另外，因為北平布政使張昺已被殺。燕王自己任命了官屬管理北平地方事務，朝廷不得已隻好在真定設置了“平燕布政使司”，任命曾經做過北平“采訪使”的尚書暴昭。駐真定署理平燕布政使司。
而那位自稱精通“數術之學”，而曾預言“北方兵起期在明年”的嶽池教諭程濟，此時因其預言應驗，被從牢裏放出，授以翰林偏修之職，令其作為軍師，隨耿炳文等將北行。建文帝或許希望程濟的從軍，會給朝廷帶來好運呢！
建文帝在奉天殿舉行隆重的“遣將儀”。這是他登基繼位以來第一次舉行此類儀禮。遣將征伐，敵人不是北元，不是南蠻，而是“自家骨肉”，這讓他心裏頗不是滋味兒。他看到那“征虜大將軍”已六十五歲，白須飄飄，擎了節鉞往殿外走時，雖故意地挺著胸脯，卻也是挺不直的了。那時便有一種莫可名狀的悲涼浸漬於心頭……那時候他想起了洪武二十六年春天，涼國公藍玉被太祖誅殺，臨刑前曾麵向皇宮嘶喊：“朱公，朱公！何不留一二大將，以防不測啊！”這喊聲撞擊他的耳鼓，震撼他的心房。唉！藍玉早就窺出燕王有謀叛之心，果然被他不幸而言中。倘若藍玉尚在，令他統兵備邊，燕王怕也不敢輕舉妄動呢！征伐燕王的大軍浩浩蕩蕩出發了。一連數日，應天城西北江浦渡口，擠滿了戰車、騾馬和蟻群似的兵士。另外也有一些送行的將士家屬。耿炳文率中軍出發的這日，江岸十幾裏早已圍起了帳幕，羽林軍列隊把守，百姓們隻能站在高處觀望。因為今天皇帝要親率百官來渡口為耿將軍等送行。耿炳文此前已具牲幣祭告過武成王廟，陛辭時，皇帝已表示要親自為他餞行。此時江邊上五彩旌旗颯颯招展，金鼓銅鉦一遍遍擂奏。建文帝立於臨時搭建的彩棚內，耿炳文披甲戴胄稍下西向而立，文武百官按品級兩旁站列。
承宣官喊一聲：“皇上賜征虜大將軍酒。”接著由教坊司安排的樂班奏響《平定天下之曲》和《撫安四夷之曲》。樂聲中執事官和內侍跪呈杯盞。建文帝擎杯道：
“今以此酒賜卿，望卿督勵三軍，翦除叛逆，勘定幽燕，早日報捷，以釋朕懷。”
耿炳文跪地接過樽爵，朗聲答回：“老臣蒙陛下不棄，授以大將軍節鉞，此去定肅清叛氛，獻俘於午門！”說罷，將樽往嘴上略碰一碰，然後酹於江岸。
建文帝執著耿炳文的手，默默地往船上走去。看到炳文及諸將們雄赳赳氣昂昂的樣子，他感到欣慰，但又有一種莫名其妙的憂慮悄然浮上心頭。這種憂慮來得太突然，也太奇怪了。讓他猝不及防，也無可奈何。
於是建文帝——這個內心世界非常複雜的皇帝，這時候對耿炳文及其他將領，冷不丁地說出了如下一段話：
“昔蕭繹舉兵入京，常號令軍中，謂一家門內，自逞兵威，實屬不祥。今卿等與燕王對壘，亦須善體此意，勿使朕有殺叔父之名啊！”
耿炳文等先是一愣，懷疑自己的耳朵出了毛病；但旋即也就聽清楚了，並且也理會了皇上的心思。他們麵麵相覷，默默頷首。然後，在皇上複雜的目光裏，登舟而去……建文帝在返回皇宮的路上，默默地坐在車輦裏傻想：剛才我究竟對長興侯等說了些什麼？他們為何用一種怪異的眼神兒盯我？
他當時並不清楚，甚至以後也未必清楚，他的這條“聖諭”，對與燕軍的戰爭，產生了多麼大的作用啊！
自相矛盾的建文帝啊！作為“人”的朱允炆，和作為“皇帝”的建文帝，哪個是真實的呢？