由此可知，中醫看重的是器官的功能，而並非是實體。
如果我們把中醫藏象看成是模型的話，那麼西醫髒器就是原型。藏象模型是對髒器原型的模擬，因此，藏象就不可能和髒器實體是同一個概念。
在我國，很早的時候就產生了一種注重動態功能、輕視實體結構的思維偏向。在醫療實踐的過程中發現，盡管有些髒器在形狀、結構上並沒有什麼聯係，但是卻擁有相同的功能或性質，於是便把這些髒器歸為一類。如心髒和脈搏都會跳動，而舌頭和麵色的不同情況又都能夠反映出我們心的情況，因此就把這些髒器歸為一類。
由於最遲在西周末年的時候，陰陽、五行、八卦這一類的“模型”就已經大體形成了，因此在對髒器進行歸類的時候，也就不自覺地使用了這些“模型”。在中醫的藏象理論構建中，如原先的髒器“原型”和這個功能模型出現了不相符的情況，那麼就寧願去更改“原型”來適應這個思維模型。例如“左肝右肺”的說法，從實際的髒器位置來說，應該是右肝，但是從功能上來看，肝主的是升、而肺主的是降，更為重要的是，在後天八卦中，在左邊的是木、在右邊的則是金，因此為了適應這個模型，就提出了“左肝右肺”的說法。
這種以五行整體劃分的方式，和《易經》中的以八卦來劃分世界的方式是相同的。同時，功能特征和動態聯係都是它們的分類原則的依據。另外，它把擁有相同行為方式、相同動態或靜態屬性、相同功能以及能夠相互感應的事物歸為一類的歸類方式，很好地體現出了“天人相應”、“天人合一”的整體觀念。
其實，和人類早期對於藏象的認識相比，《黃帝內經》中的藏象學說還是有些不同的。從《尚書》、《呂氏春秋》等早期著作中我們可以發現，它們關於脾屬木、肝屬金、肺屬火、心屬土、腎屬水的說法，是從五髒解剖位置的角度來說的。而《黃帝內經》的作者通過實際地操作發現，這種配應方式和五髒的生理特征不能完全對應起來，於是就從五髒的生理特征的角度出發，提出了另外一種配應方式，那就是肝屬木、肺屬金、心屬火、腎屬水、脾屬土。這也從一定程度上表現了《黃帝內經》注重功能的特點。
在以《黃帝內經》為代表的中醫理論中，使用的是五行學說模式，它把人體分成五大係統，並且和一些自然界的相關事物相聯係，建立起以五髒為核心的一種人體整體功能動態模型，同時以這種模型為依據對整個人體和相關的自然事物進行五行歸類。風從南方來，名曰大弱風，其傷人，內舍於心，外在於脈，其氣主為熱。
風從西南方來，名曰謀風，其傷人，內舍於脾，外在於肌，其氣主為弱。
風從西方來，名曰剛風，其傷人，內舍於肺，外在於皮膚，其氣主為身燥。
風從西北方來，名曰折風，其傷人，內舍於小腸，外在手太陽脈，脈絕則溢，脈閉則結不通，喜暴死。
風從北方來，名曰大剛之風，其傷人，內舍於腎，外在於骨與肩背之膂筋，其氣主為寒。
風從東北方來，名曰凶風，其傷人，內舍於大腸，外在於兩脅腋骨下及肢節。
風從東方來，名曰嬰兒之風，其傷人，內舍於肝，外在於筋紐，其氣主為身濕。
風從東南方來，名曰弱風，其傷人，內舍於胃，外在於肉，其氣主體重。
——《靈樞·九宮八風篇》《靈樞·九宮八風篇》把自然界分成了九個方位（中方不用，實際上就是八方），這也就是後天八卦和河圖洛書中的八方九宮模型，接著，我們把它和八藏相對應。
八卦艮震巽離坤兌乾坎
八方東北東東南南西南西西北北
八藏大腸肝胃心脾肺小腸腎
其實，不管是五藏對應五行還是八藏對應八方，它們都是在象數符號模型規範下所產生的，這種模式充分地體現了中國人象數思維的特征，而在中醫的臨床實踐中，這種模式往往和藏象的生理功能相符合。因此，我們不要看到五藏或八藏的方位和人體解剖的實際位置有所不同就認為這種模式是錯誤的。