周順昌入獄後，五天受一次酷刑，舊傷未愈，新傷又生。每遭毒打時，破口大罵魏忠賢。許顯純氣的要死，就打掉他口中所有的牙齒，然後問道：這下子你還能罵魏公公嗎？”周順昌血唾其麵，雖言語不清，卻仍大罵不已。後來被許顯純用重物活活把周順昌壓死。
周宗建渾身都被許顯純釘上鐵釘，在周宗建身上每釘一枚，許顯純都問：“你敢不敢說魏公公‘目不識丁”了？”周宗建不服，又被澆以沸湯，結果皮膚卷爛、赤肉滿身，兩日之後周宗建被折磨而死。
繆昌期受審時慷慨陳詞，不屈不撓，十根手指盡被削落而殘死；黃尊素死時肌肉漲爛，頭麵無法辨識；李應升骨肉斷爛，竟讓人無法知道究竟是如何死法；周起元因交不出“贓銀”十萬而飽受榜掠，在獄中斃命身亡。
魏忠賢在致死前六君子、後七君子後，仍不願放下屠刀。他將“東林黨”的外延無限擴大，將所有不願依附自己的人統稱為東林黨；同時為了安慰因與東林黨結怨而歸順他的諸黨黨徒為自己賣命，又使人作《三朝政要》，將“三案”翻了個底朝天。魏忠賢以朝廷的名義公布了一個“東林黨人榜”，列異己分子及在“三案”中得勢的大臣共三百零九人，榜上有名之人，除前後諸君子外，又有刑部侍郎王之因在梃擊案中得罪浙黨黨徒而被餓死獄中，禦史夏之令因彈劾魏黨黨徒被拷死獄中，中書舍人吳懷賢因擁護楊漣被拷死獄中，後軍都督府張汶因酒後指斥魏忠賢被拷死獄中，吏部尚書趙南星維護諸君子、彈劾魏黨崔呈秀被遣戍並氣死於戍所，楊州知府劉鋒因在其所作詩中有“陰霾國事非”句暗指忠賢亂政而被砍頭示眾！據《明史》記載，在魏忠賢發動的這場浩劫中，冤死詔獄者有數十人、下獄謫戍者數十人、削籍奪官者二百餘人，其他因受牽連而遭革職貶黜者不可勝數！朝野上下殺機四伏。
魏忠賢喪心病狂地鏟除異己，引起百姓的憤慨。諸多百姓為之遙設虛祭哭魂家中；還有諸多近鄰送錢送物，照顧他們的未亡親人，楊漣的家人乞食度日時，連市場上賣菜的小販都前去捐資相助。百姓們還曾設法阻撓特務抓人，如東廠特務在緝捕周順昌時，當地數萬百姓群情洶洶，他們堵塞道路，為順昌喊冤。特務們自恃是奉魏忠賢之命，厲聲責罵眾人，百姓蜂擁而上，勢如山崩。結果一名特務被當場打死，其餘身負重傷、逾牆逃竄。被激怒的百姓還想斷水道、劫漕舟，後來地方官員出麵調解，此亂才平靜。魏忠賢為鉗製眾人之口，將廠衛特務遍布民間，監視百姓。民間偶語，稍有觸及自己，便將當事者擒拿歸案，嚴刑拷打以至剝皮封舌，所殺無數。曾有五名摯友在一起飲酒，酒酣時，其中一人開始痛責魏忠賢凶狠毒惡。其餘四人急忙勸阻，此人已醉，不僅不聽勸，反而對朋友們說：“那魏忠賢厲害，他又怎知我在這裏罵他？就是知道了，難道能剝了我的皮？”就在這天夜裏，這五人即被擒至魏忠賢麵前。魏忠賢指著醉酒詆毀自己的人對他的四位朋友說：“這人說我剝不了他的皮，今天倒要看看，我敢不敢剝他的皮。”令手下用大鐵釘將此人的手足釘在門板之上，再用瀝青澆遍其體，然後用木棒用力敲打。不一會兒，此人的整個肉身便從皮中脫出，而仍釘在門板上的皮殼卻依舊儼若一人。剝完了人皮，魏忠賢竟然還給已嚇得魂不附體的四個人每人紋銀五兩，獎勵他們曾阻止朋友說自己的壞話！消息傳出，舉國上下無論是官是民，人人不能自安，道路以目，誰也不敢對這個魏姓屠夫有半句微詞，說半點壞話！
魏忠賢從無賴少年至廠衛頭目，但他自己並不以此為足。東林黨經幾番屠殺之後雖已潰不成黨，魏忠賢的目的並不止於此，魏忠賢自有其“雄心壯誌”，付出所有努力的目的，就是要建立一個屬於他自己的王朝。
熹宗朱由校剛剛登基的時候，魏忠賢就有意每日帶著他嬉戲玩耍。魏忠賢自幼善騎善射，他左手執弓、右手持箭都能百發百中，看小皇上對此佩服不已，便鼓勵他勤學苦練；魏忠賢又熟諳民間十五六歲孩子的種種遊戲雜耍，他將這些東西一一“引進”宮中，讓玩心極重的小皇上玩的不亦樂乎、懶聽朝政。魏忠賢的努力沒有白費——熹宗朱由校耽於玩樂，並有連續數年不見朝臣的現象！
熹宗從小就特別喜歡做木工活兒。他不僅斧、鑿、鋸、锛樣樣使用起來都得心應手，造出的物件精美絕倫，還會用木頭搭踅房屋模型，並在上麵刷油漆。魏忠賢非常注意“培養”皇上的興趣，派心腹太監跟在皇上身邊同皇上一起切磋技藝，使皇上常年樂此不彼。造化弄人，作為一國之君，每逢朱由校聚精會神地削墨引繩時，魏忠賢的爪牙便飛報主子，而魏忠賢專揀這時候拿了大臣們的疏奏跑到皇上麵前裝模做樣地請示彙報。次數多了，熹宗朱由校皇帝便感到十分地不耐煩，終於有一天他對魏忠賢說：“今後這樣的事情不必再來煩我，你自己看著辦就是了。”朱由校沒有意識到，三看兩看朝政大權就落在了魏忠賢手中。