（二）財務管理製度不健全
“沒有規矩，不成方圓”，任何的事情都要在一定的標準之上進行。我國現階段行政事業單位一般都有自己的內部管理機製，但是很不完善。專項資金的把關不嚴格，內部控製覆蓋麵不全，往來項目的資金流動情況不能夠及時進行記錄，導致財務風險大，抵禦風險的能力不強。另外，雖然近年來資金的投入在不斷增加，但是行政事業單位卻缺乏科學的理論指導，投資缺乏風險意識，決策過於草率，沒有合理的製度作保障。
（三）資產管理混亂
行政事業單位的資產主要來源於國家財政部門的資金投入，國有資產的管理是整個行政事業單位的重要組成部分。但是單位內部部門出現了資產管理相互脫節的現象，一些單位沒有建立明細賬，不知道資金使用的具體方向，導致了資產管理人員不了解賬麵上資產的存儲情況，有時甚至出現賬實不符、責任不清的情況。
其次，國有資產的使用率低下。單位之間互相攀比、盲目、重複的購置資產，再加上資產運作都是在單位內部進行，使得無法實現資金的跨單位配置，致使部分資產浪費嚴重，不能發揮應有的功效。
最後，有的單位為了個人利益通過虛列支出、資金返還或是將一些收入轉到本單位不入賬，設立小金庫，建立賬外賬。這種情況的出現，也使得資金大量流失，管理異常混亂。
（四）行政事業單位財務工作人員素質差距大
要保證行政事業單位財務管理工作高效、快速、合理的運行，就必須保證員工的素質，隻有提高員工的整體素質，才能保證信息的真實可靠，賬目的清晰合理。目前我國行政事業單位的財務信息失真現象比較普遍，許多員工利用職務之便獲取利益。麵對這樣的情況，提高財務管理人員的綜合素質是防範信息失真的根本手段。另外，我國行政事業單位的財務工作者素質參差不齊，也使得會計信息記錄的質量低下。因此，必須要進行培訓和選拔，挑選出一批具有高素質，高能力的財務人員，保證行政事業單位的財務管理工作高效、快速進行。
四、完善我國行政事業單位財務管理的對策
（一）對我國的行政事業單位財務管理進行合理預算
進行合理地預算是保證行政事業單位更好的進行財務管理的基礎，要認真做好預算編製工作，主要應該做到以下幾點。第一，正確編製財務預算，不得隨意更改；第二，采取有效的激勵措施保證預算目標的實現；第三，實行預算執行中的考核製度；第四，加強預算信息反饋。
（二）完善財務管理製度，深入管理改革，遵循科學管理的理念
我國各個行業的行政事業單位都要以國家宏觀調控為基礎，並結合本單位的實際情況建立可行的會計核算流程。明確規定預算的評價、編製、監督和執行流程，製定的製度必須體現可操作性和適應性。完善內部財政管理製度，可以約束財政管理人員的行為，減少違法亂紀的現象，細化責任，保證資金的安全，提高資金的利用效率。
行政事業單位的財務管理要嚴格遵循科學的管理理念，這樣做有利於單位財務的正常運轉和長遠發展。要做到科學管理，就要樹立正確的思想觀念，深入管理體係改革，改變舊有的管理陋習，不斷創新。
（三）實行考核審查，提高監督能力，進行業務培訓