1849年，老約翰因為一場猩紅熱而辭世，這場音樂世家父子兩代人的恩怨終於落下了帷幕。送葬的隊伍格外地聲勢浩大，維也納市民們自發前來，緬懷這位曾經也心懷夢想對音樂有著無限追求與渴望的藝術家。不知道那天，小約翰在想些什麼呢？曆盡艱辛的音樂家很多，但是和他們不同，小約翰的音樂之路最大的阻力不是來自於經濟上的困窘，不是來自於他人的腹誹嘲諷，而是自己的父親，自己那業已成名多時的身為音樂家的父親。這場父子之爭持續了小約翰近一生的時間。不知在老約翰臨終之時，他是不是也略微心生悔意，是不是也在悄悄替兒子的成就而驕傲呢？
1855年起，小約翰開始擔任聖彼得堡夏季音樂會的指揮，這一職位他擔任了10年，直到1865年結束。1862年，小施特勞斯與歌唱家吉蒂結成夫妻。吉蒂有著豐厚的財產，小約翰可以不必依靠演出來賺錢，得以將全部精力投入到作曲當中。這一時期，小約翰創作了圓舞曲的代表作《藍色多瑙河》。起初，他將藍色多瑙河設計為一首男聲合唱曲的序奏。但是這首名作剛問世的時候，並沒有得到認同，反而被認為是失敗。直到後來，小約翰應邀到巴黎參加國際博覽會，才想起了這首曲子，將它改編為管弦樂曲，結果在博覽會上演出後，獲得了全場的歡呼喝彩。1863-1870年，小約翰擔任了皇室宮廷舞會指揮，後來開始進行輕歌劇的創作。
1872年，小約翰在美國波士頓進行了14場演出。在美國期間，小約翰指揮著規模龐大的巨型樂團，得到了美國人民的熱愛。很多貴婦將他當做偶像來崇拜，甚至索取他的頭發來收藏。他的仆人總是來者不拒地向每個人送上幾根毛發。在離開美國的時候，人們驚奇地發現，小約翰的發量似乎沒怎麼減少，但是他身邊的那條紐芬蘭狗，身上的毛已經禿了。
事業如日中天的小約翰，在感情生活上逐漸出現了問題。1877年，他的妻子吉蒂被人殺死在家中。不久之後，小約翰再婚了，新娘是一位年輕的姑娘。年齡上的差異使兩個人矛盾重重，最終這一任妻子也離開了他。1883年，58歲的小約翰再次走進了婚姻的殿堂，這一次的新娘是一位更加年輕的姑娘，21歲的阿黛爾。兩人相濡以沫，在阿黛爾的照顧之下，小約翰保持著旺盛的精力繼續進行著音樂創作。
1889年，小約翰多了一位鄰居，他就是同為音樂家的勃拉姆斯。兩個人的住所隻有一牆之隔，於是他們常常一起散步，聊天。1893年，小約翰還將自己的作品《擁抱起來，億萬人民》圓舞曲送給了獻給了勃拉姆斯。這首曲子的題目來自於德國詩人席勒的《歡樂頌》。
1899年5月，奧地利傳統的聖母升天節當天，演出了小約翰的歌劇代表作《蝙蝠》的演出。74歲的小約翰·施特勞斯指揮了歌劇的序曲，這是他最後一次登上舞台。同年6月3日，小約翰·施特勞斯離開了人世。
主要成就：
小約翰·施特勞斯的名字和圓舞曲密不可分，他為圓舞曲的流行做出了不可估量的貢獻。最初的華爾茲是流行於民間的舞曲形式，難登大雅之堂，但是在他的推動下，這種舞曲成為了哈布斯堡宮廷中的高雅樂曲，因此被成為“圓舞曲之王”。他的作品不隻限於圓舞曲，還有一些波爾卡和進行曲、輕歌劇等也很受歡迎。
小約翰作有500餘首作品，主要是生活舞蹈性音樂，包括圓舞曲、波爾卡舞曲、進行曲及一些輕歌劇等。他的創作核心是圓舞曲，完成了這種源自連德勒舞曲的奧地利民間舞蹈曲體的深化和發展過程，從而使它具有真正藝術的特點。施待勞斯的圓舞曲以民間舞曲的節奏和其它表現手法為依據，民間色彩深厚，形象鮮明、旋律豐富，音樂語言真摯而自然。他曾戲言其筆下的旋律就好象水龍頭裏的水那樣滔滔不絕地流出，他常常早晨作曲，下午分發樂隊練習，晚上演出；加之某些商業的原因，他的作品並非首首都有是珍品。
他的圓舞曲獨具特色，旋律動聽，節奏明快，生機盎然，格調輕鬆，具有濃厚的民間色彩和豐富的旋律。施特勞斯訪美演出後感到了輕音樂和舞蹈音樂的局限性，轉而創作了16部輕歌劇、一部歌劇和一部芭蕾舞劇。他的輕歌劇雖是繼奧芬巴赫後出現的新成就，但沒有達到前者的水平。
其創作以《藍色多瑙河》《維也納森林的故事》《藝術家的生活》《春之聲》和《安娜波爾卡》等120餘首維也納圓舞曲著稱，被後人冠以“圓舞曲之王”的頭銜。他曾帶領樂隊訪問歐洲各國，使維也納圓舞曲風靡全歐洲。他的圓舞曲獨具特色，旋律酣暢，柔美動聽，節奏自由，生機盎然，是每年維也納新年音樂會的主要曲目。他還作有《雷鳴電閃波爾卡》等120多首源自捷克的波爾卡舞曲及幾十首其他舞曲。1870年起創作了《蝙蝠》《羅馬狂歡節》《阿裏巴巴與四十大盜》《吉卜賽男爵》等16部輕歌劇，對於歐洲輕歌劇的發展有著相當深遠的影響。