新的領導班子正式成立。由於之前有小智的幫助，所以新主席上任後，對小智的瑞祥中藥公司是特別的照顧，連續發了幾分文件，表麵上是開始保護中國傳統文化，實際上是給瑞祥中藥公司開通了很多方便。
小智也知道新主席的意思，在一個秋日的夜晚，特意秘密進入中南海，帶著通哥和少帥，代表影部和新主席會麵。中國的繁榮昌盛，在這個夜晚，翻開了新的篇章。年輕的中國，向著沒有的未來進發。
而就在這個已經有了些涼意的夜晚，在家中喝著悶酒的老魏接到一個電話，原來是那個軍中的科學家，在他的動物學家朋友的幫助下，發現了老魏給他的那個鱗片和白色毛發的一些秘密。老魏聽完，思考半晌，連夜趕去。
與此同時，在中國的隔壁，日本的北海道的一個莊園中，一身汙穢，胡子拉碴的韓健，恭敬的站在一個年邁，卻精神抖擻的消瘦老人身前。從身上拿出一個褶皺的不成樣子的破舊信封，韓健遞給老人，並說：“家門不幸，家父讓我來此投奔前輩。”那老人看完信，便安排韓健住下了。
當晚，與新主席會談了很久以後，小智從中南海走了出來。已是午夜時分，秋風蕭瑟，小智緊緊了風衣的領口，看著夜半的京都，淡淡的說：“起風了啊。”
（全本完）