企業自由現金流量=（息前稅前利潤-所得稅+折舊與攤銷）-（資本支出+營運資本增加）
股東自由現金流量=企業自由現金流量-債權人自由現金流量=（息前稅前利潤-所得稅+折舊與攤銷）-（資本支出+營運資本增加）-（清償的債務及利息-發行的新債）
這裏有一點需要強調，就是關於總投資的內涵，科普蘭與科勒曾指出“它未納入任何與籌資有關的現金流量，如利息費用或股息……”。在現代企業評價時，強調企業現金流量應該是經營賺取的現金，而不包括與金融資產和金融負債有關的利息帶來的現金。按照這一思想，企業增加的營運資本由原來的流動資產減去流動負債，演變為經營流動資產（包括經營現金、應收賬款、存貨等經營資產，不包括非經營現金、銀行存款、交易性金融資產、可供出售金融資產等能產生利息的流動資產項目）減去經營流動負債（包括各類不需支付利息的短期負債，不包括短期借款、交易性金融負債等流動負債項目），資本支出也由原來的購置各類長期資產支出演變為要扣除無息長期負債。於是產生新的模型：企業自由現金流量=（息前稅前利潤-所得稅+折舊與攤銷）-（資本支出+經營營運資本增加）。
新模型表明計算企業價值與考慮代理成本時的自由現金流量有所不同，也就是價值評估隻考慮純粹經營帶來的流量，而代理成本中的流量還要考慮金融活動帶來的流量，因為金融活動帶來的流量同樣是利用股東資源，結果歸屬於股東所有。新模型下的企業價值等於企業各發展階段自由現金流量折現後的總和。簡化模型：
企業價值=各期企業自由現金流量/（加權平均資本成本-永續增長率）
從模型可以看出，管理者為了實現企業與股東利益最大化，應該首先保證將資金投資於收益大於資本成本的項目，取得正的淨現值投資價值，核心是最大化地獲取自由現金流量，以實現企業價值最大化。這裏，模型考慮了有利投資優先以獲取價值，然後更大限度通過獲取經營利潤以增加自由現金流量，實現價值提升。
三、自由現金流量的另一個評價——存量降低效率
從財務管理角度，企業管理者保有一定數量的自由現金即形成一定的自由現金存量對企業是有利的，可以減少財務風險（債務違約）並改善債權債務關係，增加生產與投資及股利分配的回旋餘地，增強籌資能力，減少貨幣資金在投資之外的機會損失，降低現金取得成本等。
但自由現金流量是雙刃劍。按詹森的定義，自由現金流量留在企業是不會創造價值的（財務報表中的流動資產不創造價值），應該將其分配給股東，但管理者出於自身控製資源利益而不願這麼做。企業保留過量自由現金流量時，經營者和股東就產生利益衝突，代理成本形成。
代理成本具體到自由現金流量，管理者更願意利用自己在企業中的優勢形成存量自由現金，並將存量自由現金用於自認為有利的地方。比如未經股東許可而僅為自己的身價業績等利益進行投資收購，利用信息優勢私自提高自身費用支出數量和標準，也有可能因為自己的喜好將資金閑置等。種種自利行為使得管理費用上升、營運資金運營效率下降，限製了企業績效的提高。控製失效導致自由現金流量產生代理成本，從而為公司治理增加了阻力和障礙，存量自由現金流量產生副作用。
其實，自由現金流量運用到企業價值評估領域為企業增值，隱含這樣一個假設：管理者在完成正的淨現值投資前提下充分實現自由現金流量最大化，更關鍵的是管理者能從股東利益出發，將賺取的自由現金流量用於以後的再投資或者在沒有好的投資機會時發放給股東。詹森也認為，首先，存在正的自由現金流量的企業，如果沒有淨現值大於零的項目，即缺乏成長性時，就應該把剩餘的現金通過股票回購或現金分紅的方式返還給股東，否則就容易由富餘的現金資源引發股東和公司管理者之間的代理成本，降低企業的效率。其次，詹森就公司在充裕自由現金流量的情況下凸顯的代理問題，提出了兩種依靠外部力量解決的辦法：負債和被並購威脅，這也是詹森自由現金流量理論的兩個重要推論。