鄭國、呂不韋均為他國人，一些守舊的宗室大臣乘機煽動秦王政說：各國來秦求仕者，大抵是為其主充作說客、間諜的，請一律逐出！秦王政一時深信不疑，遂下詔逐客。李斯當然也在被逐之列。
在秦國施展才華，建功立業，是李斯多年的理想和抱負，一旦離開，便會付諸東流。於是他行至途中，憤筆疾書，寫就一篇《諫逐客書》，轉呈秦王。李斯在此書中，列舉大量事實，總結曆史上秦國重用百裏奚、商鞅、張儀、範睢等客卿得以變法圖強的經驗，直截了當地指出：“一切逐客”的做法，是“棄黔首以資敵國，卻賓客以業諸侯，使天下之士退而不敢西向，裹足不入秦，此所謂‘藉寇兵而齎盜糧’者也”。結果壯大了敵人，削弱了自己，後果不堪設想。他認為，廣招人才是“跨海內製諸侯之術”的關鍵。秦王觀罷諫書，幡然省悟，急忙收回成命，派人去追李斯。李斯至驪邑（今陝西臨潼）而返，官複原職，並得到進一步重用，不久被提為廷尉。《諫逐客書》為秦國繼續羅致天下人才起了不可忽視的作用。
李斯在重新得到秦王的信任後，便繼續竭誠輔佐秦王，積極進行吞並六國的部署和策劃。李斯根據當時形勢，一方麵繼續實行秦國傳統的“遠交近攻”的戰略方針，並在具體的作戰部署上，主張“先取韓以恐他國”，即先滅韓國，借以震懾其他國家，逐步完成統一大業。另一方麵，又采用新的策略，即政治攻勢，主要手段是間諜活動。這個策略是由當時的國尉尉繚一手製定、而由李斯付諸行動的。李斯根據尉繚的意圖定出具體措施：首先暗派間諜攜帶金玉財寶潛入各國內部，遊說諸侯，收買權臣，離間各國之間或國內君與臣；臣與臣之間的關係；對收買不成者進行暗殺，以製造各國的混亂和摩擦，以達到分化和瓦解諸侯國、粉碎六國聯合抗秦的陰謀；接著再“使良將隨其後”，率領大軍乘機發動進攻，各個擊破。這一套措施，在秦的統一過程中起到了重要作用。
秦王政前後僅用10年時間就消滅了六國，完成了“六王畢，四海一”的統一大業，其中原因是多方麵的，但李斯在統一過程中，輔佐秦王，籌劃謀算，設計定策，則起到了重要作用。
諫逐客、滅六國，這兩件事對於秦國、對於中國曆史的意義不言而喻，而對於李斯個人來說，更讓他達到了事業和人生的頂峰。
[智慧方圓]領導者做事，不可能總是一帆風順。高明的領導者正是在不斷遇到困難和解決困難的變局中取得成就的。對他們而言，困難麵前不言退是惟一的成功秘訣。但是，不言退也並不表示非要硬著頭皮往牆上撞不可，而是應該洞悉時勢，看到變化並在變化中尋找屬於自己的機會。