預算執行組織應涵蓋全校內部的所有基層單位，執行組織設置的關鍵在於確定其預算責任目標。例如對開展正常的教學、行政管理、後勤服務等任務，可以參照成本（費用）中心，由其對本部門發生的成本費用負責；對科研工作可以采取成果導向，由項目小組對科研成果負責。
預算監控組織是負責學校預算監控任務的組織，對它們的監控任務必須明確，否則監控很容易流於形式。例如財務部門應負責對預算執行過程實施監控，審計部門負責對預算執行結果進行審核和監控，人事部門負責對各個崗位、各個部門的預算責任落實情況進行評估等。隻有明確監控部門的監控任務，才能為獎懲計劃提供依據，監控組織也才能突顯其威嚴。
（二）大力推進預算管理信息化
隨著高校辦學規模的擴大和資金運動的複雜化，預算管理已成為跨部門的係統管理，因此如果沒有信息化技術的支持，預算控製要充分發揮作用是無法想象的。預算管理信息化主要包括兩個方麵：一方麵是財務部門預算管理信息化，另一方麵是學校層麵的信息資源要共享、互通。
財務部門預算管理信息化主要是在現有財務管理平台上增加預算管理係統，解決預、決算數據不能互聯互通，難以對比分析的問題，建立和積累與預算管理相關的基礎信息數據庫，為預算管理提供信息支撐。
學校層麵的信息資源要共享、互通，主要是要充分利用網絡信息技術，大力推進數字化校園建設，整合學校管理資源，克服學校部門之間因條塊分割而出現的信息孤島問題，實現學校信息資源共享和互通。
（三）推進預算管理的製度化建設
“一切按製度辦事”是製度化管理的根本宗旨，預算管理的製度化是高校實現依法治校的具體表現。高校應通過預算管理製度來規範組織內教工個體或部門群體的行為，使學校經濟活動的運行依據的是共同的契約即製度，而不是其他如權力，逐步趨於規範化和標準化。
首先，應建立有效的風險評估和成本控製製度，特別是在重大預算分配決策階段。例如規定重大投資決策要有決策依據即風險評估報告、可行性報告及對未來學校成本支出的可能影響等。
其次，要建立有效的過程控製製度，包括預算內執行審批製度、超預算或預算外行為約束製度、授權批準製度、預算執行情況信息反饋製度、預算執行監督製度等。
最後，要有清晰的預算考評，而且預算考評與年度工作業績評價要結合起來。預算考評與年度工作業績考核不盡相同，預算考評既重結果又重過程，業績評價主要是關注結果，但是業績評價的結果評定是全方位的，強調與薪酬計劃、人事決策相掛鉤。因此，預算考評應與業績評價相結合，成為業績評價獎懲製度的重要組成部分，這樣不僅能彰顯預算控製的威懾力，而且無需另外重新建立一套預算考評製度，便於推行。
五、結束語
高校經費主要來源於財政性撥款，因此高校的預算管理改革應該適應國家財政管理體製改革的需要。但是，高校辦學規模的日益壯大和資金來源的多樣化也對高校在控製成本和優化資源配置等方麵提出了更高的要求，因此高校的預算管理改革要更多體現自身需要，切實提高高校的成本控製水平和資源配置效率。正如中山大學校長黃達人在《中國大學管理的成本與效率》一文中提出“大學需要引入經營理念，成本意識和效率觀念應該貫穿於中國大學管理體製改革的始終”。
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