財務報表分析的方法，有比較分析法和因素分析法2種。
1.比較分析法
比較分析：對兩個或幾個有關的可比數據進行對比，揭示差異和矛盾。比較是分析的最基本方法，沒有比較，分析就無法開始。
比較分析的具體方法種類繁多。
（1）按比較對象分類（和誰比）。
①與本企業曆史比，即不同時期（2～10年）指標相比，也稱“趨勢分析”。
②與同類企業比，即與行業平均數或競爭對手比較，也稱“橫向比較”。
③與計劃預算比，即實際執行結果與計劃指標比較，也稱“差異分析”。
（2）按比較內容分類（比什麼）。
①比較會計要素的總量。
總量是指報表項目的總金額，例如總資產、淨資產、淨利潤等。總量比較主要用於時間序列分析，如研究利潤的逐年變化趨勢，看其增長潛力。有時也用於同業對比，看企業的相對規模和競爭地位。
②比較結構百分比。
把利潤表、資產負債表、現金流量表轉換成結構百分比報表。例如以收入為100%，看損益表各項目的比重。結構百分比報表用於發現有顯著問題的項目，揭示進一步分析的方向。
③比較財務比率。
財務比率是各會計要素的相互關係，反映其內在聯係。比率的比較是最重要的分析。它們是相對數，排除了規模的影響，使不同比較對象建立起可比性。財務比率的計算是比較簡單的，但對它加以說明和解釋是相當複雜和困難的。
分析的核心問題在於解釋原因，並不斷深化，尋找最直接的原因。財務報表分析是個研究過程，分析得越具體、越深入，則水平越高。如果僅僅是計算出財務比率而不進行分析，什麼問題也說明不了。
2.因素分析法
因素分析，是依據分析指標和影響因素的關係，從數量上確定各因素對指標的影響程序。
企業的活動是一個有機整體，每個指標的高低，都受若幹因素的影響。從數量上測定各因素的影響程度，可以幫助人們抓住主要矛盾，或更有說服力地評價經營狀況。
因素分析的方法具體又分為：
（1）差額分析法。
例如固定資產淨值增加的原因分析，可分解為原值變化和折舊變化兩部分。
（2）指標分解法。
例如資產利潤率，可分解為資產周轉率和銷售利潤率的乘積。
（3）連環替代法。
依次用分析值替代標準值，測定各因素對財務指標的影響。例如影響成本降低的因素分析。
（4）定基替代法。
分別用分析值替代標準值，測定各因素對財務指標的影響，例如標準成本的差異分析。
在實際的分析中，各種方法是結合使用的。