隨著青春期的來到，除了身高體重等的變化外，男孩子變化最大的還是生殖器官。男孩子的生殖器官一般分內外兩部分：內生殖器包括睾丸、輸精管和附屬腺；外生殖器包括陰囊和陰莖。這些器官在青春期前發育非常緩慢，進入青春期後，在促卵泡生成激素、促黃體生成激素及雄激素的作用下，開始迅速發育，其速度遠遠超過其他係統。所以很多男孩對自己生殖器官的變化充滿了好奇。
陰囊這時已經發育成一個起皺的小口袋，由腹壁皮膚形成，顏色比周圍皮膚深。陰囊分左右兩半，正中聯結起來，左右兩半囊裏各有睾丸和附睾一個。陰囊的皮膚有彈性，表麵皺褶很多，氣溫高時鬆弛，皮脂腺和汗腺分泌旺盛，加速散熱；氣溫低時收縮，減少散熱，並向身體靠攏。陰囊的這種自動調節功能，主要是保護睾丸的生精功能。
睾丸是男性生殖器官最重要的一部分，它是一對卵圓形的腺體。睾丸容積在青春期前僅大於嬰兒期，不足3毫升。進入青春期後，睾丸的發育相當迅速，容積可達12毫升以上。裏麵曲精細管長度及曲折程度增加，管腔增粗，管壁基膜上精原細胞不斷分裂繁殖，出現各期生精細胞，最後發育成精子。睾丸還分泌雄性激素，因此睾丸除了是生殖器官，還是內分泌器官。
睾丸在胎兒期是在腹腔內的，出生後才下降到陰囊內。有的男孩陰囊裏沒有睾丸或隻有一側有，這是由於睾丸還停留在腹腔內未降下，醫學上稱為“隱睾症”，應及早去醫院檢查治療。男性生殖器官的附屬腺有精囊、前列腺、尿道球腺等。青春發育開始後，上述諸腺體均迅速發育並分泌液體，與精子混和後形成黏稠的乳白色精液。遺精是男性特有的生理現象，是青春期發育的重要標誌。青春期後，健康男性均可發生。
陰莖是男性的性行為器官，其前端是龜頭，神經纖維豐富，是最敏感的部位。睾丸發育一年後，陰莖開始增大增粗，17～18歲時發育如成人水平。包在龜頭外麵的一層薄薄的皮膚，叫包皮。
男孩子的生殖器官正處於發育時期，所以家長一定要叮囑孩子做好對生殖器官的保護工作，不要讓它在青春期裏留下隱患。
1.應該讓孩子養成經常清洗陰莖的習慣。男孩的包皮通常是蓋住陰莖頭的，隨著青春期發育的開始，陰莖上的包皮會逐漸向上退縮，慢慢露出龜頭。在這一變化過程中，陰莖頭部冠狀溝內很容易聚積汙垢，形成“包皮垢”。包皮垢是細菌的良好棲息之地，它很容易導致包皮和陰莖頭發炎，這種炎症甚至和陰莖癌的發生也有一定程度的關聯。所以，男孩應經常清洗陰莖，並將包皮往上推送，用溫水清洗。每次遺精後，不但需要換內褲，還應及時清洗陰部。
2.讓孩子養成勤換內褲的習慣，以保持外生殖器的清潔。內褲最好選用透氣性好的棉紡織品。男孩穿著的內褲應略為寬鬆，切忌不要為了好看穿緊身內褲。男孩的睾丸需要在略低於體溫的環境中才能很好地發育，如果內褲過緊，長期將睾丸貼緊身子，容易影響睾丸的生精功能，對日後的生育能力有很大的影響。
3.若發現生殖器有問題，要及時到醫院泌尿科檢查診治。青春期男孩生殖係統的疾病一般有兩類：一是泌尿生殖係統的先天畸形，如陰莖畸形、異位尿道、隱睾症、先天性睾丸發育不全等；另一類是泌尿生殖係統的常見疾病，如腎上腺增生症、前列腺炎、包皮過長或包莖、包皮炎等等。如果發現以上疾病要及時去醫院治療。
男孩喜歡運動和奔跳打鬧，家長要告訴孩子隨時注意保護自己的生殖器，同時切記，千萬不要踢打他人的下身。睾丸是人體重要器官，它十分脆嫩，又因為露在外麵比較容易受到傷害，因此要十分小心地保護。