但是，從總體來看，由於受到票據市場發展的影響，我國的再貼現業務發展的速度仍然較慢，再加上再貼現利率水平較高的狀況一定程度上也抑製了商業銀行機構從央行融資的需求，2008年人民銀行辦理再貼現業務僅為109.7億元，不足當年我國貨幣市場交易規模的萬分之一，使再貼現政策工具在我國人民銀行貨幣政策調控中的作用效果甚微。
三、公開市場業務
我國的公開市場業務是從國內外彙公開市場業務起步的。從1994年1月1日起，我國對外彙體製進行了改革，實行了結售彙製度，建立了銀行間外彙市場，並實現了人民幣彙率並軌，在此基礎上，我國中央銀行於1994年在外彙市場開始了公開市場操作。1996年4月9日，中國人民銀行又開始了以國債為操作工具的公開市場業務。由於受金融環境、市場條件和交易工具的限製，1997年停辦。
1998年5月又恢複公開市場操作，中國人民銀行在貨幣市場上的公開市場業務力度不斷加大。為了保證操作業務的規範進行，中國人民銀行采取了一些具體措施：一是製定《公開市場業務債券交易操作規程》，明確了債券交易操作事項的請示及指令下達的程序，完善了內控製度；二是製定公開市場業務交易方案，對債券交易的對象、工具、方式、品種、規則及債券交割和資金清算等事項作了明確規定；三是增加了交易品種，以滿足業務發展的需要。中國人民銀行不僅增加了國債和政策金融債券的現券買賣品種，還進一步豐富了回購期限品種，取得了良好的效果。
此外，中國人民銀行還定期向全國銀行間同業拆借成員發布公開市場業務信息公告，公布債券交易價格的信息；倡導和鼓勵一級交易商在銀行間同業市場代理中小機構融通資金；貨幣市場利率（尤其是債券回購利率）對商業銀行流動性狀況和人民銀行貨幣政策操作的靈敏度越來越強。1998年、1999年兩年通過公開市場擴大基礎貨幣投放累計2600多億元，2000年全年基礎貨幣投放的52%是通過公開市場操作實現的。2000年公開市場操作回購交易中7天和14天利率的變動基本上可以反映中央銀行對利率的調控意圖。根據貨幣政策需要，隨著公開市場利率逐月下調，年末略有回升的調整，同業拆借和債券回購的利率也成同方向變化，因此該利率逐漸成為中央銀行調控的重要政策目標。
2004年，中國人民銀行為了更好地提升公開市場操作效率，對其中的操作技術又進行改進和創新：這包括有增加操作頻率、調整央行票據交易時間（即將央行票據的交易流通時間由發行日後第二日（T+2）調整為次日（T+1））並對公開市場業務係統進行了升級改造，開始以DVP方式進行債券、資金清算，大大提高了清算的安全性和時效性。
此外中國人民銀行還適時開發新的操作品種，2004年12月開始發行三年期央行票據並於年底開始發行1年期央行票據，進一步豐富了中國人民銀行公開市場操作的方式和交易工具。
我國公開市場業務作為一種新的貨幣政策工具，越來越體現出它的主動性、靈活性和時效性的特點，對調整中央銀行基礎貨幣供應，擴大貨幣供給量發揮了重要作用，並初步形成了通過公開市場業務進行貨幣政策傳導的機製。