實際上，盡管男孩和女孩有一些相同的荷爾蒙，但是這些荷爾蒙所發揮的作用並不相同。可以說，女孩和男孩的差別是與生俱來的。
女孩和男孩在大腦結構上的差別
種種現象表明，女孩和男孩的很多差別是與生俱來的，那麼女孩和男孩的大腦結構的差異究竟都有哪些呢？要了解這些差異，首先要認識一下大腦。從人們的日常活動來說，大腦是一種物質基礎。它既是人類活動的內在原因，也是其外在的表現。通常來講，人類的大腦可以分為大腦皮層、邊緣係統和腦幹三個部分：大腦皮層位於腦的頂端，共分為四葉，在人的發育過程中是最晚進化的；邊緣係統，位於腦的中間，在進化時比大腦皮層要早；腦幹，位於腦的基部，在人的發育過程中是較早進行的。大腦皮層主要與我們的思維、決定、想象和語言創造有關。邊緣係統主要通過位於它內部的視丘下部腺體，對體溫、睡眠周期和月經周期等進行控製。腦幹是我們對選擇反抗還是選擇逃跑作出反應（我應該逃跑還是還擊）的部位，控製呼吸和消化也是它的基本功能。邊緣係統的功能就是情感的加工處理和直接控製，就像交通總指揮一樣，它對我們的知覺、記憶、壓力和其他的刺激進行控製。科學家們研究發現，在幾百萬年前，人類隻有腦幹，腦幹周圍的邊緣係統和大腦皮層是後來才陸續出現的。我們把大腦皮層習慣性地稱為“灰色物質”，它大致分為枕葉、頂葉、顳葉和額葉四葉，每葉都是由數十億個細胞結合在一起的。從生理學上說，大腦皮層的四葉可以分為左右兩個半球，兩個半球間通過一束神經連接在一起。在這四葉中，還有更小的一葉，叫作“前額葉”，它位於前額的後麵，是這四葉中的一部分，它控製著人的道德和行為規範。
通過科學研究發現，女孩和男孩大腦結構的差異主要表現在兩個半球、大腦皮層物質、海馬趾上。女孩與男孩大腦的發育，始於相同地方——額葉、顳葉、前額葉、邊緣係統等，但其各自的發育又存在著很大的差異。女孩在出生以前，她們的大腦就處在發育狀態，腦幹上慢慢形成邊緣係統，在邊緣係統上逐漸形成新大腦皮層。當女孩降生的時候，她的大腦已經成為一團有著無數細胞通過神經遞質相互聯係、相互作用形成的物質。其結構是由遺傳決定的，但它的結構也會因個體的不同而有所差別。
當然，女孩的大腦也是右半球先發育，然後是左半球。然而，女孩的大腦從右向左發育的速度要快於男孩。這樣，女孩比男孩更早學會說話的原因就不難理解了，因為正是大腦的左半球控製著人類的語言中樞。
當女孩學走路的時候，大腦皮層的枕葉就會得到更快的發育，這讓女孩能夠接受更多的感性材料。例如，女孩可以準確地從很多聲音中辨別出爸爸媽媽的聲音，因為她們對聲音比男孩更敏感。此外，女孩的觸覺、聽覺、味覺也是如此，她們的內心世界也比男孩更加感性。這就可以解釋為什麼女孩更喜歡抱著洋娃娃了。
與女孩相比，男孩的大腦隨著年齡變化而有些差別。男孩大腦的右半球優於女孩，他們具有更強的空間感，但相對缺乏感性。男孩大都不喜歡安靜地坐著，他們總愛四處亂跑。他們看到一樣東西就想抓著玩，總喜歡打打鬧鬧。
人的大腦是通過神經遞質的傳遞來完成學習和工作的，但是男孩和女孩的神經遞質的性質是不同的。例如，女孩的大腦會比男孩分泌更多的5-羥色胺（serotonin），這種物質可以控製人的衝動情緒，這樣就很容易理解為什麼兩三歲的女孩比同齡的男孩子更安靜了。
女孩的大腦還可以分泌一種被稱為催產素的物質，這種物質與照顧孩子有著密切的關係。在生活中，無論什麼年齡的女孩都會對洋娃娃產生一種喜愛之情。一項科學研究還表明，除了人類之外，那些雌性的靈長類動物在接近嬰兒、小動物或者其他弱小的對象時，大腦也會分泌出這種物質。
到八九歲的時候，大腦的另一個部分——海馬趾變得活躍起來。海馬趾位於每一側腦室的下沿，是形如海馬一樣的突起。儲存記憶是它最大的功能。研究表明，女孩具有比男孩更大的海馬趾。更值得注意的是，女孩海馬趾中的神經元在數量和傳遞速度上也超過男孩。生活中，我們很容易看到女孩的記憶力比男孩好。比如，同時要求兩個同為8歲的女孩和男孩去疊被子、擦桌子、倒垃圾，結果你會發現，女孩不需要你再次提醒就能做完這三件事，而男孩可能幹了這樣忘了那樣。為什麼女孩與男孩在海馬趾的結構上有如此之大的差異呢？從科學上的角度來講，這是進化的結果。在很久以前的未開化時代，女性負責照顧孩子，而男性則外出打獵，這種狀態一直持續到大約一萬年前。男女的不同分工也造成了大腦結構的差異。為了更好地照顧孩子，女性大腦的左半球需要更好地發展，以產生語言和聲音；海馬趾更好地發展，這有助於她們記住那些複雜而瑣碎的事情。為了更好地照顧孩子，她們變得更為敏感；為了在遇到危險時保護孩子，她們便不像男人那樣衝動，而是三思而後行。