正殿前門牆內側左右，分豎兩通清代長方形石碑，半圓首，高1.75米，寬0.92米，厚0.19米，記述著順治年間廟宇的修葺情況。
萬佛寺除鍾樓、鼓樓無存外，主要建築正殿和殿內塑像均保存完好。正殿外觀為典型元明時代的硬山頂式，殿內的12尊塑像為縣內迄今發現、保存最好最高大之塑像群。
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萬佛洞在縣城東南50公裏的寧化鄉境內，與寧化城隔汾河相望，坐落在氣勢磅礴的管涔山支脈寧越山半山腰，山體為紫褐色的紫羅石。
萬佛洞總體建築位於山頂懸崖石壁之上，經人工鑿洞而成。洞前設月台，東西長25米，南北寬11米。台基內築有石洞4孔，其中一孔為僧人的食宿之處。洞內原有一清泉，泉眼處接有木頭水管，用水時泉水可直接流入僧人的飯鍋之內，不用時則以木塞塞住（現已毀）。另一石洞是攀登萬佛洞的通道，欲上萬佛洞可由此進入。
萬佛洞洞口高7.5米，寬8.9米，設有一門洞，高2.7米，寬2.85米。門兩側有兩石柱，達於洞頂，上書對聯一副：“智海圓充含萬象而不遺纖芥，真空方廣現森羅而不隱微毫”，橫批為“華藏海”。兩石柱旁還鑿有兩塊大石碣，碣麵平滑，各題詩一首。
南碣題頭為“銘佛碑記”，銘文為：“岩龕天設自升闊，宵壤渾然一法體，妙相圓充碧障間，靈光深隱丹崖裏。施能工運奇指鑿出慈容無數，已識得白毫處處彰乾坤，何所不如此，明萬曆丁巳仲春妙峰福登。”
北碣題頭為“古今流芳”，銘文為：“本自虛融絕等倫，圓光圓偏砌香塵。飛埃列障含華藏，秉識陶形顯法身。妙首音聳溪澗水，真如相覩碧雲嶙。毗盧性海渾無際，具眼何勞動口舌。登國辭兄偕友一舟覺通遊至蘆芽曆覽迷勝，逐興塔立規，偶至寧化河西，有石碑寺；待舉念券鑿萬佛洞，誘泉目種善因共登覺路右題二首，勒諸石以記歲月雲岩，萬曆丁酉仲春之古書。”
兩石碣高達丈餘，寬盈5尺，筆力遒勁，雖曆風雨剝蝕，字跡尚顯清晰。門首依岩壁鑿就立石匾額一通，上書“萬佛洞”三個大字，在二龍戲珠和團團菊花浮雕的陪襯下特別醒目，落款書“興縣石匠牛建位、牛紹禮、陝西石匠吳宗奇共刻，鬆鶴道人大立書”。
麵對兩石碣，我們心中一動，目光不由得又回到南碣的落款上。妙峰福登，是不是那位被明代萬曆皇帝封為“真正佛子”的妙峰法師呢？事後便趕緊翻閱有關資料，一查，果不其然！原來，頗受萬曆皇帝母親慈聖皇太後看重的妙峰法師，當年受慈聖皇太後之命，為其得一個孫兒祈禱，事後皇後果然生了一個兒子——就是後來在位僅僅29天的明光宗朱常洛。這一來，妙峰法師更是聲名大振。但他覺得，盛名之下，不可久居，便隱遁到了管涔山，於是也便有了我們這裏介紹的萬佛洞。另有一說，說萬佛洞是妙峰法師奉慈聖皇太後之命開鑿的。有關史料記載，妙峰法師開鑿萬佛洞是在萬曆二十二年，即公元1594年，歲在甲午；而石碣所書為“萬曆丁巳”，即萬曆四十五年，也就是公元1617年。由此推斷，萬佛洞當是於1594年開工，1617年完工，曆時23年。在當時的條件下，這無疑是一個浩大的工程，曆時23年也合情合理。
在妙峰法師主持下曆時23年開鑿的萬佛洞，確實非同一般。洞口頂部設有明窗兩扇，實窗兩扇。遠遠望去，兩扇實窗猶如鑲嵌了兩塊玻璃。中部有一石匾，所書字跡不清。“萬佛洞”三字寫於廟門下端，並雕有小石佛一尊。石洞東西長10.15米，南北寬9.5米，高9米餘。東西壁下築有牆基，高60厘米，寬40厘米。正麵有佛基，高60厘米，寬2.2米。正麵塑有釋迦牟尼佛像一尊，高2.8米，佛座高2.2米。佛右站弟子阿難，高3米。洞頂設有天花藻井，四角書有“華藏世界”，中部用八卦穿頂，高於洞頂。洞內中部兩石柱相對直立，直徑1.4米，與洞為同一基石；兩石柱下部有兩站殿將軍畫幅，高2.6米，寬1.9米；石柱中部有兩小石碣，高47厘米，寬43厘米，記有洞的來曆；柱頂部還塑有無數小佛。石洞東西兩壁繪有壁畫兩組，分天神地獄，畫高236厘米，上麵亦塑有無數小佛。南麵石壁下繪有功德碑4塊，上麵也塑小佛無數。正壁下部連同西壁畫幅上同樣塑小佛無數，小佛高18厘米。各處所塑小佛到底有多少？從未有人數得清清楚楚，想來，“萬佛洞”即由此得名。
立足萬佛洞，我們的心情久久不能平靜，既驚詫於工程的浩大，雕刻的精美，更為妙峰福登這位高僧所感動。就我們所知，妙峰福登不但是一位造詣高深的“真正佛子”，而且是一位技藝超群的建築學家。五台山標誌性建築大白塔，是他在阿尼哥等前人基礎上重新設計建造的；五台山顯通寺文殊殿、峨眉山普賢殿、南京寶華山觀音殿等三座銅殿（後兩座已毀），是他設計建造的；太原市的標誌性建築之一雙塔寺的雙塔，是他設計建造的；陝西三原渭河大橋，是他設計建造的……一生中他先後設計共建造佛殿無數，還設計建造佛塔6座，銅殿3座，大橋十餘座，給我們留下一件件很難再複製的文化瑰寶。我們真應該感謝這位高僧！
當然，值得感謝的絕不隻是一個妙峰法師。因為看了同在寧武境內而規模更為宏大、工程更為艱巨的清真山懸崖棧道和一座座懸空寺院之後，我們發現集高僧大德和建築學家於一身者還大有人在。
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我們得先來介紹一下清真山。
清真山亦係管涔山支脈，位於寧武縣城西南35公裏處的涔山鄉境內，由寶鼎峰、玉華峰、紫翠峰、凝碧峰、迎鶴峰、望仙峰、海日峰、掛月峰、麗雪峰和翔鳳山等九峰一山組成，東與分水嶺千年火山為鄰，西與神池、五寨二縣接壤，南連管涔山另一支脈樓子山，北望縣城摩天嶺，分布麵積二百多平方公裏，平均海拔兩千三百米左右。《寧武府誌》稱這裏是“最為勝地”，並繪有清真山示意圖，清晰地標示著九峰一山所在位置。
九峰一山的聲名遠播始於隋煬帝楊廣修築避暑行宮汾陽宮的隋代。因隋煬帝每次來這裏避暑狩獵，除宮娥嬪妃隨行、武將兵丁護衛外，還少不了像薛道衡那樣的文臣學士陪駕，所以九峰一山頗為講究的峰名山名，很可能出自隋代文人之口，無形中給九峰一山平添了幾分典雅。其直接結果是，這些峰名山名一經傳開，立刻引起佛家的向往。伴隨著李唐王朝的誕生，九峰一山便開始出現佛家的足跡。古籍記載，位於涔山鄉小石門村西的仙人洞便始建於唐，普應寺則至今留有唐代貞元年間的墨跡。不過，當時寧武境內佛教活動的中心在蘆芽山，清真山則處於邊緣地帶。
待到進入明代，在妙峰祖師等高僧大德推動下，寧武境內的佛事活動出現又一次高潮，重心便轉移到了清真山，著名的寺廟有北天寺、普應庵、仙人洞、朝陽洞、金安寺、天仙洞、地仙洞、七真洞、九仙洞、朝鳳洞、觀音廟等。普應寺重修羅漢殿碑記稱，當時“猿鶴參禪，魚龍聽法”，其盛況由此可見一斑。這一鼎盛局麵一直延續到清代。清道光十二年（公元1832年）碑記稱：“然而此山之壯麗，絕有奇觀，東有玉華之岫，西擁紫翠之峰，南照掛月之屏，北踞望仙之脈，四麵旋繞，勢若星拱，而或遷客至茲不忍去，騷客到此而願留題，誠聖境也，亦地之大觀也。自若非常之地，必出非常之人，所謂地靈則人必至。自國朝定鼎以來，有僧脫出名者眾矣。”
更為奇特的是，這些寺廟建築大都地處懸崖絕壁之上，由總長42華裏的古棧道項鏈般貫通串連，構成中國佛教史上絕無僅有、宏大規模堪與雲崗石窟相比的懸空古刹棧道群。
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懸空古刹棧道群的創建年代可上溯到唐代，存於仙人洞的文字和實物均可證明這一點。
仙人洞又名淩空寺，位於小石門村西一華裏棧道中部，是一座淩空“飛掛”於絕壁半腰的古刹，距穀底約50多米。現存大殿麵闊八間，進深兩間，分上下兩層。下層殿內有佛、道、儒三教人物壁畫，主供佛教地藏王菩薩；上層有閣，主供道教玉皇大帝。上下兩層主殿都是通天柱，前置走廊，走廊前為棧橋，棧橋上置望柱7根，下有十幾根木柱支撐。許多古建專家稱它是“中國懸空建築中的奇觀”。大殿左右，各有住房一間，住房內各有小洞。除此之外，因建築前部懸於萬仞絕壁，後部插入石崖洞中，再無別的門戶。西邊石洞壁上原有八卦圖，還寫有一段文字，其大意是：此廟建於唐，因火災幾毀幾建，與古棧道相銜，東可通往金安寺（也有資料記載，仙人洞即金安寺），西可到達龍王廟，並記載了這一帶的棧道裏程共計42華裏。近年來在仙人洞旁又挖掘出唐代經幢。專家們由此斷定，仙人洞始建於唐，而且規模很大，現存大殿僅是古廟宇中很小的一部分，並非主體建築。