他稱帝不過三月，因焦慮過重，肝火過盛，突然中風。其太醫百般調治，終不見效，臨死之際，授意心腹大臣，傳來隨軍出征的陳圓圓及吳應麟，托付後事。
他終於還是決定宣布退位，改稱周王，複降大秦，上表請罪。委以陳圓圓以周王妃代行王事，節製各部，息兵罷戰。又派出使臣，又公告天下，再度臣服。
他做了三個來月皇帝，每日裏都是覺覺睡不著、飯飯吃不香，深感這皇帝大位不是誰都可以做的，整日裏如臨深淵、如履薄冰、戰戰兢兢、擔驚受怕，一點都不好玩。以至於到後來落得個全家不保、一並玩完。
所以，他緊急委以陳圓圓大權，是寄希望大秦皇帝看在思沅的情份上，或許能保住吳家香火延綿。他留在成都的家眷，已被郭雲龍等殺了個幹淨，自己兒子孫子中，僥幸脫逃的，又唯恐大秦秋後算賬，要保得吳家香火，他也隻能奢望陳圓圓這一支了。吳三桂清楚，陳圓圓皇親國戚，大秦皇帝又宅心仁厚、胸襟似海。甚至他也知道，陳沅和皇帝之間，據坊間傳聞，有那麼一些風言風語。所以他心存僥幸，如若皇帝顧念舊情，則圓圓所生吳應麟及小兒，性命或許可保無虞……。
安排完後事，吳三桂當夜就昏迷不醒，淩晨時分，終於溘然長逝、撒手人寰，時年五十有三。
要說起來，吳三桂這回總算是做對了。易銘得知他臨終退位、上表臣服，且自請降罪處置，又附簽名私信，托要害之人，呈於易銘堂前。易銘拆開看過，見三桂懊惱悔恨之情、痛心疾首之狀，泣血相告。末了，話題一轉，居然恬不知恥，告起饒來，懇求易銘感念他往昔功勳，法外容情，對他吳氏一門，赦免一二。
易銘看了，罵其厚顏無恥之餘，總還動了惻隱之心。加之這日天氣好、心情好，心中大患，得以化為無形，於是宣進眾臣，大殿公議。
易銘極力為吳三桂開脫，所以力排眾議，說三桂其人本來良善，一時糊塗、犯上作亂，並非其初衷，乃鬼魅奸邪，迷了心竅。好在迷途知返、尤為可貴，鑒於他曾經為大秦立下過汗馬功勞，所以將功折過、不予深究。眾臣聽了，大感意外，皇帝竟然對待吳三桂如此仁義，可謂曠古奇聞。不過見皇帝本人都這樣說，其餘臣屬閣僚，再也不好多說什麼，畢竟人家連襟一場，相當於親戚之間互撕，一架打了，然後握手言和。
易銘擺平了秦任、方以智、範曠等頑固派，即下旨免了吳三桂大罪，允其以侯禮安葬，對其幸存後代，一律予以特赦。凡追隨他造反的大臣、武將，大多均撤職了事，少數幾個頑固分子，如馬寶、胡國柱等，著有司審訊，後來判了個十年八年的徒刑。而中下級軍官、普通士卒，既不恩賞，又不責罰，一律無罪，對其百萬大軍，大部裁撤，轉入地方安置。
而方光琛此人，慣於見風使舵，如牆頭蘆葦兩邊倒，易銘不喜歡，隻是這廝為平定吳三桂，又立新功，連坊間都說吳三桂“成也方獻廷，敗也方獻廷”，足見方光琛叛變，對吳三桂打擊有多大，因此不嘉獎又不行，這讓易銘很是為難。好在其人在琦玉主政時，為官多有貪腐，易銘就抓住這等事兒不放，後來韓知禮建議來個功過相抵，既不獎賞，又不處罰，還是保留了他“徽南侯”爵位，又安排了個閑置了事。
而郭雲龍、楊坤等有功之臣，則大加賞賜，提拔重用，也是自然。易銘提任郭雲龍為四川宗政軍負責人，而楊坤則調任雲南之首，沈實根主政貴州，楊承藩為副，兼管黔北。這一番定奪完畢，眾臣莫不歎服，大殿之內，山呼萬歲。
大秦皇帝寬仁處置吳三桂造反一事，消息傳諸四海，敵我莫不稱讚，又深得萬民衷心擁護。韓知禮等，皆感其英明，於是內心折服。
吳三桂此番造反，起初鬧得轟轟烈烈，不料很快慘淡收場，世人對其所作所為，無不唾棄。大秦上下，也於此事件中得到深刻教訓。
一時之間，易銘聲望達到極致，朝鮮李淏，親自前來朝賀，東瀛德川家族，也遣使前來締結友好。更有大英帝國之克倫威爾、哈布斯堡王朝皇帝、奧斯曼帝國穆罕默德本易卜拉欣本艾哈邁德四世，都不遠萬裏，派人前來。
易銘悉數接見，後來議定與以上各國，建立大使級外交關係，互設使館，又簽訂通商之條約，推進海上之貿易。
易銘還安排韓知禮再派使節前往著手歐洲，與哈布斯堡王朝商議在西班牙、新格林納達、秘魯、拉普拉塔等總督區設立領事館事宜，建議與哈布斯堡王朝共同開發美洲。
大秦還與羅斯簽訂邊界協定，東線蔥嶺以南、西線巴爾喀什以東、中線蒙古傳統界線以南，都是大秦領土。易銘還遣使東南亞，與蘇祿、馬來亞、印尼、緬甸、錫蘭等，廣泛建立聯係。
在內政上，易銘建立完善了宗政軍三司體製，彼此分開、互不統屬，一切權力歸於皇帝，稱作君主立憲。
他正式改任秦任為宗務總長，朱信、顧炎武、黃宗羲等為副；韓知禮為政務首輔大臣，許鐸、何晏、呂複、施道、張開及方以智、範曠等為副；韓知禮兼任大秦軍隊參謀總長，雲中飛、楊明義、李馬丁、蘇飛虎、郭雲龍、李過、陳步明、褚正烈、蔣赤信、鄭成功、楊承藩等為副。他還任命夏荷為大內總管，署理內廷事務。等等等等！
他將這些俗務忙完，不覺又兩三月過去，感覺波卡洪塔斯準備得差不多了，於是他計劃著，決定告別眼下的世界，再作一次穿越。
他臨行之前，感覺還有幾件事情放心不下，其中有關於陳圓圓的，有關於幻生、如意的，更多的則是對離開後，如何對大秦諸事有個交代。因為他不希望自己走後，這裏又出現頭一次那種情況。
他這次並不想帶走韓知禮、楊明義等，想了再三，決定這一回不帶上任何人。至於這一次的目的地，易銘定在了四年前，也就是他和韓知禮等人離開的時候。
之所以有這種考慮，源於易銘以為，既然眼下的世界帶給自己那麼多的痛苦，而這種現狀他無法全部挽回和改變，隻有讓這分岔的平行宇宙自己演變下去，至於將來的結果如何，他無法預料，他也管不了這麼多了。
因此，他要回到當初離開的地方，再次介入到大秦立國之初。在那個年代，吳琦玉還未生亂，吳三桂也忠誠王事，吳能奇、錢虎乙正是為大秦大展才華的時候。而更重要的，在那個年代裏有怡晴、有思沅，他是那麼急切想見到怡晴，和她說話，逗她開心，享受和她在一起愜意的日子，甚至將來條件成熟了，易銘會告訴她這一切的真相。
易銘也無法想象，沒有怡晴的世界會是什麼樣子？起碼他會以為，他的生命就會黯淡無光，一切就變得毫無意義。至於思沅，雖然未曾有刻骨銘心的愛情，但有她的世界無比美好，即使易銘活在幻想中，哪怕思沅對易銘不理不睬，隻要能見著她美麗的模樣，就哪怕是生氣的模樣，同樣讓易銘感到欣慰。
易銘輾轉反側數晚失眠，對於下一步的打算，心裏盤算清楚了，他作好了告別的心理準備。