（2）加強內部管理，用好包括國有在內資金的重要措施
改革開放以來，醫院存在的社會環境與政策已經發生了深刻的變化，這使得醫院的發展觀念也發生了大的變化。如醫院的籌資環境和籌資渠道除國有資金投入外，爭取銀行貸款、與其它企業聯辦醫院等，這使得財務管理越來越注意醫院的成本節約與經濟效益，這就使得醫院的經濟屬性得以加強，從而必然引入一些企業管理方法來改進及評價醫院的內部管理。據衛生部統計，2004年在全國綜合性醫院業務收入中，政府財政撥款僅占業務收入的5.24%，占業務支出的5.43%，醫院的收入來源絕大部分靠業務收入。
（3）為人民提供更好服務的間接基礎
隨著人民群眾收入增加和生活水平的提高，對就醫環境的要求越來越高。這使得醫院必須考慮完善基礎設施，引入新人才、新設備。全麵預算包括資本性支出與經營支出，同時，對於資金的開支效果也要進行考核。因此，隻要能夠妥善做好全麵預算管理工作，就能夠使醫院的資金使用更有效率，醫療設備更加先進，醫療水平大幅度提高，使人民群眾的就醫需求得到更好的滿足。
二、醫院當前預算管理的現狀分析
1、當前醫院預算管理以部門預算為基礎
如前所述，目前醫院預算管理是客觀存在的，隻是本質上來說還是屬於傳統的財政部門預算性質，即重點強調收支方麵的指標，以滿足上級主管部門如衛生局、財政局的統計為主，而並非真正立足於改進醫院本身的內部控製與管理。
2、當前醫院預算管理的思路有待改進
首先，以收定支，開源節流，是財務管理的重要原則之一，但目前的醫院預算沒有籌資預算，在客觀上造成了資金流動性風險；其次，醫院也沒有建立往來款預算，但實際上，醫院的經濟活動變得越來越複雜，住院預交金的管算、醫保病人費用的管理與結算、采購與結算、房屋建築與改造等，都涉及到往來款項的管理，有些醫院應付款項達到上億元；再次，醫院基本沒有建立采購預算，醫院藥品成本約占醫院成本總額的30%～40%。但是許多醫院不做采購預算，沒有庫存限額管理，給醫院的資金管理大隱患；最後，醫院也未編製責任預算。醫院預算隻編製到院級預算，沒有進一步分配到部門和科室，對部門和科室沒有任何約束力，保障不了預算收支目標的實現。醫院很難根據業務情況對各科室、醫護人員進行責任認定與考核。
3、當前醫院預算編製的方法有待改進
根據行政事業單位部門預算的基本模式，醫院往往采用基數法編製預算，即根據基期（上年）數據，結合本年業務變動情況的增量，來預計來年的預算收支規模。但這種預算編製模式的通病是彈性較小，靈活性差，且無論是收入還是支出，往往都是在基數上進行增加而非減少。但客觀情況是，由於醫院的收支與投資，都往往不再呈現出很有規律的變化，因此這種編製方法是應該改進的。此外，某些醫院或部門可能利用以前並非通常的數據來作為未來預算的編製標準，有意擴大預算支出指標。
三、醫院實施全麵預算管理的措施探討
1、更新觀念，結合新醫改的思路推行全麵預算
新醫改方案指出，保障最廣大人民群眾的基本醫療需求是公立醫院麵臨的一項基本任務。由此可見醫院必須將社會效益放在第一位，醫院實施全麵預算也應圍繞著這方麵進行考慮：第一，國家將推行社區醫療體係。而這些社區醫療網點也有可能歸於公立醫院，以發揮大醫院的業務帶動，促進居民“小病在社區”的理念。這事實上形成了大醫院對於小醫院的管理。全麵預算管理應當考慮這種“鏈鎖式”醫療網點資金投入、財務管理與風險控製；第二，完善藥品采購預算管理。推廣基本藥物製度是新醫改的核心環節，這可能涉及到醫院收入調節或政府補貼的方式，從而導致醫院資金流將更為複雜。因為從采購到使用，到補貼的申請，既有周期的時差，又有價格的價差，從而使得藥品采購預算更加複雜；第三，著重抓好現金流預算。由於醫院的公益性質，在國家的投入、補助和向患者收費一定的條件下，必須做好資金支出預算、資金成本測算，隻有通過控製現金流量才能確保資金的及時回籠，保證各項正常開支，這需要充分發揮醫院財務結算中心的功能，確保資金運用權力的高度集中。