當世紀之交新一輪煤炭緊缺的風暴再次到來時，國有煤炭企業承擔國民經濟建設的重任責無旁貸地開足馬力生產，以滿足國家缺煤的需要。但因為投入嚴重不足，管理技術人員匱乏，難以適應煤炭市場對煤礦生產的需要，結果煤炭企業普遍出現超負荷生產，導致特大安全事故頻繁發生，國家和人民的生命財產遭到嚴重損失。
國務院緊急頒布《特別重大事故調查程序暫行規定》（國務院令第34號）和《煤礦安全監察條例》（國務院令第296號），1993年的民進中央的一份調查報告中分析到了安全生產投入不足必將造成嚴重的社會問題：安全生產、勞動保護上不了國民經濟計劃。從“六五”到“七五”勞動保護發展和措施計劃多次上報，多次被砍掉。“八五”計劃中雖然在宏觀上有要求，但具體項目一個也沒列上，因而，各地政府部門的經濟計劃也很少有列入的。到了企業更是難辦，發生了特大事故就給錢，不發生事故即使隱患再嚴重也沒有錢。報告並建議對更新改造資金少、負擔重的老煤炭企業適當提高折舊率和大修基金比例，以籌集資金，恢複安全生產後勁，在國家規劃中應補上安全生產發展技術措施的計劃，以有計劃地解決事故隱患和職業危害惡化的問題。
就煤炭企業而言，國家除對資源枯竭礦井實施政策性破產，淘汰落後的生產方式，加大投入和安全資金的提取外，仍然把整頓煤炭生產秩序，關閉非法開采小煤窯，作為重中之重，頒布了國家發改委發〔2006〕82號文件，要求認真貫徹國務院關於進一步做好煤礦整頓關閉工作的緊急通知。
通知指出，國務院辦公廳下發了關於進一步做好煤礦整頓關閉工作意見的通知，是國務院在認真分析我國煤炭工業形勢的基礎上，就進一步推動煤炭產業結構調整和優化、促進煤炭工業可持續發展做出的一項重要決策部署。
通過持續的整頓關閉,我國煤炭生產秩序得到根本性的好轉，有力地促進了煤炭工業的發展。尤其是在科學發展觀指導下,國有大煤業集團的組建,使煤炭工業不管從建井技術，煤炭開采、安全生產，以及煤炭深加工等方麵已經趕上和超過國際水平。
在礦井建設技術和速度上，中煤一建實現了1000米豎井當年開工，當年到底，在高複雜地質大量湧水的情況下，全段凍結深度施工達到700多米，建設者在每小時湧水1500立方米的條件下施工，月成井100米以上，擁有了一井一麵，年產量1500萬噸的特大型礦井。
神東公司實現了年產煤1.2億噸零死亡的驕人成績，煤直接製油的全球理論數字，在我國通過實驗試驗後，建成開始出油，再加上煤炭企業關閉破產政策效果的顯現,煤礦棚戶區、沉陷區治理力度的加快，煤礦安全欠賬償還步伐的加快，國家本著以人為本的安全管理監督長效機製的建立和健全，神華、兗礦等一批具有世界前沿管理技術和裝備水平現代化礦井先後投產，使我國煤炭工業真正走上了可持續發展的快車道。
國家煤炭工業協會會長王顯政在紀念煤炭工業改革開放３０年暨行業表彰大會上做出這樣的總結：
煤炭供給由短缺轉變為總量基本平衡，滿足了國民經濟快速發展的需要。2007年原煤產量達到25.26億噸，比1978年增長了4倍以上。
煤炭經濟體製由計劃經濟轉變為社會主義市場經濟，市場化程度和經濟運行質量穩步提高。2007年規模以上煤炭企業實現利潤1002億元，2002年增長了10倍以上。
生產結構由煤礦數量多、規模小轉變為大基地、大集團、大煤礦為主體，產業集中度顯著提高。到2007年底，全國大中小煤礦產量比重為50：12：38。
生產方式由手工作業和半機械化為主轉變為機械化、現代化為主，科技進步明顯加快。國有重點煤礦采掘機械化程度由改革開放初期的30％提高到2007年的86％。
煤炭產業由單一產業、單一經營轉變為以煤為主、綜合發展的多元化格局，結構調整取得突破。
安全狀況由事故多發轉變為總體穩定趨於好轉，安全生產取得明顯成效。2007年全國煤礦百萬噸死亡率由1978年的9.44％下降到1.485％。
對外開放步伐加快，煤炭工業國際影響力不斷提高。煤炭出口量2003年達到9400萬噸，躍居世界第二位。煤機產品出口、技術和勞務輸出、境外資源開發逐步加大。
行業管理由單純的行政計劃管理轉變為市場引導、依法管理，煤炭法製建設步伐加快。煤炭工業初步走上市場引導、政府調控、依法管理的軌道。
中國加入世貿組織以後，中國煤炭工業將和國民經濟同步發展，以每年7％－10％的速度增長。