1869年5月17日，尼采初次到瑞士盧塞恩城郊的特利普拜訪了華格納。同月28日，他在巴塞爾大學發表就職演說，題為《荷馬和古典語言學》。當時，巴塞爾城裏所有貴族家的大門都對他敞開，他成為巴塞爾學術界的精英和當地上流社會的新寵。1870年，尼采被聘為正教授。不久傳來了德法開戰的消息，尼采主動要求上前線。在途經法蘭克福時，他看到一隊軍容整齊的騎兵雄赳赳氣昂昂地穿城而過。突然間尼采的靈感如潮水般湧出：“我第一次感到，至強至高的‘生命意誌’決不表現在悲慘的生存鬥爭中，而是表現於一種‘戰鬥意誌’，一種‘強力意誌’，一種‘超強力意誌’！
1870年10月，尼采重返巴塞爾大學講壇。他結識了神學家弗蘭茨·奧弗爾貝克（Franz Overbeck），兩人很快成為摯友並共居一所住宅。以後他陸續出版自己的著作，直到1889年其間，在1976年，他與最好的朋友由於精神上的不同而分道揚鑣，這一年，尼采向荷蘭女子求婚而遭拒絕，後來他盡管一再試圖為自己尋覓配偶，均不成功，因此他對女性放棄了任何希望，於是他就開始拚命攻擊女性，與此同時，為自己大唱讚歌，並且至死未婚。
1889年，圖林的災難降臨了。尼采進入了他的生命的最後十年。他先是住在耶拿大學精神病院。1890年5月，母親把他接到南堡的家中照料。1897年4月，因母親去世，尼采遷居到位於魏瑪的妹妹伊麗莎白·福爾斯特—尼采的家中居住。在尼采的一生中，他的家庭始終是他的溫暖的避風港，作為這個家庭中唯一的男性，家中的五位女性成員始終圍著他轉，無微不至地關懷他，精心嗬護他，盡量滿足他的一切願望。但尼采為了心中的崇高理想，毅然舍棄了這一切，像個苦行僧一樣在這個風雨飄搖的世界中飄泊遊蕩，忍饑挨餓，沉思冥想。1900年8月25日，這位生不逢時的思想大師在魏瑪市（Weimar）與世長辭了，8月28日葬於故鄉勒肯鎮。
經典著作
1872年，他發表了第一部專著《悲劇的誕生》（Die Geburt der Tragodie）。這是一部傑出的藝術著作，充滿浪漫色彩和美妙的想象力；這也是一部幼稚的哲學作品，充滿了反潮流的氣息。尼采並不就此止步，他毅然攻擊最受尊敬的典範——大衛·斯特勞斯，以此抨擊德國人的粗俗的傲慢和愚笨的自得。司湯達曾發出忠告：“我一來到世上，就是戰鬥。”《悲劇的誕生》和《不合時宜的思考》（Unzeitgemabe Betrachtungen）
的第一部發表之後，引來了一片狂熱的喝彩聲，
同時也遭到了維拉莫維茨領導的語言學家圈子的排斥。
1873年，尼采寫了《希臘悲劇哲學》的片斷（後以未完成的手稿出版）。1874年，尼采又完成了《不合時宜的思考》的第二部分《論曆史對生命的損益》、第三部分《教育家叔本華》。在這部作品中，他猛烈抨擊各沙文主義大學。經驗告訴我們：“國立大學慣於支持低劣哲學家，這是偉大哲學家發展的最大障礙……永遠也不會有一個國家會庇護柏拉圖和叔本華這樣的人……國家總是懼怕他們。”1875年10月，尼采結識了音樂家彼德·加斯特（P·Gast）。1876年，尼采完成了《不合時宜的思考》的第四部分《理查·華格納在拜羅伊特》。在這部作品中，他稱華格納為齊格弗裏德，“他從不知道害怕為何物”，甚至把華格納稱為唯一真正藝術的奠基人。到了1876年8月，情況急轉直下。尼采出席了華格納主持的首屆拜羅依特音樂節。當時華格納創作的歌劇一夜一部地全部被搬上了舞台。
1883年，他完成了《查拉圖斯特拉如是說》的第一、第二部分，1884年完成了第三部分，1885年完成了最後一部分。尼采在這部著作中闡述了著名的“同一性的永恒輪回”的思想。這是他的兩個主要思想體係中的一個。而另一個“趨向權力的意誌”的構思，由於他的身心崩潰而半途夭折。著名的“超人”理想和“末人”形象就是在這部著作中首次提出的。尼采評價自己這部著作：“在我的著作中，《查拉圖斯特拉如是說》占有特殊的地位。它是我給予人類的前所未有的最偉大的饋贈。這部著作發出的聲音將響徹千年，因此它不僅是書中的至尊，真正散發高山氣息的書——人的全部事實都處在它之下，離它無限遙遠而且也是最深刻的書，它來自真理核心財富的深處，是取之不盡用之不竭的泉水，放下去的每個吊桶無不滿載金銀珠寶而歸。這裏，沒有任何‘先知’的預言，沒有任何被稱之為可怕的疾病與強力意誌混合物的所謂教主在布道，從不要無故傷害自身智慧的角度著眼，人們一定會首先聆聽出自查拉圖斯特拉之口的這種平靜的聲音的。‘最平靜的話語乃是狂飆的先聲；悄然而至的思想會左右世界。’”