一、加強企業重視程度
企業應當高度重視會計信息係統內部控製工作，根據本企業的特點建立一套科學完善的會計信息係統內部控製體係來加強本企業的會計信息係統內部控製工作，減少不必要的損失。會計信息係統內部控製則是降低風險，減少企業損失的一種非常有效的手段。風險是任何企業在其生產經營過程中固有的，但風險同時也是由於缺少有效的內部控製製度而產生的，完善的內部控製措施雖然不能消除風險，但其可以有效地減少風險發生的機率。所以加強企業重視程度尤為重要。
二、加強和完善企業內部審計機構的職能
在電算化環境下的會計信息係統中，對企業內部審計人員在工作態度和道德標準上有很高的要求。因此，企業在招聘內部審計人員時要對應聘人員進行背景審查，對於不能勝任工作或曾有不誠信記錄或案底的人員不予招聘。另外，要定期或不定期地對企業內部控製人員的工作情況、表現和業績進行評價和考核，以促使企業內部審計人員發揚優點、改進不足，更好地為企業服務。作為內部審計人員，有責任定期修正和完善本企業會計信息係統內部控製製度，並對內部審計中發現的薄弱環節采取相應的措施加以改善，杜絕會計舞弊事件的發生。此外，加強對企業內部審計人員的財務軟件及計算機知識的相關培訓，從而培養出不但熟悉國家相關的財經法規和審計準則，而且具備專業勝任能力的複合型內部審計人員。
三、企業內部審計人員應當參與到係統開發工作中去
如果讓企業內部審計人員參與到係統開發工作中，那麼在開發階段，內審人員可以與開發人員溝通，這樣開發人員了解到企業的真實需求，有利於提高會計信息係統在企業的利用程度，同時內審人員作為接觸信息係統的人員，熟知信息係統的弊端，可以對信息係統的開發給出建設性的意見，這樣的做法可以更為有效地促使計算機開發人員更好地將企業內部控製措施和審計功能嵌入到會計信息係統中去。進而有利於企業會計信息係統內部控製工作的順利展開。
四、完善企業會計信息係統安全控製措施
企業平時應該加強對會計信息係統軟硬件及運行環境的維護和保養，並及時更新計算機殺毒軟件，防止惡意病毒的非法入侵破壞會計信息係統，保障會計信息係統軟硬件、數據資源的安全可靠，係統正常運行。
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