性發育階段的衛生很重要，它不僅關係著孩子的性發育，而且還影響到孩子將來的結婚生育。青春期是兒童身體和心理上的“多事時節”，容易患病，這對於12—13歲的孩子來說是難以防範的，家長要給予關心和指導，提前讓孩子了解有關的衛生知識，確保孩子的身心健康。以女孩的經期衛生為例，家長要指導她們做到“六要六不要”：①要心情舒暢、情緒穩定，不要精神緊張、焦躁不安；②要防寒保暖，不要涉水、淋雨、用冷水洗澡；③要經常用溫水衝洗陰部，保持清潔，不要坐浴，防止細菌侵入；④要勤洗、勤換月經帶，不要與他人合用臉盆、毛巾、腳布；⑤要適當運動和勞動，促進月經流暢，不要做劇烈運動，重體力勞動；③要合理營養、充分休息，不要吃生冷和辛辣食物，不要過分興奮。
女孩子在每次月經前後或行經期間，常有一些局部和全身的反應，如腹部劇痛、腰酸、乳脹、腹瀉、便秘和疲倦嗜睡，情緒煩躁，頭痛失眠等，這叫做痛經，一般不會影響孩子的學習和生活，隻要解除精神顧慮，很快會過去的。也可用紅糖生薑熬水（紅糖50克，生薑15克），讓女孩趁熱服下，能夠減輕症狀。女孩如有下列情況，家長就應帶她去醫院檢查，並根據醫生的建議做相應的治療：①8歲前有陰道出血，15歲後仍未來月經；②初潮後閉經半年或月經有規律後又閉經兩個月以上；③月經過少或月經過多；④嚴重痛經，白帶過多，外陰瘙癢；⑤急性下腹部疼痛，腹部有包塊；⑥乳房發育過大或過小，兩側乳房有明顯差異，多毛。
男孩子性發育初期的變化沒有女孩那麼明顯，那麼集中，常為家長們忽視，這是不應該的。家長要告訴孩子每月有幾次遺精是自然的生理現象，不必驚慌失措，每次遺精後要及時洗換內褲，清洗陰莖。家長要教育孩子平時不要過多注意自己和異性的性器官。把注意力放在學習和健康的活動中，避免性刺激的幹擾。家長要指導男孩穿寬大的襯褲，免得陰部受擠壓，還要讓孩子養成早睡早起的習慣，每天早起到戶外鍛煉。初入青春期的男孩子可能會出現包皮過長、外生殖器炎、睾丸下降不全、精索靜脈曲張、遺精頻繁或滑精（清醒時發生的遺精）次數過多等病症，對此家長要請醫生檢查、治療。