（三）加強國庫集中支付的信息網絡建設
國庫集中支付主要通過網絡傳輸各項數據，高校應建立一套高速、穩定、安全的與財政、銀行的信息係統相兼容的網絡體係，以實現與銀行、財政、稅務部門的接軌，構建聯合信息網絡，實現數據共享，保證網絡暢通和信息準確，進而保證國庫集中支付的正常運轉。同時，高校也應該升級係統的硬件配置，加強網絡建設，參與軟件開發，保證數據的安全，降低財務會計核算的工作量，提高工作效率。因此，網絡是國庫集中支付的重要技術手段，是保證整個支付係統信息交換的平台。
（四）推行公務卡結算
目前，現金報銷這種方式已經落後於現代科技發展，成為製約高校財務管理水平提升的重要因素。公務卡結算既不需要提前借款又可減輕財務工作量，有利於財務部門監控支付的規範性，所以公務卡的啟用，將使傳統的現金報銷退出曆史舞台。公務卡結算方式的作用主要有三點，一是增強公務支出的透明度，防止腐敗行為的發生。使用公務卡消費支付，能夠在國庫集中支付係統中顯示出消費的時間、地點、金額，有效地防止資金挪用、截留。二是有利於提高高校財務工作效率。公務卡結算減少現金支出，簡化報賬流程，降低工作量，提高工作效率。三是提高高校的資金使用效益。使用公務卡結算方式為高校減少了借款的資金占壓，提高了資金的使用效益。
（五）對分校區設立零餘額分賬戶
麵對高校有多個分校區的情況，依然運用一個零餘額賬戶已經不能滿足學校正常運轉的需求。建議采取主、分零餘額賬戶的管理方式，由財政與人民銀行溝通協商，製定允許預算單位在同一銀行設立零餘額分賬戶的相關政策，經財政、高校主管部門和銀行共同審核批準，在預算單位的零餘額賬戶下設立分賬戶，辦理分支機構的日常業務，銀行負責該高校主、分零餘額賬戶的管理，並通過主零餘額賬戶與國庫集中支付係統進行結算，保證國庫集中支付製度的順利推進。
（六）加強財政、學校、銀行之間的合作，適當延長國庫業務的辦理時間
銀行貸款已經成為高校發展資金不可或缺的重要來源，如果因為實行國庫集中支付而阻礙了這條融資渠道，將嚴重影響高校自身的發展，因此，加強財政、高校、銀行之間的合作，政府靈活處理高校賬戶的開設，允許高校在貸款銀行設立一般賬戶，確保融資渠道的暢通，緩解高校資金壓力，是推動高校發展、保證國庫集中支付順利實施的重要手段。目前，辦理國庫集中支付業務主要集中在上午，這給高校的會計核算和對賬工作帶來了不便，當天的業務不能如實反映，很容易造成票據丟失，也給對賬工作帶來了難度。很多高校為了新建校區，將校址選在了偏遠處，距離財政指定的代理銀行較遠，財務人員到銀行辦理國庫集中支付業務，將耗去大量時間，有時業務辦理不成功，還需要隔天再去，這大大降低了工作的效率。如果銀行將辦理國庫集中支付業務的工作時間延長為一天，既方便高校辦理國庫集中支付業務，又能提高工作效率。
總之，國庫集中支付製度是一項全新的管理模式，涉及麵廣、工作量大，高校需要建立健全相應的控製製度並具有完善的管理體係，才能實現國庫集中支付製度的目標，推動我國教育事業健康、快速發展。
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